More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2024 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1390  leucine export protein LeuE  100 
 
 
212 aa  420  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547214  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2024  leucine export protein LeuE  100 
 
 
212 aa  420  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000174933  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01768  neutral amino-acid efflux system  99.53 
 
 
212 aa  420  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2524  leucine export protein LeuE  99.53 
 
 
212 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01756  hypothetical protein  99.53 
 
 
212 aa  420  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1845  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  99.06 
 
 
212 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1835  leucine export protein LeuE  99.06 
 
 
212 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1886  leucine export protein LeuE  99.06 
 
 
212 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1391  leucine export protein LeuE  87.74 
 
 
212 aa  367  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.036985  normal  0.343779 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2092  leucine export protein LeuE  87.74 
 
 
212 aa  367  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0133634  hitchhiker  0.00000159654 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1375  leucine export protein LeuE  87.74 
 
 
212 aa  367  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000252722  hitchhiker  0.0000730997 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1911  leucine export protein LeuE  87.74 
 
 
212 aa  367  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000808789  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1359  leucine export protein LeuE  87.74 
 
 
212 aa  367  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105441  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2293  leucine export protein LeuE  74.06 
 
 
211 aa  291  7e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.993752  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0986  leucine export protein LeuE  62.2 
 
 
225 aa  258  5.0000000000000005e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2918  leucine export protein LeuE  52.13 
 
 
211 aa  220  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.438377 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62920  leucine export protein LeuE  49.52 
 
 
216 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5477  leucine export protein LeuE  49.04 
 
 
216 aa  199  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1168  leucine export protein LeuE  45.75 
 
 
223 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.950564  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0810  leucine export protein LeuE  46.89 
 
 
219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1291  leucine export protein LeuE  46.89 
 
 
219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1262  leucine export protein LeuE  46.15 
 
 
219 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00908947  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4433  leucine export protein LeuE  46.15 
 
 
219 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0518339  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1180  leucine export protein LeuE  44.7 
 
 
223 aa  192  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2029  leucine export protein LeuE  45.67 
 
 
219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2194  leucine export protein LeuE  41.4 
 
 
223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250499  normal  0.121922 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1520  leucine export protein LeuE  42.92 
 
 
220 aa  178  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73556  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2782  leucine export protein LeuE  45.21 
 
 
219 aa  177  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2035  leucine export protein LeuE  42.92 
 
 
224 aa  177  8e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1727  leucine export protein LeuE  42.92 
 
 
224 aa  175  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.859689 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0771  leucine export protein LeuE  46.03 
 
 
220 aa  174  6e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398532  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1609  leucine export protein LeuE  46.03 
 
 
220 aa  174  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0586  leucine export protein LeuE  46.03 
 
 
220 aa  174  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1282  leucine export protein LeuE  46.03 
 
 
220 aa  174  6e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0565  leucine export protein LeuE  46.03 
 
 
220 aa  174  6e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1476  leucine export protein LeuE  46.03 
 
 
220 aa  174  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1506  leucine export protein LeuE  46.03 
 
 
220 aa  174  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1412  leucine export protein LeuE  40.74 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.250602 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2176  leucine export protein LeuE  41.82 
 
 
227 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1371  leucine export protein LeuE  41.31 
 
 
222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0655348  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1914  leucine export protein LeuE  42.86 
 
 
216 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250271  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1018  lysine exporter protein  44.81 
 
 
218 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  0.285378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3114  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.67 
 
 
224 aa  155  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.683402  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2005  leucine export protein LeuE  40.64 
 
 
226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.214703  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1017  lysine exporter protein LysE/YggA  40.47 
 
 
218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000020336  hitchhiker  0.001054 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1324  leucine export protein LeuE  40.55 
 
 
222 aa  152  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0341072  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4188  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  42.38 
 
 
216 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34113  normal  0.0417151 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3181  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.93 
 
 
215 aa  149  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.170342  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1248  amino acid transporter LysE  33.82 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.483142 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1277  lysine exporter protein LysE/YggA  33.82 
 
 
205 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4143  lysine exporter protein LysE/YggA  33.01 
 
 
205 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218888  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4028  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.71 
 
 
209 aa  122  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.180103 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0660  lysine exporter protein LysE/YggA  38.57 
 
 
226 aa  122  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4604  lysine exporter protein LysE/YggA  34.16 
 
 
203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  31.28 
 
 
217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1303  amino acid transporter LysE  32 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.520276  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3385  lysine exporter protein LysE/YggA  30.29 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201071 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4198  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
203 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000025376 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0053  lysine exporter protein LysE/YggA  30.29 
 
 
204 aa  114  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1065  lysine exporter protein LysE/YggA  33.66 
 
 
204 aa  115  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.180582  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  32.04 
 
 
209 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.85 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0028  lysine exporter protein LysE/YggA  31.22 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.214928 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0047  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.22 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.743196  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  28.64 
 
 
217 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.3 
 
 
218 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  28.37 
 
 
215 aa  105  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3282  lysine exporter protein LysE/YggA  32.97 
 
 
210 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.541526 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4807  lysine exporter protein LysE/YggA  31.22 
 
 
210 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0152252  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3360  lysine exporter protein LysE/YggA  31.22 
 
 
210 aa  104  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.742854  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2895  lysine exporter protein LysE/YggA  31.89 
 
 
210 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  28.1 
 
 
218 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5140  lysine exporter protein LysE/YggA  31.22 
 
 
210 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3931  amino acid transporter LysE  25.59 
 
 
213 aa  103  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  25.98 
 
 
210 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0048  lysine exporter protein LysE/YggA  31.71 
 
 
204 aa  102  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4155  lysine exporter protein LysE/YggA  31.22 
 
 
210 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.646483  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  28.64 
 
 
217 aa  102  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  27.62 
 
 
211 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.96 
 
 
209 aa  99.4  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3344  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.89 
 
 
210 aa  99  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240621 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1238  lysine exporter protein LysE/YggA  27.62 
 
 
212 aa  99  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0801686  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0065  lysine exporter protein LysE/YggA  31.86 
 
 
208 aa  99  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.969114 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0038  lysine exporter protein LysE/YggA  25.24 
 
 
211 aa  98.6  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0075  lysine exporter protein LysE/YggA  34.8 
 
 
208 aa  98.6  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0364  lysine exporter protein LysE/YggA  27.55 
 
 
203 aa  97.1  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0047  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.68 
 
 
204 aa  96.7  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.27 
 
 
218 aa  96.3  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1078  lysine exporter protein LysE/YggA  29.33 
 
 
204 aa  96.3  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0743  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.43 
 
 
223 aa  95.5  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3399  lysine exporter protein LysE/YggA  30.58 
 
 
221 aa  95.5  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944216  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3122  lysine exporter protein LysE/YggA  27.96 
 
 
213 aa  95.1  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  27.88 
 
 
210 aa  94.4  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  29.63 
 
 
213 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2169  lysine exporter protein LysE/YggA  29.86 
 
 
227 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  27.88 
 
 
210 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  27.4 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  27.4 
 
 
210 aa  94  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0532  lysine exporter protein LysE/YggA  31.71 
 
 
204 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.101376  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  30.62 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>