More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2611 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  99.09 
 
 		 219 aa  437  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  99.54 
 
 		 219 aa  436  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  92.69 
 
 		 219 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  93.15 
 
 		 219 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  92.69 
 
 		 219 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  92.69 
 
 		 219 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  92.24 
 
 		 219 aa  414  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  94.29 
 
 		 219 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  94.29 
 
 		 219 aa  403  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  94.29 
 
 		 219 aa  403  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  94.29 
 
 		 219 aa  403  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  94.29 
 
 		 219 aa  403  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  94.29 
 
 		 219 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  86.3 
 
 		 219 aa  394  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  85.84 
 
 		 220 aa  388  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  86.18 
 
 		 220 aa  385  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  84.33 
 
 		 221 aa  377  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  80.56 
 
 		 221 aa  365  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  82.65 
 
 		 220 aa  360  8e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  82.65 
 
 		 220 aa  360  8e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  82.65 
 
 		 220 aa  360  8e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  82.19 
 
 		 232 aa  357  5e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  61.27 
 
 		 221 aa  269  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  61.27 
 
 		 221 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  57.34 
 
 		 221 aa  262  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  58.29 
 
 		 220 aa  251  5.000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0244  SNARE associated Golgi protein  57.41 
 
 		 237 aa  251  5.000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.052895  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  51.6 
 
 		 217 aa  250  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  57.34 
 
 		 216 aa  250  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0303  DedA protein  60 
 
 		 222 aa  246  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  56.28 
 
 		 219 aa  239  2e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  54.29 
 
 		 224 aa  236  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  59.49 
 
 		 215 aa  235  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654254 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  55.45 
 
 		 222 aa  234  7e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  51.17 
 
 		 213 aa  233  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  54.88 
 
 		 213 aa  232  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2641  SNARE associated Golgi protein  58.05 
 
 		 226 aa  231  7.000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  53.67 
 
 		 244 aa  230  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0724  DedA family protein  55.66 
 
 		 215 aa  230  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0086  SNARE associated Golgi protein  50.93 
 
 		 216 aa  230  1e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.862215  hitchhiker  0.00916794 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0592  SNARE associated Golgi protein  60.41 
 
 		 215 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  53.49 
 
 		 230 aa  229  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  52.51 
 
 		 222 aa  227  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  52.97 
 
 		 218 aa  227  9e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4994  hypothetical protein  55.66 
 
 		 216 aa  227  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  51.47 
 
 		 218 aa  226  3e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  51.96 
 
 		 218 aa  226  3e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  54.95 
 
 		 216 aa  223  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0540  SNARE associated Golgi protein  58.97 
 
 		 215 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0626  hypothetical protein  54.72 
 
 		 215 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0579  SNARE associated Golgi protein  58.97 
 
 		 215 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.6837  normal  0.582888 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2425  hypothetical protein  55.45 
 
 		 262 aa  218  5e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  54.03 
 
 		 218 aa  216  1e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  52.68 
 
 		 227 aa  216  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  50.71 
 
 		 213 aa  216  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4444  SNARE associated Golgi protein  50 
 
 		 218 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  48.4 
 
 		 219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  47.49 
 
 		 220 aa  213  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0706  SNARE associated Golgi protein-like protein  52.13 
 
 		 213 aa  211  7e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.240923  normal  0.524025 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0895  SNARE associated Golgi protein  51.83 
 
 		 220 aa  211  7.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  49.08 
 
 		 219 aa  211  7.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0980  DedA protein (DSG-1 protein)  51.38 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  45.75 
 
 		 211 aa  209  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  47.39 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3208  DedA protein (DSG-1 protein)  47.47 
 
 		 215 aa  208  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.043821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2907  hypothetical protein  48.65 
 
 		 219 aa  208  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  49.07 
 
 		 212 aa  208  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  47.09 
 
 		 253 aa  207  9e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3305  DedA protein (DSG-1 protein)  46.54 
 
 		 215 aa  205  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25714  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  51.92 
 
 		 214 aa  206  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27115  predicted protein  48.79 
 
 		 252 aa  204  9e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000197052  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  46.98 
 
 		 215 aa  203  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1159  dedA protein  47 
 
 		 214 aa  202  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000684044  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  46.54 
 
 		 214 aa  202  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  48.2 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  46.98 
 
 		 215 aa  203  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2484  SNARE associated Golgi protein  49.33 
 
 		 229 aa  202  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  50.25 
 
 		 237 aa  201  5e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  50.5 
 
 		 245 aa  201  9e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  49.06 
 
 		 227 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  43.64 
 
 		 218 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3296  DedA family membrane protein  47.98 
 
 		 226 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0603316  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2313  dedA family protein  47.98 
 
 		 226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0751  SNARE associated Golgi protein  50.24 
 
 		 223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3933  DedA family transmembrane protein  48 
 
 		 223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  hitchhiker  0.00056893 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2191  DedA family membrane protein  47.98 
 
 		 226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0515  dedA family protein  47.98 
 
 		 226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.557526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1084  dedA family protein  47.98 
 
 		 226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  48.77 
 
 		 213 aa  198  3.9999999999999996e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  49.73 
 
 		 214 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3263  DedA family membrane protein  47.53 
 
 		 242 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666613  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3307  hypothetical protein  47.53 
 
 		 283 aa  198  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.370816  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  45.28 
 
 		 215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  44.81 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0735  SNARE associated Golgi protein  50.91 
 
 		 244 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.633458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3854  DedA family transmembrane protein  50 
 
 		 227 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  42.6 
 
 		 220 aa  194  7e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0282  DedA family transmembrane protein  50.45 
 
 		 244 aa  194  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0766  DedA family transmembrane protein  50.45 
 
 		 244 aa  194  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>