56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2380 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_1555  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  99.56 
 
 		 451 aa  889    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3447  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  85.65 
 
 		 457 aa  781    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3449  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  85.65 
 
 		 457 aa  781    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3555  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  85.65 
 
 		 457 aa  781    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02018  galactitol-specific enzyme IIC component of PTS  99.78 
 
 		 451 aa  890    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3518  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  85.65 
 
 		 457 aa  781    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1146  PTS system, galactitol-specific IIC component  99.33 
 
 		 451 aa  889    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0972  PTS system, galactitol-specific IIC component  99.56 
 
 		 451 aa  890    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.487394 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3615  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIC  85.43 
 
 		 457 aa  779    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.772252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3071  PTS system, galactitol-specific IIC component  99.78 
 
 		 451 aa  890    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000414376 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2380  PTS system, galactitol-specific IIC component  100 
 
 		 451 aa  893    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2228  PTS system, galactitol-specific IIC component  99.78 
 
 		 451 aa  890    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.921668  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01984  hypothetical protein  99.78 
 
 		 451 aa  890    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1566  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  99.78 
 
 		 451 aa  890    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00428994  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1142  PTS system, galactitol-specific IIC component  77.7 
 
 		 452 aa  691    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3385  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  62.83 
 
 		 463 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0012361  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0238  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  44.12 
 
 		 419 aa  364  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0232  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  44.12 
 
 		 419 aa  364  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0235  galacitol PTS, EIIC  40 
 
 		 445 aa  352  1e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4825  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIC component  40.32 
 
 		 452 aa  333  3e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3769  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIC component  40.32 
 
 		 452 aa  333  3e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3157  PTS system Galactitol-specific IIC component  39.41 
 
 		 448 aa  330  3e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3720  PTS system Galactitol-specific IIC component  40.53 
 
 		 415 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.260527  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0036  PTS system Galactitol-specific IIC component  41.12 
 
 		 453 aa  327  3e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3992  PTS system, galactitol-specific IIC component  40.18 
 
 		 452 aa  318  9e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal  0.82636 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4113  PTS system galactitol-specific IIC component  40.18 
 
 		 452 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4063  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIC  40.18 
 
 		 452 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal  0.771643 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4008  PTS system, galactitol-specific IIC component  40.18 
 
 		 452 aa  318  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04169  predicted phosphotransferase enzyme IIC component  45.31 
 
 		 437 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3696  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  45.31 
 
 		 437 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04131  hypothetical protein  45.31 
 
 		 437 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4119  PTS system galactitol-specific IIC component  41.62 
 
 		 469 aa  313  5.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00198911  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0034  PTS system Galactitol-specific IIC component  36.85 
 
 		 454 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1728  PTS system transporter subunit IIC  44.85 
 
 		 437 aa  302  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.118537  normal  0.433855 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1728  PTS system transporter subunit IIC  44.85 
 
 		 437 aa  302  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1731  PTS system, IIc component  44.85 
 
 		 437 aa  302  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1547  PTS system, IIc component  44.85 
 
 		 437 aa  302  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1792  PTS system IIc component  44.59 
 
 		 437 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2223  PTS system galactitol-specific IIC component  40.77 
 
 		 469 aa  290  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.756682 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3750  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  36.41 
 
 		 440 aa  278  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0216  PTS system Galactitol-specific IIC component  35.56 
 
 		 421 aa  273  5.000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0152  PTS system Galactitol-specific IIC component  36.91 
 
 		 474 aa  258  1e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0975812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1642  PTS system galactitol-specific IIC component  31.57 
 
 		 456 aa  253  6e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000536368 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3260  galacitol pts, eiic  31.57 
 
 		 456 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0579049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1734  PTS system Galactitol-specific IIC component  35.57 
 
 		 453 aa  243  6e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1647  PTS system galactitol-specific IIC component  33.33 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444163 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3255  PTS system galactitol-specific IIC component  33.08 
 
 		 417 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0413472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0123  PTS system galactitol-specific IIC component  32.28 
 
 		 459 aa  171  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0161618  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1400  PTS system Galactitol-specific IIC component  27.29 
 
 		 440 aa  167  2e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3552  PTS system Galactitol-specific IIC component  25.28 
 
 		 469 aa  147  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1805  PTS system, IIC component, putative  26.81 
 
 		 483 aa  146  6e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1836  galacitol PTS, EIIC  25.27 
 
 		 484 aa  143  7e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000025524  normal  0.329345 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1933  PTS system, IIC component, putative  25.31 
 
 		 482 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.527241  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0497  galactitol PTS, EIIC  24.49 
 
 		 472 aa  120  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000187938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1671  PTS system galactitol-specific IIC component  25.06 
 
 		 470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000013892  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1835  galacitol PTS, EIIC  22.19 
 
 		 438 aa  95.9  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.372507 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>