35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1072 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00962  SOS cell division inhibitor  100 
 
 
169 aa  348  3e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  2.84477e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00969  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  348  3e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  6.04934e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1122  SOS cell division inhibitor  100 
 
 
169 aa  348  3e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  4.8454e-06  normal  0.770648 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2358  SOS cell division inhibitor  100 
 
 
169 aa  348  3e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  5.03972e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2162  SOS cell division inhibitor  100 
 
 
169 aa  348  3e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.80135e-06  normal  0.227939 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2638  SOS cell division inhibitor  100 
 
 
169 aa  348  3e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  2.42491e-06  unclonable  2.5128e-08 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1072  SOS cell division inhibitor  100 
 
 
169 aa  348  3e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  3.94327e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1067  SOS cell division inhibitor  100 
 
 
169 aa  348  3e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.84459e-19  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2685  cell division inhibitor SulA  100 
 
 
169 aa  348  3e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.62344e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1146  SOS cell division inhibitor  78.11 
 
 
169 aa  246  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0126315  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1112  SOS cell division inhibitor  78.11 
 
 
169 aa  245  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00640021  hitchhiker  0.00133403 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1029  SOS cell division inhibitor  78.11 
 
 
169 aa  245  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  3.36397e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1134  SOS cell division inhibitor  78.11 
 
 
169 aa  245  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0155538  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1180  SOS cell division inhibitor  78.11 
 
 
169 aa  245  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0203461  normal  0.449911 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1470  SOS cell division inhibitor  72.19 
 
 
171 aa  214  3e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  1.94429e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2857  SOS cell division inhibitor  57.83 
 
 
168 aa  160  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  5.46585e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2548  SOS cell division inhibitor  56.52 
 
 
168 aa  155  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00047922  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2629  SOS cell division inhibitor  59.06 
 
 
168 aa  150  9e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  3.71858e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2540  SOS cell division inhibitor  59.06 
 
 
168 aa  150  9e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  5.19438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3200  SOS cell division inhibitor  59.86 
 
 
168 aa  149  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.42239e-08  hitchhiker  0.00343609 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1755  SOS cell division inhibitor  55.03 
 
 
168 aa  150  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.35467e-09  hitchhiker  3.96208e-06 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1210  SOS cell division inhibitor  56.03 
 
 
164 aa  134  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  1.04842e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2697  SOS cell division inhibitor  48.75 
 
 
164 aa  133  1e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  3.88147e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2006  SOS-response cell division inhibitor blocks FtsZ ring formation-like  29.91 
 
 
165 aa  54.7  6e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368936  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1682  cell division inhibitor-related protein, SulA-like protein  28.79 
 
 
158 aa  48.1  5e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292047  normal  0.171923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1658  cell division inhibitor-related protein, SulA-like protein  26.92 
 
 
158 aa  47.8  7e-05  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271985  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3600  SOS-response cell division inhibitor blocks FtsZ ring formation-like protein  28.21 
 
 
158 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00249285  normal  0.513615 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  29.91 
 
 
214 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  29.91 
 
 
214 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3873  SOS cell division inhibitor SulA  28 
 
 
157 aa  42.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.752414  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14500  cell division inhibitor  28.45 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2142  cell division inhibitor-related protein  27.35 
 
 
158 aa  42  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0838821 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3482  hypothetical protein  25.83 
 
 
168 aa  42  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.214908 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25150  hypothetical protein  28 
 
 
161 aa  41.6  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3998  hypothetical protein  26.73 
 
 
182 aa  42  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>