48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1419 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1419  Rha family phage regulatory protein  100 
 
 
284 aa  593  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  1.00347e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1251  putative phage regulatory protein, Rha family  50 
 
 
282 aa  223  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.24427e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2286  putative antirepressor  54.12 
 
 
380 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.36993  hitchhiker  4.73451e-22 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2510  Rha family phage regulatory protein  50.48 
 
 
207 aa  115  9e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2502  Rha family phage regulatory protein  49.12 
 
 
200 aa  108  9e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526208  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2607  hypothetical protein  51.55 
 
 
172 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113309  normal  0.0343315 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0897  phage regulatory protein, Rha family  51.61 
 
 
167 aa  99.4  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194242  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1059  antirepressor, putative  44.95 
 
 
227 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0737012  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0863  uncharacterized phage-encoded protein  45.45 
 
 
243 aa  91.7  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.18472e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4461  putative antirepressor  44.23 
 
 
276 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0306  Rha family phage regulatory protein  44 
 
 
184 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1974  phage regulatory protein, Rha family  42.42 
 
 
256 aa  84.3  2e-15  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452898  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a011  putative antirepressor, Rha family  41.46 
 
 
194 aa  82.4  8e-15  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1737  phage-encoded protein-like  42.31 
 
 
179 aa  82  9e-15  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2989  phage regulatory protein, Rha family  39.64 
 
 
231 aa  81.3  2e-14  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.347787  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0764  Rha family phage regulatory protein  30.51 
 
 
194 aa  79  8e-14  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1666  phage-encoded protein-like protein  31.07 
 
 
194 aa  78.2  1e-13  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.279039  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0795  Rha family phage regulatory protein  30.51 
 
 
194 aa  78.2  2e-13  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.142717 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3314  phage-encoded protein-like  34.33 
 
 
242 aa  77.4  3e-13  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1731  phage-encoded protein-like  52.11 
 
 
165 aa  76.6  4e-13  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2806  rha protein, phage phi-80  54.41 
 
 
72 aa  76.6  4e-13  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.022492  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2343  hypothetical protein  39.05 
 
 
311 aa  73.9  3e-12  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.259786  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2799  phage-encoded protein-like  39.42 
 
 
204 aa  72.4  8e-12  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.181279  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3107  putative CI repressor  43.24 
 
 
183 aa  72.4  8e-12  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.505611  normal  0.201687 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3131  phage-encoded protein-like protein  47.83 
 
 
91 aa  71.2  2e-11  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0841  Cpp32  36.59 
 
 
188 aa  70.9  2e-11  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000551313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1505  antirepressor  36.96 
 
 
252 aa  70.5  3e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1453  hypothetical protein  47.83 
 
 
186 aa  70.1  4e-11  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  9.1226e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1464  phage anti-repressor protein  41.67 
 
 
232 aa  66.6  5e-10  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  5.21723e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2652  Rha family phage regulatory protein  29.75 
 
 
290 aa  66.6  5e-10  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1382  hypothetical protein  40.26 
 
 
128 aa  64.7  2e-09  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.469514  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0838  Cpp32  35.54 
 
 
245 aa  63.5  4e-09  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00488204  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2645  phage immunity repressor protein  47.22 
 
 
131 aa  61.6  1e-08  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.08991e-11 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0597  phage regulatory protein, Rha family  33.33 
 
 
259 aa  61.6  1e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3543  hypothetical protein  34.65 
 
 
242 aa  58.5  1e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0029  cpp32  34.26 
 
 
188 aa  58.5  1e-07  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3827  hypothetical protein  34.65 
 
 
237 aa  58.2  1e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.691493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0434  hypothetical protein  28.57 
 
 
243 aa  55.1  1e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  4.83628e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0420  hypothetical protein  28.57 
 
 
250 aa  55.1  1e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  3.77873e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3457  antirepressor  31.3 
 
 
236 aa  54.3  2e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  8.36104e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1027  Rha family phage regulatory protein  31.68 
 
 
258 aa  53.9  3e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000867167  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1046  Rha family phage regulatory protein  31.68 
 
 
258 aa  53.9  3e-06  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00498472  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0317  protein ash  33.88 
 
 
110 aa  50.8  2e-05  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.387224 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0047  putative bacteriophage protein  28.8 
 
 
196 aa  50.8  2e-05  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4078  hypothetical protein  35 
 
 
262 aa  50.8  2e-05  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1057  putative bacteriophage protein  28.8 
 
 
196 aa  50.8  2e-05  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3463  Rha family regulatory protein  26.19 
 
 
233 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4007  phage protein  27.14 
 
 
134 aa  42  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>