108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2385 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02025  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 
350 aa  723    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1560  Fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 
350 aa  723    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0213016  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2708  fructose-bisphosphate aldolase  96 
 
 
350 aa  704    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0801328  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2233  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 
350 aa  723    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.363747  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2385  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 
350 aa  723    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3568  fructose-bisphosphate aldolase  87.43 
 
 
349 aa  643    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.98044 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1550  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 
350 aa  723    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0967  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 
350 aa  723    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1141  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 
350 aa  723    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0313716  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3076  fructose-bisphosphate aldolase  100 
 
 
350 aa  723    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014679 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0375  fructose-bisphosphate aldolase  74 
 
 
350 aa  564  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2089  fructose-bisphosphate aldolase  73.14 
 
 
349 aa  535  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.376807 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2101  Fructose-bisphosphate aldolase  67.89 
 
 
360 aa  521  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2944  fructose-bisphosphate aldolase  66.76 
 
 
356 aa  499  1e-140  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1590  fructose-bisphosphate aldolase  66.01 
 
 
360 aa  492  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2804  fructose-bisphosphate aldolase  66.86 
 
 
349 aa  485  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.62182e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0362  Fructose-bisphosphate aldolase  64.84 
 
 
356 aa  486  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.153399  normal  0.102651 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0152  Fructose-bisphosphate aldolase  66 
 
 
351 aa  486  1e-136  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2134  fructose-bisphosphate aldolase  65.63 
 
 
355 aa  481  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.921388  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2437  fructose-bisphosphate aldolase  63.74 
 
 
359 aa  480  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2203  fructose-bisphosphate aldolase  61.93 
 
 
357 aa  474  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000255438 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4002  fructose-bisphosphate aldolase  62.89 
 
 
360 aa  471  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0515289 
 
 
-
 
NC_002620  TC0487  fructose-bisphosphate aldolase  62.29 
 
 
349 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6036  Fructose-bisphosphate aldolase  62.86 
 
 
356 aa  468  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.601983  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1430  fructose-bisphosphate aldolase  61.03 
 
 
352 aa  460  9.999999999999999e-129  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000563614 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0895  fructose-bisphosphate aldolase  59.48 
 
 
349 aa  437  1e-121  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1112  fructose-bisphosphate aldolase  36.49 
 
 
307 aa  179  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1441  fructose-bisphosphate aldolase  34.01 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.364115  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1344  fructose-bisphosphate aldolase  34.01 
 
 
309 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311517  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2510  fructose-bisphosphate aldolase  34.01 
 
 
309 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.036859  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1359  fructose-bisphosphate aldolase  35.69 
 
 
309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0097  fructose-bisphosphate aldolase  32.32 
 
 
300 aa  161  2e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0380  fructose-bisphosphate aldolase  31.76 
 
 
304 aa  153  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0059  fructose-bisphosphate aldolase  31.65 
 
 
301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1238  fructose-bisphosphate aldolase  31.33 
 
 
299 aa  151  1e-35  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1920  fructose-bisphosphate aldolase  33.33 
 
 
309 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0612637 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1151  fructose-bisphosphate aldolase  33.78 
 
 
309 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.533491  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4045  fructose-bisphosphate aldolase  33.44 
 
 
309 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0742666  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1096  fructose-bisphosphate aldolase  33 
 
 
309 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.692313  normal  0.0212958 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2509  fructose-bisphosphate aldolase  30.98 
 
 
310 aa  145  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0142  fructose-bisphosphate aldolase  32.44 
 
 
318 aa  144  2e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0799  aldolase  26.71 
 
 
307 aa  88.2  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.557643  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2459  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  29.02 
 
 
266 aa  85.5  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1466  aldolase  25.96 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1380  aldolase  26.63 
 
 
308 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1135  aldolase  28.52 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.848952 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0660  aldolase  27.24 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.375252  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0690  aldolase  27.62 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1166  Fructose-bisphosphate aldolase  27.21 
 
 
264 aa  79  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2911  Fructose-bisphosphate aldolase  26.57 
 
 
262 aa  79  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0816099  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1367  aldolase  27.4 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2312  Fructose-bisphosphate aldolase  25.27 
 
 
264 aa  77  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1296  aldolase  25.77 
 
 
308 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.202938  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1259  fructose-bisphosphate aldolase  32.35 
 
 
280 aa  75.5  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000570698  decreased coverage  0.000000000291501 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0380  aldolase  25.55 
 
 
297 aa  74.3  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.153943  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19790  aldolase  26 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.388013  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2983  aldolase  26.78 
 
 
312 aa  73.2  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.321304  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2224  aldolase  25.17 
 
 
304 aa  72.8  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.379771  normal  0.140021 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1304  aldolase  24.66 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0176  aldolase  25.44 
 
 
307 aa  69.3  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.182592 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2663  Fructose-bisphosphate aldolase  28.26 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.177322  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03540  aldolase  24.4 
 
 
313 aa  67  0.0000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0593159 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0114  fructose-bisphosphate aldolase  24.91 
 
 
267 aa  64.7  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0176  aldolase  23.65 
 
 
300 aa  63.9  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3490  fructose-bisphosphate aldolase  24.16 
 
 
267 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1952  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  23.32 
 
 
270 aa  61.6  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1479  aldolase  26.44 
 
 
306 aa  62  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.57412  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1802  aldolase  26.44 
 
 
306 aa  62  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0853  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  26.36 
 
 
265 aa  60.8  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0753  fructose-bisphosphate aldolase  24.2 
 
 
268 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00617024 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2610  fructose-bisphosphate aldolase  24.24 
 
 
260 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1274  fructose-bisphosphate aldolase  24.82 
 
 
263 aa  58.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1302  fructose-bisphosphate aldolase  22.38 
 
 
261 aa  57.8  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295464  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2001  fructose-bisphosphate aldolase  24.42 
 
 
285 aa  57.4  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183812  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1312  fructose-bisphosphate aldolase  23.28 
 
 
268 aa  57.4  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0316  fructose-bisphosphate aldolase  22.54 
 
 
271 aa  56.6  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0917  fructose-bisphosphate aldolase  24.87 
 
 
263 aa  56.2  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0617  fructose-bisphosphate aldolase  26.59 
 
 
267 aa  56.2  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1751  fructose-bisphosphate aldolase  25 
 
 
265 aa  56.2  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3036  fructose-bisphosphate aldolase  25.63 
 
 
268 aa  55.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.152041 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0920  fructose-bisphosphate aldolase  26.16 
 
 
265 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2815  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  24.61 
 
 
267 aa  54.7  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1303  fructose-bisphosphate aldolase  23.58 
 
 
263 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.852372  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1558  fructose-bisphosphate aldolase  23.31 
 
 
260 aa  55.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1557  fructose-bisphosphate aldolase  25.37 
 
 
262 aa  53.1  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2807  fructose-bisphosphate aldolase  23.45 
 
 
268 aa  53.1  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0103202  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3110  Fructose-bisphosphate aldolase  22.95 
 
 
253 aa  52  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2477  fructose-bisphosphate aldolase  24.83 
 
 
266 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0102873  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1178  fructose-bisphosphate aldolase  25.54 
 
 
264 aa  51.2  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.298775  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0600  fructose-bisphosphate aldolase  24.46 
 
 
265 aa  51.2  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0194744  normal  0.0293794 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0890  fructose-bisphosphate aldolase  24.73 
 
 
270 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1586  fructose-bisphosphate aldolase  23.17 
 
 
267 aa  51.2  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0116446  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0201  fructose-bisphosphate aldolase  24.73 
 
 
272 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2070  2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonate synthase  31.9 
 
 
272 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.504916 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1035  fructose-bisphosphate aldolase  22.14 
 
 
257 aa  50.4  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120812  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1648  fructose-bisphosphate aldolase  27.17 
 
 
272 aa  50.1  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00227658  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1710  fructose-bisphosphate aldolase  24.73 
 
 
272 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.547035  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1506  fructose-bisphosphate aldolase  25.81 
 
 
272 aa  49.7  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276432  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4205  2-amino-3,7-dideoxy-D-threo-hept-6-ulosonate synthase  25.3 
 
 
278 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.958913  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3187  fructose-bisphosphate aldolase  22.43 
 
 
267 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.171061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>