More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0286 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0286  N4/N6-methyltransferase family protein  100 
 
 		 569 aa  1183    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4473  N-6 DNA methylase  61.9 
 
 		 567 aa  697    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.844286 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1809  hypothetical protein  70.11 
 
 		 849 aa  782    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0032  N-6 DNA methylase  61.09 
 
 		 544 aa  704    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.885751  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0483  N-6 DNA methylase  74.04 
 
 		 568 aa  882    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283562  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4240  N-6 DNA methylase  60.76 
 
 		 567 aa  706    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.386659  hitchhiker  0.00142847 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3380  N-6 DNA methylase  76.09 
 
 		 570 aa  900    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368642  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1858  N-6 DNA methylase  52.73 
 
 		 540 aa  587  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0224  Type I restriction-modification system, M subunit  52.11 
 
 		 519 aa  578  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2789  N-6 DNA methylase  52.34 
 
 		 532 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2908  N-6 DNA methylase  51.4 
 
 		 523 aa  567  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1940  N-6 DNA methylase  49.57 
 
 		 535 aa  565  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0625168  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4777  N-6 DNA methylase  51.15 
 
 		 517 aa  561  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.797401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0005  type I restriction-modification system, M subunit  49.91 
 
 		 528 aa  558  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1086  type I restriction-modification system, M subunit  50.79 
 
 		 576 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2418  N-6 DNA methylase  50 
 
 		 525 aa  553  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.572428  normal  0.0719197 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2793  type I restriction-modification system, M subunit  50 
 
 		 525 aa  553  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2453  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  50.62 
 
 		 538 aa  550  1e-155  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.53896  normal  0.845275 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2017  N-6 DNA methylase  50.72 
 
 		 517 aa  543  1e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.54323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2743  type I restriction system adenine methylase  49.91 
 
 		 518 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  50.18 
 
 		 511 aa  540  9.999999999999999e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2248  N-6 DNA methylase  48.58 
 
 		 521 aa  534  1e-150  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0522014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3006  N-6 DNA methylase  48.22 
 
 		 520 aa  531  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.809429  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2509  site-specific DNA-methyltransferase  49.12 
 
 		 540 aa  525  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.642426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7556  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  48.34 
 
 		 544 aa  522  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  48.83 
 
 		 501 aa  522  1e-147  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0039  N-6 DNA methylase  49.19 
 
 		 501 aa  523  1e-147  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  49.73 
 
 		 497 aa  520  1e-146  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3128  N-6 DNA methylase  47.87 
 
 		 518 aa  518  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.465456  decreased coverage  0.00982418 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  48.66 
 
 		 498 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3148  N-6 DNA methylase  48.25 
 
 		 540 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0988  N-6 DNA methylase  47.28 
 
 		 527 aa  508  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1222  N-6 DNA methylase  46.25 
 
 		 519 aa  498  1e-140  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1359  N-6 DNA methylase  46.25 
 
 		 529 aa  499  1e-140  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3080  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  46.86 
 
 		 549 aa  498  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.801077 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3915  N-6 DNA methylase  47.15 
 
 		 541 aa  496  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  45.28 
 
 		 510 aa  498  1e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  46.51 
 
 		 503 aa  494  9.999999999999999e-139  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2909  N4/N6-methyltransferase family protein  46.4 
 
 		 515 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4931  type I restriction-modification system, M subunit  44.37 
 
 		 539 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal  0.593383 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0877  putative type I restriction-modification system, M subunit  44.77 
 
 		 529 aa  489  1e-137  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12769  type I restriction/modification system DNA methylase hsdM  44.85 
 
 		 540 aa  489  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0034  N-6 DNA methylase  44.56 
 
 		 544 aa  491  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1096  N-6 DNA methylase  46.75 
 
 		 543 aa  488  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4006  N-6 DNA methylase  46.67 
 
 		 514 aa  485  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3767  N-6 DNA methylase  44.35 
 
 		 564 aa  486  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1102  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  45.58 
 
 		 548 aa  476  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.358797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1120  type I restriction-modification system specificity subunit  44.37 
 
 		 527 aa  468  9.999999999999999e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3300  N-6 DNA methylase  45.47 
 
 		 537 aa  456  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000500405 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1539  type I restriction-modification system, M subunit  42.88 
 
 		 500 aa  445  1e-123  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154488  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2666  type I restriction-modification system specificity subunit  36.12 
 
 		 508 aa  325  1e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289078  normal  0.157244 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  32.22 
 
 		 510 aa  319  7.999999999999999e-86  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1221  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  34.71 
 
 		 533 aa  298  2e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0065  N4/N6-methyltransferase family protein  63.36 
 
 		 255 aa  292  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0004  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  33.8 
 
 		 517 aa  286  5.999999999999999e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2236  N-6 DNA methylase  32.99 
 
 		 528 aa  281  3e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  33.52 
 
 		 587 aa  268  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  31.59 
 
 		 574 aa  266  5e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  31.78 
 
 		 574 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1303  N-6 DNA methylase  31.62 
 
 		 529 aa  263  8e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  31.4 
 
 		 574 aa  261  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2329  N-6 DNA methylase  31.78 
 
 		 538 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0022  N-6 DNA methylase  33.21 
 
 		 495 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0030  N-6 DNA methylase  33.21 
 
 		 495 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0191758 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  31.49 
 
 		 523 aa  251  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  31.96 
 
 		 814 aa  251  3e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  31.72 
 
 		 495 aa  250  5e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  31.48 
 
 		 508 aa  249  9e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  32.07 
 
 		 808 aa  249  1e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  31.26 
 
 		 633 aa  239  6.999999999999999e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  32.65 
 
 		 505 aa  239  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3498  N-6 DNA methylase  33.74 
 
 		 694 aa  237  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2365  N-6 DNA methylase  29.5 
 
 		 526 aa  237  4e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.725173  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0097  type I restriction-modification system M subunit  30.53 
 
 		 822 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.836051  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  29.43 
 
 		 522 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  29.79 
 
 		 527 aa  234  5e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  30.57 
 
 		 505 aa  232  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2691  N-6 DNA methylase  29.75 
 
 		 523 aa  233  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  31.69 
 
 		 815 aa  231  2e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1712  N-6 DNA methylase  32.5 
 
 		 662 aa  232  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.857909  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  30.6 
 
 		 585 aa  231  3e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  30.1 
 
 		 504 aa  230  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0005  type I restriction-modification system, M subunit, putative  30.13 
 
 		 568 aa  229  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  29.71 
 
 		 526 aa  227  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  29.06 
 
 		 506 aa  225  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  30.32 
 
 		 860 aa  224  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  30 
 
 		 511 aa  217  4e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  30.15 
 
 		 495 aa  216  7e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  30.58 
 
 		 516 aa  214  3.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  29.88 
 
 		 498 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1097  N-6 DNA methylase  30.88 
 
 		 513 aa  212  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0606  type I restriction-modification system subunit M  28.98 
 
 		 523 aa  211  2e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  29.42 
 
 		 501 aa  211  2e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0154  site-specific DNA-methyltransferase, type I modification  50.42 
 
 		 234 aa  210  5e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  29.85 
 
 		 891 aa  209  8e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  31.42 
 
 		 908 aa  208  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4352  N-6 DNA methylase  29.19 
 
 		 565 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  29.66 
 
 		 499 aa  204  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1843  type I restriction-modification system, M subunit  28.01 
 
 		 554 aa  204  5e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0849  N-6 DNA methylase  29.68 
 
 		 492 aa  203  8e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>