13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2186 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1695  conserved hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  150  6e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.17131e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1076  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  150  6e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  7.08938e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1231  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  150  6e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  1.37788e-10  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1689  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  150  6e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  5.71816e-08  hitchhiker  0.00193198 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2186  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  150  6e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  9.48052e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2053  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  150  6e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.57846e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2730  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  150  6e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  1.8972e-09  normal  0.616408 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2147  hypothetical protein  92 
 
 
75 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0105691  hitchhiker  0.00485881 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2201  hypothetical protein  92 
 
 
75 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0383227  normal  0.860825 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2143  hypothetical protein  92 
 
 
75 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  9.81103e-06  normal  0.201415 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1135  hypothetical protein  92 
 
 
75 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  2.25892e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1257  hypothetical protein  92 
 
 
75 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0145344  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2544  putative cytoplasmic protein  78.67 
 
 
75 aa  120  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00215484  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>