More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0486 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00402  nitrogen assimilation regulatory protein for GlnL, GlnE, and AmtB  100 
 
 
112 aa  221  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3159  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
112 aa  221  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0539  nitrogen regulatory protein P-II 2  100 
 
 
112 aa  221  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.843641  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00406  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  221  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3165  nitrogen regulatory protein P-II 2  100 
 
 
112 aa  221  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0494  nitrogen regulatory protein P-II 2  100 
 
 
112 aa  221  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0527  nitrogen regulatory protein P-II 2  100 
 
 
112 aa  221  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0486  nitrogen regulatory protein P-II 2  100 
 
 
112 aa  221  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0377  nitrogen regulatory protein P-II 2  100 
 
 
112 aa  221  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0918  nitrogen regulatory protein P-II 2  97.32 
 
 
112 aa  219  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0522  nitrogen regulatory protein P-II 2  97.32 
 
 
112 aa  216  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.869463  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0512  nitrogen regulatory protein P-II 2  97.32 
 
 
112 aa  216  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0503  nitrogen regulatory protein P-II 2  97.32 
 
 
112 aa  216  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0597213  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0506  nitrogen regulatory protein P-II 2  97.32 
 
 
112 aa  216  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0565  nitrogen regulatory protein P-II 2  97.32 
 
 
112 aa  216  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.941752  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3220  nitrogen regulatory protein P-II 2  94.64 
 
 
112 aa  216  7e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3039  nitrogen regulatory protein P-II 2  94.64 
 
 
112 aa  216  7e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.437205 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1060  nitrogen regulatory protein P-II 2  94.64 
 
 
112 aa  216  7e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3078  nitrogen regulatory protein P-II 2  94.64 
 
 
112 aa  216  7e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2865  nitrogen regulatory protein P-II 2  94.64 
 
 
112 aa  216  7e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3251  nitrogen regulatory protein P-II 2  94.64 
 
 
112 aa  216  7e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.534488  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3057  nitrogen regulatory protein P-II 2  94.64 
 
 
112 aa  216  7e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1109  nitrogen regulatory protein P-II 2  92.86 
 
 
112 aa  214  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0216976  hitchhiker  0.00000214142 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  78.57 
 
 
112 aa  180  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  78.57 
 
 
112 aa  180  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  78.57 
 
 
112 aa  180  7e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
112 aa  174  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2604  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  174  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320307  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  174  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0681  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  173  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.4321 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  75.89 
 
 
112 aa  173  9e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 
112 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  172  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  169  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  169  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000216085  hitchhiker  0.000000791345 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  169  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  168  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  73.87 
 
 
112 aa  167  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  69.64 
 
 
112 aa  167  4e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3395  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  167  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  167  5e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  166  8e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0623  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  166  9e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000846933  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  166  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  166  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  70.54 
 
 
112 aa  166  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 
112 aa  166  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  166  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  71.96 
 
 
112 aa  165  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0879  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  165  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2321  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  165  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286658  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0233  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  165  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2415  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194654  hitchhiker  0.00652052 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5738  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  165  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0271  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  68.75 
 
 
112 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591612  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  165  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1799  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2456  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  165  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2411  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  165  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0181  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.153981  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0163  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.814781 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0742  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0306564  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1243  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  164  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.50478  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0883  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  164  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1090  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  164  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0228645  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1584  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.138814  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3013  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00180505  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1085  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  164  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2271  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3241  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  164  5e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0372  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  68.75 
 
 
112 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2905  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  164  5e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0449  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321853  normal  0.279949 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0277  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  163  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  163  6.9999999999999995e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
121 aa  163  6.9999999999999995e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000114835  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0491  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  163  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0594  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  163  9e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3650  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.107893  hitchhiker  0.000239042 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0797  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.131267  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1304  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.774193  normal  0.209326 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3532  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3362  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0591  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3708  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00803334  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3832  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00851971  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0761  nitrogen regulatory protein P-II 1  68.75 
 
 
112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>