16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1453 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1453  hypothetical protein  100 
 
 		 186 aa  391  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000091226  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2824  hypothetical protein  68.65 
 
 		 187 aa  247  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.108057  normal  0.198453 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3544  hypothetical protein  52.76 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  hitchhiker  0.000000000055624 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2914  putative open reading frame  50.92 
 
 		 226 aa  155  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0105726  hitchhiker  0.00000000000553867 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2244  hypothetical protein  57.34 
 
 		 264 aa  155  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0101557  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2915  putative open reading frame  54.61 
 
 		 252 aa  153  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00206178  hitchhiker  0.00000000000536693 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3185  hypothetical protein  58.59 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.121733  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2209  hypothetical protein  60.83 
 
 		 301 aa  148  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.780892  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0676  hypothetical protein  44.92 
 
 		 264 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724654  hitchhiker  0.000000616618 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0653  hypothetical protein  42.61 
 
 		 262 aa  95.5  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0219552  hitchhiker  0.0000163196 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1054  hypothetical protein  44.44 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.250524  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1101  Phage anti-repressor protein  45.45 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1419  Rha family phage regulatory protein  47.83 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000100347  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0837  hypothetical protein  27.12 
 
 		 209 aa  46.2  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0500542  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3692  hypothetical protein  27.1 
 
 		 165 aa  45.4  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2967  hypothetical protein  26.61 
 
 		 278 aa  42.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000420619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>