More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0716 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1875  phosphoglucomutase  61.47 
 
 
547 aa  678  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1648  phosphoglucomutase  59.41 
 
 
551 aa  672  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.246099  normal  0.694136 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1934  phosphoglucomutase  61.88 
 
 
546 aa  660  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269944  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0267  phosphoglucomutase  57.82 
 
 
557 aa  640  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0227  phosphoglucomutase  62.34 
 
 
549 aa  701  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4132  phosphoglucomutase  60.52 
 
 
553 aa  662  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2238  phosphoglucomutase  56.2 
 
 
550 aa  637  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000108864  hitchhiker  1.64585e-09 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3234  phosphoglucomutase  59.37 
 
 
553 aa  652  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.784116  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0783  phosphoglucomutase  99.63 
 
 
546 aa  1123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00118232  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0839  phosphoglucomutase  69.41 
 
 
548 aa  805  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4511  phosphoglucomutase  56.02 
 
 
550 aa  638  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0745  phosphoglucomutase  97.44 
 
 
546 aa  1100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.33851e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2225  phosphoglucomutase  56.02 
 
 
550 aa  638  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  3.44179e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1707  phosphoglucomutase  58.56 
 
 
553 aa  662  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1950  phosphoglucomutase  60.36 
 
 
563 aa  688  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5012  phosphoglucomutase  60.89 
 
 
550 aa  660  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0879  phosphoglucomutase  64.05 
 
 
550 aa  733  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0178981  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1728  phosphoglucomutase  58.56 
 
 
553 aa  662  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20751  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2198  phosphoglucomutase  59.63 
 
 
549 aa  678  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225859  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1212  phosphoglucomutase  87.18 
 
 
547 aa  998  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000373193  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2933  phosphoglucomutase  84.8 
 
 
547 aa  973  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00636  hypothetical protein  99.45 
 
 
546 aa  1124  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  3.14178e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1123  phosphoglucomutase  84.25 
 
 
547 aa  971  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0537632  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2031  phosphoglucomutase  57.48 
 
 
550 aa  658  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00697315  hitchhiker  0.000229027 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1944  phosphoglucomutase  57.48 
 
 
550 aa  658  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0370627  hitchhiker  0.00212574 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0131  phosphoglucomutase  59.05 
 
 
549 aa  652  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0744  phosphoglucomutase  58.21 
 
 
550 aa  653  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2134  phosphoglucomutase  57.66 
 
 
550 aa  660  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.40825  decreased coverage  1.49403e-05 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0806  phosphoglucomutase  97.25 
 
 
546 aa  1075  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000341822  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1775  phosphoglucomutase  58.56 
 
 
553 aa  662  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346978  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4406  phosphoglucomutase  61.17 
 
 
561 aa  684  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1701  phosphoglucomutase  59.49 
 
 
549 aa  674  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.231771  normal  0.914305 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1099  phosphoglucomutase  82.78 
 
 
547 aa  952  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.95598e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01345  phosphoglucomutase  71.79 
 
 
548 aa  825  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0735  phosphoglucomutase  99.63 
 
 
546 aa  1125  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.26072e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0716  phosphoglucomutase  100 
 
 
546 aa  1127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  2.2067e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1241  phosphoglucomutase  84.25 
 
 
547 aa  956  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.32571e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2056  phosphoglucomutase  56.39 
 
 
548 aa  658  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.586119  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1699  phosphoglucomutase  59.85 
 
 
551 aa  678  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102368 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2196  phosphoglucomutase  56.02 
 
 
550 aa  635  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000365433  unclonable  5.35585e-06 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0562  phosphoglucomutase  99.63 
 
 
546 aa  1125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  3.33978e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3574  phosphoglucomutase  82.97 
 
 
547 aa  954  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  7.05629e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2971  phosphoglucomutase  59.44 
 
 
545 aa  637  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29263  normal  0.261825 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2336  phosphoglucomutase  58.52 
 
 
545 aa  645  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498491  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1152  phosphoglucomutase  82.78 
 
 
547 aa  952  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00126486  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1780  phosphoglucomutase  62.57 
 
 
547 aa  683  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.331375  normal  0.165496 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1671  phosphoglucomutase  59.74 
 
 
550 aa  676  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573256  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0143  phosphoglucomutase  58.68 
 
 
551 aa  646  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.104299 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1203  phosphoglucomutase  93.77 
 
 
546 aa  1065  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00228618  decreased coverage  4.55474e-05 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1882  phosphoglucomutase  56.57 
 
 
550 aa  642  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00767786  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1681  phosphoglucomutase  70.33 
 
 
548 aa  803  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  4.58453e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2654  phosphoglucomutase  60.18 
 
 
552 aa  685  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2244  phosphoglucomutase  58.55 
 
 
546 aa  637  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1849  phosphoglucomutase  61.88 
 
 
546 aa  663  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.118006  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02553  phosphoglucomutase  59.27 
 
 
550 aa  682  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.246812  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2193  phosphoglucomutase  58.82 
 
 
545 aa  654  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.739749  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0710  phosphoglucomutase  99.27 
 
 
546 aa  1122  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  4.85556e-07  normal  0.414307 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0855  phosphoglucomutase  97.62 
 
 
546 aa  1081  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0156964  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0819  phosphoglucomutase  97.44 
 
 
546 aa  1078  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00834178  normal  0.142423 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0758  phosphoglucomutase  97.25 
 
 
546 aa  1097  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0406624  normal  0.321306 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2159  phosphoglucomutase  59.82 
 
 
547 aa  655  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.260766  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2968  phosphoglucomutase  99.63 
 
 
546 aa  1125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00229066  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5043  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  60.93 
 
 
544 aa  667  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6650  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  63.1 
 
 
545 aa  695  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0760474 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0294  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  60.88 
 
 
548 aa  689  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.638351  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1695  phosphoglucomutase  58.87 
 
 
551 aa  664  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2017  phosphoglucomutase  61.47 
 
 
547 aa  697  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0565501  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3119  phosphoglucomutase  87.36 
 
 
547 aa  998  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000194945  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1330  phosphoglucomutase  58.9 
 
 
546 aa  647  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.66611  normal  0.462296 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3578  phosphoglucomutase  58.82 
 
 
545 aa  654  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3442  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  60.22 
 
 
547 aa  661  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.797951  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004120  phosphoglucomutase  71.43 
 
 
548 aa  822  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  8.29805e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1581  phosphoglucomutase  59.6 
 
 
553 aa  650  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1989  phosphoglucomutase  62.04 
 
 
550 aa  689  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2052  phosphoglucomutase alpha-D-glucose phosphate-specific  62.16 
 
 
547 aa  710  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0812178  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1444  phosphoglucomutase  62.92 
 
 
545 aa  678  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.402303  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5639  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  60.04 
 
 
545 aa  674  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.830487  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0168  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  58.06 
 
 
556 aa  640  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.839456  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2670  phosphoglucomutase  59.52 
 
 
548 aa  650  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.860236  normal  0.232567 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1724  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  59.67 
 
 
546 aa  657  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00010492  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2336  phosphoglucomutase  57.48 
 
 
550 aa  655  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1409  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate- specific  61.68 
 
 
548 aa  687  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.517286  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2029  phosphoglucomutase  61.69 
 
 
546 aa  661  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.744455  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0755  phosphoglucomutase  60.15 
 
 
547 aa  662  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.428968  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2949  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  99.63 
 
 
546 aa  1125  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.23253e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00645  phosphoglucomutase  99.45 
 
 
546 aa  1124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  3.81568e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1254  phosphoglucomutase  65.27 
 
 
546 aa  729  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00445613  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4039  phosphoglucomutase  59.55 
 
 
550 aa  644  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.425514  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07370  phosphoglucomutase  57.66 
 
 
546 aa  634  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1233  phosphoglucomutase  59.37 
 
 
550 aa  664  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  6.42189e-07 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3793  phosphoglucomutase  61.39 
 
 
550 aa  670  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.285914 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1145  phosphoglucomutase  57.61 
 
 
559 aa  632  1e-180  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.328189  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1922  phosphoglucomutase  56.45 
 
 
559 aa  633  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  3.85897e-05 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1915  phosphoglucomutase  56.96 
 
 
547 aa  632  1e-180  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.061293  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2908  phosphoglucomutase  57.3 
 
 
548 aa  634  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.161814 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1706  phosphoglucomutase  57.56 
 
 
560 aa  634  1e-180  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.0681591 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0258  phosphoglucomutase  57.19 
 
 
551 aa  633  1e-180  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0336385  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2146  phosphoglucomutase  56.02 
 
 
550 aa  633  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.39704e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3035  phosphoglucomutase, alpha-D-glucose phosphate-specific  57.12 
 
 
548 aa  630  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0367886  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4438  phosphoglucomutase  58.21 
 
 
564 aa  629  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.293773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>