43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1075 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00963  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  431  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  3.16322e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1075  TfoX family protein  100 
 
 
209 aa  431  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  5.5454e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00970  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  431  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  6.88807e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2159  TfoX family protein  100 
 
 
209 aa  431  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.43241e-05  normal  0.451422 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2684  regulator of competence-specific genes  100 
 
 
209 aa  431  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.24441e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2637  regulator of competence-specific genes  99.52 
 
 
209 aa  429  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00582565  hitchhiker  4.82749e-07 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1068  TfoX family protein  99.52 
 
 
209 aa  427  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.44107e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1124  TfoX family protein  99.52 
 
 
209 aa  428  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  9.4765e-05  normal  0.380229 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1113  TfoX family protein  75.88 
 
 
201 aa  325  4e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00655233  hitchhiker  0.000555107 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1181  TfoX family protein  75.88 
 
 
201 aa  325  4e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.249194  normal  0.494674 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1135  TfoX family protein  75.88 
 
 
201 aa  325  4e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0564701  normal  0.981873 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1030  TfoX family protein  75.88 
 
 
201 aa  325  4e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  6.38519e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1147  TfoX family protein  75.88 
 
 
201 aa  325  4e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.303148  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1471  regulator of competence-specific genes  57.71 
 
 
208 aa  243  1e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  1.87987e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2355  TfoX family protein  99.12 
 
 
114 aa  231  4e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000106232  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2696  regulator of competence-specific genes  45.18 
 
 
208 aa  166  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  6.7417e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1211  regulator of competence-specific genes  40.19 
 
 
209 aa  156  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  1.36601e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2856  regulator of competence-specific genes  41.24 
 
 
206 aa  152  3e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  8.63171e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2547  regulator of competence-specific genes  41.24 
 
 
206 aa  150  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000620558  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2539  DNA transformation protein tfoX  44.62 
 
 
211 aa  144  8e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.95264e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3201  hypothetical protein  44.62 
 
 
211 aa  144  8e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  6.4968e-06  hitchhiker  0.00612838 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2628  regulator of competence-specific genes  44.62 
 
 
211 aa  144  8e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  9.28932e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1756  regulator of competence-specific genes  40.51 
 
 
219 aa  140  2e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  5.90312e-06  hitchhiker  2.49336e-05 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003942  DNA transformation protein TfoX  37.5 
 
 
187 aa  109  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01580  hypothetical protein  34.97 
 
 
196 aa  107  9e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1325  hypothetical protein  32.95 
 
 
195 aa  96.3  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0134682  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1982  putative DNA transformation protein TfoX  32.4 
 
 
195 aa  94  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0723  hypothetical protein  29.79 
 
 
202 aa  78.6  6e-14  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02628  hypothetical protein  31.18 
 
 
195 aa  75.1  7e-13  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003753  DNA transformation protein TfoX  27.07 
 
 
195 aa  70.1  2e-11  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1715  DNA transformation protein  26.06 
 
 
238 aa  63.2  3e-09  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  3.35694e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1766  TfoX domain-containing protein  38.96 
 
 
108 aa  57.8  1e-07  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0302  hypothetical protein  37.04 
 
 
84 aa  56.2  4e-07  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.516262  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1480  TfoX domain-containing protein  27.55 
 
 
105 aa  55.1  8e-07  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322278  hitchhiker  0.00610766 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4493  hypothetical protein  30 
 
 
126 aa  50.4  2e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2034  hypothetical protein  33.33 
 
 
91 aa  45.4  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.81797  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1931  TfoX domain protein  33.33 
 
 
84 aa  45.4  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1864  TfoX-like protein  30.56 
 
 
108 aa  44.3  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.726376  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3473  regulator of competence-specific genes  20.94 
 
 
217 aa  43.5  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0090  hypothetical protein  32.86 
 
 
152 aa  43.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4683  TfoX domain-containing protein  26.97 
 
 
92 aa  42  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  2.41401e-13  unclonable  1.50639e-16 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0173  TfoX-like protein  23.47 
 
 
120 aa  41.6  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.301491  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2425  hypothetical protein  22.22 
 
 
114 aa  41.2  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>