More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0472 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0359  trigger factor  99.54 
 
 
432 aa  858  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.25154e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0903  trigger factor  92.82 
 
 
432 aa  812  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000144682  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3069  trigger factor  85.58 
 
 
434 aa  749  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0128477  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  99.77 
 
 
432 aa  859  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0489  trigger factor  95.37 
 
 
432 aa  830  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  9.5414e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1094  trigger factor  85.12 
 
 
434 aa  752  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  1.23079e-06  hitchhiker  4.34188e-06 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  100 
 
 
432 aa  861  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  2.31464e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0496  trigger factor  95.14 
 
 
432 aa  828  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000142859  hitchhiker  0.000578508 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  99.77 
 
 
432 aa  859  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  2.62738e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2878  trigger factor  83.72 
 
 
434 aa  716  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125506  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3235  trigger factor  86.05 
 
 
434 aa  752  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00052643  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3055  trigger factor  86.05 
 
 
434 aa  752  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  1.66473e-10  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  99.77 
 
 
432 aa  859  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  1.93083e-05  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  99.77 
 
 
432 aa  859  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  7.13029e-09  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0550  trigger factor  95.14 
 
 
432 aa  828  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000374305  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0487  trigger factor  95.37 
 
 
432 aa  830  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  1.82354e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3265  trigger factor  85.35 
 
 
434 aa  735  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108339  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  99.77 
 
 
432 aa  859  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  4.19065e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3093  trigger factor  86.05 
 
 
434 aa  752  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.53037e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0506  trigger factor  95.37 
 
 
432 aa  830  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  6.26608e-06  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1047  trigger factor  85.65 
 
 
434 aa  753  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000149025  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  99.77 
 
 
432 aa  859  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  6.98649e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  99.77 
 
 
432 aa  859  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  2.33962e-08  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1513  trigger factor  70.63 
 
 
433 aa  611  1e-174  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  6.77902e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  69.37 
 
 
435 aa  611  1e-174  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  3.95206e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01416  trigger factor  68.45 
 
 
435 aa  602  1e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0817  trigger factor  66.59 
 
 
432 aa  588  1e-167  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.153407  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  64.12 
 
 
432 aa  581  1e-165  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1223  trigger factor  66.05 
 
 
434 aa  569  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  1.48222e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  63.02 
 
 
434 aa  556  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  7.31467e-06  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1592  trigger factor  64.06 
 
 
434 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  9.81502e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1626  trigger factor  64.06 
 
 
434 aa  554  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  9.59254e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2751  trigger factor  64.06 
 
 
434 aa  554  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.72139e-08  normal  0.125648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1603  trigger factor  64.06 
 
 
434 aa  554  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  7.36756e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1489  trigger factor  63.59 
 
 
434 aa  552  1e-156  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  6.1134e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2496  trigger factor  63.59 
 
 
434 aa  548  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  3.77099e-08  normal  0.020755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2564  trigger factor  63.59 
 
 
434 aa  548  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  6.1517e-06  normal  0.0625081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2662  trigger factor  63.36 
 
 
434 aa  546  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.02256e-07  normal  0.690021 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1793  trigger factor  63.59 
 
 
434 aa  545  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3114  trigger factor  61.63 
 
 
434 aa  543  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  6.17295e-06  decreased coverage  4.21874e-07 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2496  trigger factor  60 
 
 
434 aa  538  1e-152  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  4.60382e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  60.47 
 
 
434 aa  540  1e-152  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.15435e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1540  trigger factor  60.6 
 
 
434 aa  528  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  7.21258e-06  hitchhiker  3.90702e-05 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2597  trigger factor  59.3 
 
 
434 aa  525  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  1.31318e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3137  trigger factor  58.49 
 
 
436 aa  509  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  6.44844e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3786  trigger factor  56.91 
 
 
435 aa  496  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1464  trigger factor  54.17 
 
 
435 aa  481  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1741  trigger factor  51.41 
 
 
437 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00658695 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41250  trigger factor  50.94 
 
 
436 aa  440  1e-122  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.755772 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  50.47 
 
 
436 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3497  trigger factor  50.47 
 
 
436 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0314111  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  50.47 
 
 
436 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1901  trigger factor  51.18 
 
 
437 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191378  hitchhiker  0.00938494 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  52.11 
 
 
434 aa  431  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2299  trigger factor  50.47 
 
 
443 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  50.24 
 
 
436 aa  432  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3470  trigger factor  50.23 
 
 
437 aa  431  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000745697 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3698  trigger factor  49.53 
 
 
436 aa  431  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23550  trigger factor  49.06 
 
 
436 aa  421  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  48.02 
 
 
435 aa  415  1e-115  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1722  trigger factor  50.83 
 
 
441 aa  410  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  0.0869561 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  47.38 
 
 
444 aa  407  1e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  2.66404e-09  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  47.76 
 
 
448 aa  407  1e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  45.69 
 
 
436 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  46.58 
 
 
445 aa  397  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  1.21023e-09  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0266  trigger factor  43.52 
 
 
436 aa  374  1e-102  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2289  trigger factor  43.29 
 
 
450 aa  371  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.030502  normal  0.410432 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2233  trigger factor  43.91 
 
 
447 aa  362  7e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0292986  normal  0.151028 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1940  trigger factor  43.45 
 
 
447 aa  361  2e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0604  trigger factor  41.57 
 
 
436 aa  360  3e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1719  trigger factor  42.96 
 
 
434 aa  355  1e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  41.67 
 
 
437 aa  350  3e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  41.44 
 
 
437 aa  347  3e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1010  trigger factor  40.86 
 
 
448 aa  346  4e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.595556  normal  0.725112 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1176  trigger factor  40.96 
 
 
436 aa  346  5e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1830  trigger factor  40.92 
 
 
443 aa  342  8e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0385  trigger factor  42.09 
 
 
432 aa  341  1e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1905  trigger factor  39.95 
 
 
448 aa  339  7e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205112  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1826  trigger factor  40.46 
 
 
443 aa  338  1e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2296  trigger factor  40.18 
 
 
448 aa  338  1e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343759  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1291  trigger factor  41.84 
 
 
434 aa  336  4e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0308812 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1947  trigger factor  39.5 
 
 
448 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273934  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2324  trigger factor  40.32 
 
 
449 aa  335  9e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0174102  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2482  trigger factor  40.32 
 
 
449 aa  335  9e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1460  trigger factor  41.28 
 
 
436 aa  335  1e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.944672  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1958  trigger factor  40.32 
 
 
449 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3347  trigger factor  40.32 
 
 
449 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.012061  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1233  trigger factor  40.32 
 
 
449 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.026693  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1466  trigger factor  40.32 
 
 
449 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.118979  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2366  trigger factor  40.32 
 
 
449 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1912  trigger factor  39.32 
 
 
448 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.78721  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1842  trigger factor  39.32 
 
 
448 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0231887 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6155  trigger factor  39.05 
 
 
448 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1924  trigger factor  39.05 
 
 
448 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.317146  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2644  trigger factor  40.83 
 
 
436 aa  330  3e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0156375 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1348  trigger factor  39.05 
 
 
448 aa  330  4e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0514517  normal  0.0597463 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5225  trigger factor  39.05 
 
 
448 aa  330  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537858  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1678  trigger factor  39.21 
 
 
432 aa  328  8e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225693  normal  0.123639 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1553  trigger factor  39.45 
 
 
436 aa  328  1e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2545  trigger factor  40.46 
 
 
435 aa  328  1e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0171608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>