39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1609 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1609  putative lipoprotein  100 
 
 
222 aa  461  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2216  conserved hypothetical protein  99.55 
 
 
222 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.90262  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01399  hypothetical protein  99.55 
 
 
222 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2036  putative lipoprotein  99.55 
 
 
222 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000423707  unclonable  9.72589e-25 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1744  putative lipoprotein  99.55 
 
 
222 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000116724  unclonable  1.13256e-21 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2229  hypothetical protein  99.55 
 
 
222 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.675861 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1513  putative lipoprotein  99.55 
 
 
222 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01388  predicted lipoprotein  99.55 
 
 
222 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1721  putative lipoprotein  84.23 
 
 
222 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1785  hypothetical protein  84.23 
 
 
222 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1554  putative lipoprotein  84.23 
 
 
222 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1735  putative lipoprotein  84.23 
 
 
222 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1724  putative lipoprotein  82.88 
 
 
222 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0895113  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1978  putative outer membrane lipoprotein  76.58 
 
 
223 aa  369  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.931993 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3695  hypothetical protein  48.48 
 
 
217 aa  210  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.54497 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2583  hypothetical protein  43.5 
 
 
225 aa  188  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4813  hypothetical protein  49.25 
 
 
223 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.910755  hitchhiker  0.000170141 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20600  hypothetical protein  40 
 
 
224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000461916  normal  0.707445 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2516  hypothetical protein  40.78 
 
 
223 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.518035  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1768  putative lipoprotein  39.52 
 
 
224 aa  171  9e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3047  putative lipoprotein  41.59 
 
 
222 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.566933  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3250  hypothetical protein  37.62 
 
 
223 aa  161  9e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0167  hypothetical protein  41.21 
 
 
220 aa  156  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2569  hypothetical protein  37.5 
 
 
225 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3145  hypothetical protein  36.98 
 
 
273 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2705  hypothetical protein  38.38 
 
 
226 aa  150  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2710  hypothetical protein  36.46 
 
 
225 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6350  putative lipoprotein  32.97 
 
 
230 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.483058 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3873  hypothetical protein  30.66 
 
 
223 aa  97.8  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33730  hypothetical protein  27.09 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0037  hypothetical protein  28.18 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2734  putative lipoprotein  27.95 
 
 
222 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.128638 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0140  putative lipoprotein  27.16 
 
 
226 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1467  hypothetical protein  25.85 
 
 
211 aa  51.6  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0985  putative lipoprotein  28.09 
 
 
229 aa  51.2  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2561  putative lipoprotein  26.24 
 
 
237 aa  48.9  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.45576  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0501  hypothetical protein  20.28 
 
 
218 aa  46.2  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3729  hypothetical protein  27.27 
 
 
219 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3425  putative lipoprotein  26.86 
 
 
231 aa  42.4  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>