81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2309 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1639  prevent-host-death family protein  100 
 
 
83 aa  169  9e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0329629  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2156  antitoxin YefM  100 
 
 
83 aa  169  9e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2309  antitoxin YefM  100 
 
 
83 aa  169  9e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.516264  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1214  antitoxin YefM  100 
 
 
83 aa  169  9e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0794  prevent-host-death family protein  55.42 
 
 
83 aa  101  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0247  prevent-host-death family protein  55.42 
 
 
83 aa  101  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4023  prevent-host-death family protein  53.01 
 
 
84 aa  99.8  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4634  prevent-host-death protein  57.83 
 
 
107 aa  99  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374921  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1927  prevent-host-death family protein  53.01 
 
 
83 aa  99  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00504779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2293  prevent-host-death family protein  51.81 
 
 
83 aa  97.1  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0178348 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1845  hypothetical protein  53.01 
 
 
83 aa  96.3  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745967  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1939  prevent-host-death family protein  49.4 
 
 
83 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01350  prevent-host-death family protein  51.81 
 
 
85 aa  94.4  5e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3894  prevent-host-death family protein  49.4 
 
 
88 aa  91.7  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0311  prevent-host-death family protein  53.66 
 
 
84 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16280  Prevent-host-death protein  56.72 
 
 
69 aa  82.8  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5458  prevent-host-death family protein  54.05 
 
 
74 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1402  prevent-host-death family protein  45.78 
 
 
84 aa  80.1  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.333938  normal  0.826973 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3814  putative YefM protein  49.4 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000265887 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0989  prevent-host-death family protein  49.4 
 
 
94 aa  78.2  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0351  prevent-host-death family protein  44.58 
 
 
84 aa  77.4  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1841  prevent-host-death protein  43.9 
 
 
97 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208689  normal  0.186119 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1308  prevent-host-death protein  44.58 
 
 
112 aa  77  0.00000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0028  prevent-host-death protein  44.58 
 
 
86 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0227799  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4120  hypothetical protein  42.17 
 
 
89 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2940  hypothetical protein  45.68 
 
 
94 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1752  prevent-host-death family protein  50 
 
 
121 aa  75.5  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0588193 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1208  prevent-host-death protein  42.17 
 
 
84 aa  75.1  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0975  prevent-host-death protein  43.37 
 
 
85 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0832169  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3905  prevent-host-death family protein  49.4 
 
 
83 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.542624  normal  0.0844002 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0337  prevent-host-death family protein  45.68 
 
 
92 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.703493  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4765  prevent-host-death family protein  46.99 
 
 
86 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0554  antitoxin  44.58 
 
 
83 aa  72  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0694482  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2089  RelB  40.96 
 
 
84 aa  72.4  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.674522  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5409  prevent-host-death family protein  45.78 
 
 
86 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5885  prevent-host-death family protein  49.32 
 
 
94 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3489  prevent-host-death protein  45.78 
 
 
86 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00502392  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5485  prevent-host-death protein  49.32 
 
 
94 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.822453 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4877  prevent-host-death family protein  45.78 
 
 
86 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0844  prevent-host-death protein  47.44 
 
 
86 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0811736 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2555  prevent-host-death protein  46.05 
 
 
85 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.29386  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13393  hypothetical protein  50 
 
 
91 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.046844 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4434  prevent-host-death family protein  39.76 
 
 
83 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.318074  normal  0.388841 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1663  prevent-host-death family protein  49.32 
 
 
92 aa  69.7  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2448  prevent-host-death family protein  40 
 
 
84 aa  67  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1751  prevent-host-death protein  36.14 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0407  prevent-host-death family protein  48.44 
 
 
87 aa  66.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.951779  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2972  prevent-host-death family protein  40.54 
 
 
78 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.297792 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3147  prevent-host-death family protein  40.54 
 
 
78 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5287  prevent-host-death family protein  36.59 
 
 
84 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0662178  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2433  prevent-host-death family protein  44.16 
 
 
83 aa  63.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.137149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2481  prevent-host-death family protein  44.16 
 
 
83 aa  63.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.041466  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3298  hypothetical protein  38.27 
 
 
87 aa  61.6  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0433  prevent-host-death protein  42.67 
 
 
84 aa  61.2  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0390  prevent-host-death family protein  36.14 
 
 
84 aa  60.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01044  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system, StbD family protein  44.78 
 
 
68 aa  60.1  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2531  prevent-host-death family protein  34.57 
 
 
92 aa  59.7  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2432  prevent-host-death family protein  37.5 
 
 
95 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5998  prevent-host-death protein:addiction module toxin, Txe/YoeB  47.06 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14180  prevent-host-death family protein  40.28 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.662389  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2087  prevent-host-death protein  34.18 
 
 
95 aa  55.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000757578  unclonable  0.0000000885843 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6160  Antitoxin of toxin-antitoxin stability system  32.91 
 
 
91 aa  53.9  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1101  prevent-host-death protein  31.58 
 
 
90 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2039  prevent-host-death family protein  35.06 
 
 
95 aa  50.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.274153 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4120  prevent-host-death family protein  38.1 
 
 
72 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4301  prevent-host-death family protein  33.72 
 
 
84 aa  46.2  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0123254  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4160  prevent-host-death family protein  38.1 
 
 
72 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.505447 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1787  prevent-host-death family protein  35.71 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2263  prevent-host-death family protein  39.66 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0869  addiction module antitoxin, Axe family  42.37 
 
 
80 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0994  prevent-host-death family protein  42.37 
 
 
80 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000587691 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3930  Axe family addiction module antitoxin  46.67 
 
 
73 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2009  hypothetical protein  28.57 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0661805  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3828  addiction module antitoxin  46.67 
 
 
73 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.899294  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0238  prevent-host-death family protein  39.34 
 
 
91 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.030686  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0044  prevent-host-death family protein  40.68 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2606  prevent-host-death family protein  33.82 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1066  prevent-host-death family protein  30 
 
 
82 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2645  prevent-host-death family protein  41.82 
 
 
91 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3587  prevent-host-death family protein  37.93 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550844  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11273  hypothetical protein  29.27 
 
 
89 aa  40.8  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00877977  hitchhiker  0.00820754 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>