85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1962 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2459  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  400  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.984469  normal  0.742679 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1962  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  400  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1900  protein of unknown function DUF886  98.43 
 
 
191 aa  393  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.290117  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01711  hypothetical protein  98.43 
 
 
191 aa  393  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01699  hypothetical protein  98.43 
 
 
191 aa  393  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1985  hypothetical protein  98.43 
 
 
191 aa  393  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.280808  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1824  hypothetical protein  98.43 
 
 
191 aa  393  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1450  hypothetical protein  98.95 
 
 
191 aa  395  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.499518 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1890  hypothetical protein  98.43 
 
 
191 aa  393  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0233049 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1702  hypothetical protein  72.43 
 
 
185 aa  289  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2653  protein of unknown function DUF886  37.78 
 
 
181 aa  134  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0159203  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2080  hypothetical protein  39.67 
 
 
187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1255  protein of unknown function DUF886  38.12 
 
 
182 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2219  hypothetical protein  40.35 
 
 
190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2110  putative cold inducible protein Ves  40.35 
 
 
190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.560471  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2853  hypothetical protein  36.78 
 
 
191 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642703  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2509  hypothetical protein  39.77 
 
 
190 aa  111  8.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000356687 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2714  hypothetical protein  41.61 
 
 
197 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630107  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1036  hypothetical protein  36.69 
 
 
197 aa  102  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.257872 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0163  protein of unknown function DUF886  35.98 
 
 
189 aa  97.8  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0151  hypothetical protein  33.33 
 
 
192 aa  96.3  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3647  hypothetical protein  34.46 
 
 
233 aa  91.7  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2962  hypothetical protein  32.21 
 
 
202 aa  85.5  5e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541543  normal  0.713874 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1294  hypothetical protein  42.2 
 
 
194 aa  84.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.070134  normal  0.0207913 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6926  protein of unknown function DUF886  37.8 
 
 
191 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0684944  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4558  protein of unknown function DUF886  37.29 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.996981  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3760  hypothetical protein  35.43 
 
 
210 aa  81.3  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2588  hypothetical protein  32.22 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.248563 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1823  hypothetical protein  40 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5955  hypothetical protein  40.91 
 
 
190 aa  77.8  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5908  hypothetical protein  41.38 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2186  hypothetical protein  38.57 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.153791  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2169  hypothetical protein  41.38 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3489  protein of unknown function DUF886  32.28 
 
 
191 aa  74.7  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5479  hypothetical protein  37.84 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.898836  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5173  hypothetical protein  32.18 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2208  hypothetical protein  37.33 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1811  hypothetical protein  36.94 
 
 
205 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120207  normal  0.474402 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2085  hypothetical protein  35.33 
 
 
212 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181968  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0325  hypothetical protein  35.96 
 
 
187 aa  71.2  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5931  protein of unknown function DUF886  39.6 
 
 
191 aa  71.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.810198  normal  0.153687 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1533  protein of unknown function DUF886  35 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0430  hypothetical protein  31.79 
 
 
190 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.359855  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2982  hypothetical protein  38.74 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.920883  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0648  hypothetical protein  39.66 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1678  hypothetical protein  39.66 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2720  hypothetical protein  39.66 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2922  hypothetical protein  39.66 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2793  hypothetical protein  39.66 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2363  hypothetical protein  39.66 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.472112  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0359  hypothetical protein  41.24 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2664  hypothetical protein  39.66 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1431  hypothetical protein  37 
 
 
195 aa  68.9  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0365  hypothetical protein  40.21 
 
 
198 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2944  hypothetical protein  33.33 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.690468 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4629  hypothetical protein  37.5 
 
 
181 aa  67  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.355004  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2522  hypothetical protein  40.37 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0835202  normal  0.0112976 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1101  hypothetical protein  34.4 
 
 
217 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0858704  normal  0.979961 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5084  hypothetical protein  33.08 
 
 
190 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.932324  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3164  hypothetical protein  34.26 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4156  hypothetical protein  34.58 
 
 
186 aa  65.1  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.737957  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1400  hypothetical protein  35.19 
 
 
217 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0282645 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5837  hypothetical protein  36.11 
 
 
196 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67410  hypothetical protein  32.86 
 
 
196 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2794  protein of unknown function DUF886  38.74 
 
 
193 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0982  protein of unknown function DUF886  34.58 
 
 
203 aa  63.2  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.429638  normal  0.105211 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2387  protein of unknown function DUF886  37.84 
 
 
192 aa  62  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1335  hypothetical protein  33.64 
 
 
216 aa  62  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.212049  hitchhiker  0.00175338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4908  hypothetical protein  32.8 
 
 
190 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.565857 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0875  hypothetical protein  39 
 
 
207 aa  62  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0933  hypothetical protein  39 
 
 
207 aa  62  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5034  hypothetical protein  32.8 
 
 
190 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2870  hypothetical protein  31.82 
 
 
235 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.290412  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3002  hypothetical protein  31.61 
 
 
176 aa  60.5  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.530397  normal  0.657426 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1388  hypothetical protein  30.33 
 
 
253 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0920868  hitchhiker  0.00023617 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1489  protein of unknown function DUF886  31.06 
 
 
235 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.409079  normal  0.364485 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3016  hypothetical protein  31.06 
 
 
237 aa  59.3  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0248  hypothetical protein  31.18 
 
 
198 aa  58.2  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2887  hypothetical protein  30.3 
 
 
227 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5071  protein of unknown function DUF886  37.96 
 
 
181 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4074  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0164  hypothetical protein  28.48 
 
 
201 aa  52  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3904  hypothetical protein  34.23 
 
 
204 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.664963  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1080  hypothetical protein  28.69 
 
 
194 aa  50.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.62386  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0070  hypothetical protein  28.31 
 
 
195 aa  46.2  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>