More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1219 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01094  thymidylate kinase  100 
 
 
213 aa  430  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00390554  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01102  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  430  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00374424  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2503  thymidylate kinase  100 
 
 
213 aa  430  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00403809  unclonable  1.13108e-08 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2226  thymidylate kinase  100 
 
 
213 aa  430  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000221684  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1220  thymidylate kinase  100 
 
 
213 aa  430  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.2141e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1219  thymidylate kinase  100 
 
 
213 aa  430  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  2.91901e-13  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2549  dTMP kinase  100 
 
 
213 aa  430  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.42114e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2029  thymidylate kinase  99.06 
 
 
213 aa  427  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  3.57383e-05  hitchhiker  1.27305e-06 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1477  thymidylate kinase  99.06 
 
 
213 aa  426  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000124035  hitchhiker  9.59374e-10 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1299  thymidylate kinase  90.95 
 
 
213 aa  384  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.160764  hitchhiker  5.73213e-14 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1276  thymidylate kinase  90.95 
 
 
213 aa  384  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.823229  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1986  thymidylate kinase  90.95 
 
 
213 aa  384  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  4.64686e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2169  thymidylate kinase  90.95 
 
 
213 aa  384  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  1.54462e-12 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1314  thymidylate kinase  90.95 
 
 
213 aa  384  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  5.4513e-14 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1613  thymidylate kinase  86.85 
 
 
213 aa  370  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  8.48369e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1583  thymidylate kinase  71.63 
 
 
212 aa  304  6e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.89849e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1691  thymidylate kinase  71.63 
 
 
212 aa  304  7e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0210927  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3493  thymidylate kinase  71.15 
 
 
212 aa  302  3e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  7.1243e-07  normal  0.0320777 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2802  thymidylate kinase  70.33 
 
 
219 aa  300  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2498  thymidylate kinase  75 
 
 
219 aa  299  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00108643  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1911  thymidylate kinase  70 
 
 
212 aa  297  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.50893e-09  hitchhiker  5.71338e-06 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1628  thymidylate kinase  69.57 
 
 
215 aa  292  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  1.25837e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1592  thymidylate kinase  67.77 
 
 
217 aa  288  6e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116501  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1487  thymidylate kinase  64.9 
 
 
210 aa  283  1e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.396843  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2245  thymidylate kinase  61.17 
 
 
210 aa  248  4e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0597865  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003001  thymidylate kinase  58.17 
 
 
209 aa  248  6e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.390558  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1602  thymidylate kinase  59.43 
 
 
212 aa  247  9e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02903  thymidylate kinase  57.69 
 
 
210 aa  244  1e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1094  dTMP kinase  56.4 
 
 
223 aa  231  6e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.43543  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0431  thymidylate kinase  55.45 
 
 
212 aa  228  4e-59  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.19831  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02330  thymidylate kinase  52.38 
 
 
222 aa  225  5e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2117  thymidylate kinase  54.63 
 
 
209 aa  221  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0678723  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2043  thymidylate kinase  55.45 
 
 
208 aa  213  1e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.745773  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2240  thymidylate kinase  54.73 
 
 
215 aa  212  3e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2459  thymidylate kinase  55.67 
 
 
208 aa  211  4e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0022435  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1923  thymidylate kinase  55.15 
 
 
214 aa  211  8e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2302  thymidylate kinase  52.86 
 
 
212 aa  211  8e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792305  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1350  thymidylate kinase  50.97 
 
 
212 aa  211  9e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2452  thymidylate kinase  55.67 
 
 
208 aa  210  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0414256  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2572  thymidylate kinase  55.67 
 
 
208 aa  210  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0232881  normal  0.0771597 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1892  thymidylate kinase  55.67 
 
 
208 aa  210  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243598  normal  0.0455674 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1579  thymidylate kinase  55.05 
 
 
210 aa  209  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2051  thymidylate kinase  53.43 
 
 
215 aa  209  3e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2214  thymidylate kinase  55.15 
 
 
208 aa  207  8e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2613  thymidylate kinase  54.12 
 
 
209 aa  207  9e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1354  thymidylate kinase  50 
 
 
212 aa  207  9e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1661  thymidylate kinase  54.12 
 
 
209 aa  205  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.159329  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1736  thymidylate kinase  54.12 
 
 
209 aa  205  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.603767  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1982  thymidylate kinase  54.55 
 
 
210 aa  205  5e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.102848  hitchhiker  0.00478134 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2648  thymidylate kinase  53.57 
 
 
210 aa  204  7e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.106877 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1766  thymidylate kinase  54.12 
 
 
209 aa  203  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  49.75 
 
 
207 aa  171  8e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  43.54 
 
 
214 aa  167  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  44.39 
 
 
210 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  45.71 
 
 
210 aa  166  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  45.54 
 
 
210 aa  165  6e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  48.98 
 
 
218 aa  164  8e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  44.95 
 
 
217 aa  164  1e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  43.87 
 
 
210 aa  164  1e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  48.73 
 
 
210 aa  163  2e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  48.22 
 
 
210 aa  163  2e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  44.29 
 
 
210 aa  163  2e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  46.04 
 
 
208 aa  159  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  45.27 
 
 
210 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  46.12 
 
 
219 aa  157  8e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  44.5 
 
 
223 aa  157  9e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  44.5 
 
 
223 aa  157  9e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  46.94 
 
 
211 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  45.77 
 
 
212 aa  155  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  45.32 
 
 
208 aa  149  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  41.95 
 
 
205 aa  150  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  41.79 
 
 
207 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  41.26 
 
 
206 aa  149  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  44.88 
 
 
212 aa  148  6e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  44.9 
 
 
206 aa  146  2e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  43.65 
 
 
206 aa  144  9e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  43.65 
 
 
206 aa  144  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  45.96 
 
 
203 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  40.65 
 
 
203 aa  144  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  44.22 
 
 
206 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  45.37 
 
 
215 aa  143  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  42.92 
 
 
244 aa  142  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  43.15 
 
 
206 aa  142  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  43.27 
 
 
206 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  43.27 
 
 
206 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  41.59 
 
 
211 aa  142  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  43.27 
 
 
206 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  42.93 
 
 
206 aa  142  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  43.94 
 
 
204 aa  141  8e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  41.83 
 
 
225 aa  141  9e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  42.03 
 
 
204 aa  140  1e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0925  thymidylate kinase  43 
 
 
222 aa  140  1e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  44.89 
 
 
210 aa  139  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  43.37 
 
 
206 aa  139  4e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  42.21 
 
 
230 aa  139  4e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  43.78 
 
 
200 aa  138  5e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  41.38 
 
 
219 aa  138  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  40.59 
 
 
209 aa  138  7e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  43.72 
 
 
217 aa  137  9e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  40.76 
 
 
216 aa  137  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>