More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0688 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2967  protein of unknown function UPF0054  100 
 
 
155 aa  318  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.148763  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0688  putative metalloprotease  100 
 
 
155 aa  318  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000843713  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2986  putative metalloprotease  100 
 
 
155 aa  318  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0706  putative metalloprotease  100 
 
 
155 aa  318  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.202381  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0681  putative metalloprotease  99.35 
 
 
155 aa  317  3e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.22934  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00627  hypothetical protein  99.35 
 
 
155 aa  317  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00618  hypothetical protein  99.35 
 
 
155 aa  317  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0588  putative metalloprotease  99.35 
 
 
155 aa  317  3.9999999999999996e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.155181  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0752  putative metalloprotease  99.35 
 
 
155 aa  317  5e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0378397  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  86.36 
 
 
157 aa  283  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  86.36 
 
 
157 aa  283  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  86.36 
 
 
157 aa  283  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  86.36 
 
 
157 aa  283  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  85.71 
 
 
157 aa  281  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1185  putative metalloprotease  89.68 
 
 
155 aa  269  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0573831 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  81.29 
 
 
157 aa  265  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  78.71 
 
 
161 aa  252  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  79.33 
 
 
154 aa  247  4e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  76.77 
 
 
159 aa  247  4e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  76.13 
 
 
161 aa  247  4e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  76.77 
 
 
159 aa  246  6e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2917  putative metalloprotease  77.42 
 
 
157 aa  246  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0141881  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  76.67 
 
 
154 aa  245  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  78 
 
 
154 aa  245  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1832  putative metalloprotease  76.77 
 
 
157 aa  228  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0346  metal-dependent hydrolase  70.78 
 
 
154 aa  227  5e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3007  putative metalloprotease  76.77 
 
 
157 aa  222  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997862  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0994  putative metalloprotease  73.83 
 
 
153 aa  214  5e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0176097  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  61.59 
 
 
154 aa  202  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0064  hypothetical protein  60.67 
 
 
155 aa  201  3e-51  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.50025  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0711  putative metalloprotease  66.21 
 
 
156 aa  200  6e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.655872  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3473  putative metalloprotease  65.52 
 
 
158 aa  200  7e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.162228  normal  0.0246988 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  64.14 
 
 
153 aa  197  6e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2208  hypothetical protein  62.59 
 
 
152 aa  192  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3139  putative metalloprotease  62.25 
 
 
156 aa  192  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653369  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3698  putative metalloprotease  60.14 
 
 
158 aa  191  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.34037  hitchhiker  0.00284102 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  62.76 
 
 
157 aa  185  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2577  putative metalloprotease  65.54 
 
 
153 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0533  hypothetical protein  54.14 
 
 
158 aa  179  8.000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.942887 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2740  hypothetical protein  59.09 
 
 
157 aa  179  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3302  lipoate-protein ligase B  64.79 
 
 
149 aa  176  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1002  putative metalloprotease  65.52 
 
 
153 aa  174  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00904432  normal  0.0928989 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1006  putative metalloprotease  65.52 
 
 
153 aa  174  6e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.406559  normal  0.0650668 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1067  putative metalloprotease  65.52 
 
 
153 aa  173  9e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  0.0221879 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3263  putative metalloprotease  65.52 
 
 
153 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1126  putative metalloprotease  58.94 
 
 
168 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1179  putative metalloprotease  64.14 
 
 
153 aa  169  9e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  52.98 
 
 
155 aa  169  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3305  putative metalloprotease  64.83 
 
 
153 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1104  putative metalloprotease  64.83 
 
 
153 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  55.41 
 
 
154 aa  169  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3441  putative metalloprotease  64.83 
 
 
153 aa  168  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558094 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  58.9 
 
 
162 aa  166  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  53.85 
 
 
158 aa  165  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2857  putative metalloprotease  61.49 
 
 
153 aa  165  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.990205  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12310  putative metalloprotease  58.28 
 
 
160 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2290  metal-dependent hydrolase  59.03 
 
 
149 aa  164  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0475  hypothetical protein  55.19 
 
 
160 aa  161  3e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  53.69 
 
 
154 aa  158  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  54.36 
 
 
166 aa  157  5e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  54.17 
 
 
161 aa  156  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000594068  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1457  hypothetical protein  58.22 
 
 
150 aa  155  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0929764  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00449  putative metalloprotease  54.41 
 
 
137 aa  149  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00790076  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0632  putative metalloprotease  58.9 
 
 
157 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  51.68 
 
 
149 aa  147  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4788  putative metalloprotease  58.22 
 
 
157 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.075672 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3781  putative metalloprotease  56 
 
 
151 aa  147  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.170938 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4806  hypothetical protein  57.53 
 
 
166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4952  putative metalloprotease  59.59 
 
 
164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4664  putative metalloprotease  58.22 
 
 
157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.352382  normal  0.808044 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4347  putative metalloprotease  56.85 
 
 
166 aa  144  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0239  hypothetical protein  50 
 
 
153 aa  143  8.000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4842  putative metalloprotease  62.5 
 
 
157 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1949  putative metalloprotease  45.45 
 
 
161 aa  137  6e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0649  hypothetical protein  45.81 
 
 
149 aa  137  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1884  putative metalloprotease  45.45 
 
 
161 aa  137  6e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0220408  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0451  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  47.79 
 
 
245 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153205  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1496  hypothetical metal-binding protein  47.02 
 
 
152 aa  131  3e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0681  hypothetical protein  47.02 
 
 
152 aa  131  3e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6023  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  47.76 
 
 
258 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207709  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0603  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  45.45 
 
 
237 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0421  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  44.37 
 
 
270 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2723  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  47.01 
 
 
258 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.597285  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2083  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  47.01 
 
 
258 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2695  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  47.01 
 
 
258 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275063  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  52.21 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0406  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  44.37 
 
 
270 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.122176 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2748  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  44.97 
 
 
261 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0125207  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0529  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  44.7 
 
 
255 aa  126  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0265894  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  56.3 
 
 
158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  56.3 
 
 
158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2704  hypothetical protein  45.27 
 
 
147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  43.75 
 
 
168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0867  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  56.3 
 
 
274 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2612  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  44.3 
 
 
261 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.202379  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1395  hypothetical protein  49.57 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1601  hypothetical protein  49.57 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  53.33 
 
 
169 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2137  protein of unknown function UPF0054  48.2 
 
 
171 aa  125  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.171752 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3240  hypothetical protein  43.45 
 
 
149 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>