More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0369 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00299  lac repressor  99.44 
 
 
360 aa  727  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  1.26874e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00703  hypothetical protein  99.44 
 
 
360 aa  727  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000122917  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00303  hypothetical protein  99.44 
 
 
360 aa  727  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  1.70376e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0418  lac repressor  98.89 
 
 
360 aa  723  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  8.22114e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3280  lac repressor  99.72 
 
 
363 aa  734  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  8.20962e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0369  lac repressor  100 
 
 
363 aa  738  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  3.75664e-12  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3261  transcriptional regulator, LacI family  99.72 
 
 
363 aa  734  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  8.62656e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0376  lac repressor  98.33 
 
 
360 aa  719  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  3.96722e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0409  lac repressor  99.45 
 
 
363 aa  734  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.9973e-20  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10002  Lactose operon repressor  99.44 
 
 
360 aa  727  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  7.92391e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1769  lac repressor  52.68 
 
 
358 aa  385  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.044739  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1363  lac repressor  52.96 
 
 
358 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2732  lac repressor  55.74 
 
 
357 aa  383  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.02392  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0927  lac repressor  54 
 
 
355 aa  363  3e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0196781  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1262  lac repressor  50.99 
 
 
357 aa  332  6e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000349798  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0976  lac repressor  46.04 
 
 
357 aa  286  6e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3358  lac repressor  46.04 
 
 
357 aa  286  6e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1283  lac repressor  43.22 
 
 
357 aa  285  9e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0922  lac repressor  45.73 
 
 
357 aa  284  2e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2013  lac repressor  37.25 
 
 
356 aa  224  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0219  LacI family transcription regulator  36.87 
 
 
351 aa  203  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1918  LacI family transcription regulator  37.01 
 
 
368 aa  203  5e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.04786  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0371  transcriptional regulator, LacI family  37.72 
 
 
339 aa  201  2e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.802173 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3275  transcriptional regulator, LacI family  39.67 
 
 
333 aa  200  4e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.183529  hitchhiker  0.00604574 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0495  transcriptional regulator, LacI family  35.99 
 
 
335 aa  196  4e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.448967  normal  0.778992 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2892  transcriptional regulator, LacI family  35.63 
 
 
340 aa  193  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.207309  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4680  LacI family transcription regulator  35.74 
 
 
336 aa  192  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0406203  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06590  transcriptional regulator, LacI family  35.38 
 
 
359 aa  183  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0870  LacI family transcription regulator  32.51 
 
 
328 aa  179  5e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06900  transcriptional regulator, LacI family  35.35 
 
 
339 aa  179  6e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2947  regulatory protein LacI  36.23 
 
 
359 aa  178  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407921  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6224  HTH-type transcriptional repressor PurR  34.71 
 
 
348 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3042  transcriptional regulator, LacI family  34.13 
 
 
359 aa  177  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0379  LacI family transcription regulator  36.45 
 
 
342 aa  176  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676966  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04300  transcriptional regulator, LacI family  37.13 
 
 
352 aa  175  1e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3665  LacI family transcription regulator  32.54 
 
 
343 aa  174  3e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4084  HTH-type transcriptional repressor PurR  34.64 
 
 
346 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932111  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2577  transcriptional regulator, LacI family  36.06 
 
 
346 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.215831  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1860  transcriptional regulator, LacI family  34.33 
 
 
338 aa  170  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0241  transcriptional regulator, LacI family  32.93 
 
 
348 aa  169  9e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268594  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4716  transcriptional regulator, LacI family  35.74 
 
 
346 aa  166  6e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0100  transcriptional regulator, LacI family  35.57 
 
 
348 aa  164  2e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0658146  normal  0.053402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4705  transcriptional regulator, LacI family  34.54 
 
 
359 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102612  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1925  LacI family transcription regulator  33.73 
 
 
358 aa  163  5e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149363  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11590  transcriptional regulator  31.56 
 
 
362 aa  161  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.042152 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  32.45 
 
 
347 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4997  transcriptional regulator, LacI family  36.58 
 
 
372 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.385337 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  32.24 
 
 
340 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  30.49 
 
 
341 aa  159  7e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29490  transcriptional regulator  34.13 
 
 
340 aa  158  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0512  LacI family transcription regulator  32.15 
 
 
336 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  33.63 
 
 
335 aa  158  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  32.36 
 
 
346 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  33.43 
 
 
338 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  31.44 
 
 
368 aa  157  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.69 
 
 
335 aa  156  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  32.63 
 
 
343 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  32.63 
 
 
343 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  32.63 
 
 
343 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  33.33 
 
 
338 aa  156  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  31.78 
 
 
346 aa  156  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0400  transcriptional regulator, LacI family  35.02 
 
 
346 aa  155  8e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  33.03 
 
 
332 aa  155  9e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4592  LacI family transcription regulator  33.92 
 
 
327 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0768  LacI family transcription regulator  33.53 
 
 
332 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0915061  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  31.58 
 
 
340 aa  154  3e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  32.33 
 
 
343 aa  153  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  30.74 
 
 
334 aa  153  6e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  33.55 
 
 
330 aa  152  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03639  DNA-binding transcriptional repressor of ribose metabolism  33.55 
 
 
330 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00237415  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03584  hypothetical protein  33.55 
 
 
330 aa  152  7e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00148852  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4122  transcriptional repressor RbsR  33.55 
 
 
330 aa  152  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.305602  normal  0.0911869 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  31.61 
 
 
355 aa  152  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  33.55 
 
 
330 aa  152  9e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4241  transcriptional repressor RbsR  33.55 
 
 
330 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  hitchhiker  0.00680444 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4639  transcriptional regulator, LacI family  34.08 
 
 
357 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496087  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  30.03 
 
 
342 aa  152  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  9.20501e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4165  transcriptional repressor RbsR  33.23 
 
 
330 aa  151  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0172446  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06141  hypothetical protein  30.15 
 
 
336 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0276  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 
342 aa  151  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39300  ribose operon repressor RbsR  30.33 
 
 
337 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00488223  normal  0.347554 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  32.53 
 
 
337 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  32.03 
 
 
333 aa  150  4e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1096  LacI family transcription regulator  33.56 
 
 
338 aa  149  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  32.56 
 
 
353 aa  149  6e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000337  ribose operon repressor  30.45 
 
 
340 aa  149  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  32.74 
 
 
339 aa  149  9e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  30.92 
 
 
343 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  30.92 
 
 
343 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  31.14 
 
 
343 aa  149  1e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4098  transcriptional repressor RbsR  32.43 
 
 
332 aa  149  1e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.396512  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  32.04 
 
 
333 aa  148  1e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4113  transcriptional repressor RbsR  32.43 
 
 
332 aa  148  1e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.493547  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.65 
 
 
336 aa  148  1e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4169  transcriptional repressor RbsR  32.13 
 
 
332 aa  148  1e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.451515  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4278  transcriptional repressor RbsR  32.43 
 
 
332 aa  149  1e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134192  normal  0.933942 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  30.72 
 
 
331 aa  149  1e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  31.45 
 
 
337 aa  149  1e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  31.87 
 
 
353 aa  147  2e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  30.45 
 
 
343 aa  148  2e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>