More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0670 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0670  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  585  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0277429  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  98.57 
 
 
325 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  98.57 
 
 
325 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0607  hypothetical protein  97.13 
 
 
327 aa  557  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0664  hypothetical protein  93.91 
 
 
325 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575154  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  55.16 
 
 
331 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  50.53 
 
 
331 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  50.18 
 
 
331 aa  268  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  50.18 
 
 
331 aa  268  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  44.28 
 
 
831 aa  224  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  43.75 
 
 
684 aa  205  8e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  43.17 
 
 
961 aa  202  7e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  42.91 
 
 
1402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.39 
 
 
380 aa  193  3e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  43.38 
 
 
789 aa  189  4e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  44.96 
 
 
393 aa  188  9e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  42.02 
 
 
557 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  44.54 
 
 
1493 aa  182  7e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  41.24 
 
 
685 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  44.78 
 
 
448 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  39.77 
 
 
305 aa  176  3e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  43.37 
 
 
490 aa  174  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  43.37 
 
 
490 aa  174  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  41.33 
 
 
489 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  40.38 
 
 
425 aa  171  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.62 
 
 
318 aa  165  9e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.04 
 
 
341 aa  163  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  44.9 
 
 
235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.63 
 
 
343 aa  162  5.0000000000000005e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  36.9 
 
 
1032 aa  160  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  40.82 
 
 
416 aa  158  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  38.35 
 
 
976 aa  158  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  36.63 
 
 
1037 aa  157  2e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.03 
 
 
346 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  40.15 
 
 
1877 aa  156  4e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  41.15 
 
 
252 aa  151  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  44.14 
 
 
2413 aa  149  4e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  39.25 
 
 
1002 aa  149  7e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  39.91 
 
 
267 aa  148  8e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  40.09 
 
 
271 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 
1430 aa  145  9e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  36.13 
 
 
482 aa  144  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.06 
 
 
528 aa  143  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  43.28 
 
 
232 aa  143  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  38.37 
 
 
373 aa  142  6e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  41.67 
 
 
256 aa  142  9e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  35.06 
 
 
342 aa  141  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.99 
 
 
316 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  36.63 
 
 
464 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  40.91 
 
 
838 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  36.19 
 
 
373 aa  139  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2836  Sel1 domain-containing protein  36.05 
 
 
380 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.812231  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  36.96 
 
 
358 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  36.33 
 
 
523 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.65 
 
 
392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  35.89 
 
 
505 aa  136  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  39.67 
 
 
359 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  38.26 
 
 
376 aa  134  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  38.26 
 
 
376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  38.06 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  43.2 
 
 
763 aa  133  3e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  42.51 
 
 
303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  38.6 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.83 
 
 
865 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  35.25 
 
 
552 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.46 
 
 
278 aa  130  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1212  hypothetical protein  45.09 
 
 
304 aa  129  7.000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000321675 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  34.42 
 
 
731 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0537  Sel1 repeat-containing protein  34.96 
 
 
680 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.590266 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1053  Sel1-like  31.61 
 
 
679 aa  126  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1198  Sel1 repeat-containing protein  32.57 
 
 
303 aa  125  7e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000520777  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  33.87 
 
 
509 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  40.88 
 
 
255 aa  125  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  33.87 
 
 
509 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  42.86 
 
 
254 aa  124  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  33.87 
 
 
509 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  33.87 
 
 
509 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  40.22 
 
 
185 aa  123  4e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  33.93 
 
 
380 aa  122  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0921  hypothetical protein  35.77 
 
 
1281 aa  122  8e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081521 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  42.77 
 
 
208 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4555  Sel1 domain-containing protein  33.18 
 
 
293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.809469  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0764  hypothetical protein  31.86 
 
 
850 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  38.86 
 
 
245 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  38.81 
 
 
274 aa  116  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0950  hypothetical protein  37.66 
 
 
839 aa  116  5e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2686  hypothetical protein  36.89 
 
 
961 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00825713  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.98 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  34.65 
 
 
971 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  41.56 
 
 
193 aa  113  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2768  Sel1 domain-containing protein  31.99 
 
 
403 aa  113  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.16 
 
 
971 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0874  hypothetical protein  29.58 
 
 
399 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  32.84 
 
 
1200 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  39.05 
 
 
222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5746  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.72 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000252164  normal  0.731688 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  37.89 
 
 
223 aa  110  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2692  enhanced entry protein EnhC  32.84 
 
 
1200 aa  109  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2767  Sel1 domain-containing protein  34.48 
 
 
415 aa  109  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2703  Sel1 domain-containing protein  30.18 
 
 
693 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00296283 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>