105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0182 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00176  periplasmic chaperone  100 
 
 
161 aa  319  1e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  2.32591e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00175  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  319  1e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  4.43159e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0188  periplasmic chaperone  100 
 
 
161 aa  319  1e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.98336e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0171  periplasmic chaperone  100 
 
 
161 aa  319  1e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  3.64139e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0189  periplasmic chaperone  100 
 
 
161 aa  319  1e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  6.7294e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0182  periplasmic chaperone  100 
 
 
161 aa  319  1e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  2.31614e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0180  periplasmic chaperone  100 
 
 
161 aa  319  1e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.80617e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3425  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  100 
 
 
161 aa  319  1e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.42566e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3482  periplasmic chaperone  100 
 
 
161 aa  319  1e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  1.60675e-07  normal  0.0663519 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0263  periplasmic chaperone  90.68 
 
 
161 aa  294  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.4974 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0266  periplasmic chaperone  90.68 
 
 
161 aa  294  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  3.00705e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0247  periplasmic chaperone  90.68 
 
 
161 aa  294  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103395  normal  0.490215 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0247  periplasmic chaperone  90.68 
 
 
161 aa  294  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.414945 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0251  periplasmic chaperone  90.68 
 
 
161 aa  294  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.963542  normal  0.575944 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0716  periplasmic chaperone  85.45 
 
 
164 aa  270  5e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  7.10981e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3156  periplasmic chaperone  65.27 
 
 
165 aa  197  4e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010992  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3781  periplasmic chaperone  65.87 
 
 
176 aa  180  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  3.8296e-09  hitchhiker  0.00155188 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1075  periplasmic chaperone  67.07 
 
 
165 aa  179  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  2.46284e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1022  periplasmic chaperone  67.07 
 
 
165 aa  179  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0216507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3426  periplasmic chaperone  67.07 
 
 
165 aa  179  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  6.98403e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3351  periplasmic chaperone  66.47 
 
 
165 aa  167  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00292396  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0950  periplasmic chaperone  66.47 
 
 
165 aa  166  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  6.3017e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0536  periplasmic chaperone  51.81 
 
 
165 aa  164  6e-40  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.201411  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2971  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  57.64 
 
 
165 aa  146  1e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  6.28638e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2418  outer membrane protein  34.12 
 
 
171 aa  92.8  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002755  outer membrane chaperone Skp (OmpH) precursor  37.65 
 
 
169 aa  92.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01382  outer membrane protein, OmpH family  34.76 
 
 
171 aa  92  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03228  hypothetical protein  37.2 
 
 
166 aa  88.6  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1842  outer membrane protein OmpH  35.29 
 
 
169 aa  85.9  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00348927  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3152  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.72 
 
 
164 aa  81.3  5e-15  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  7.22219e-07  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2806  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.71 
 
 
165 aa  80.5  8e-15  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  1.37224e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2699  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.71 
 
 
165 aa  80.5  8e-15  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  3.09047e-05  hitchhiker  0.00333472 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2632  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.71 
 
 
165 aa  80.5  8e-15  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.0022e-08  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1490  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.5 
 
 
165 aa  80.1  1e-14  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  7.51414e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1454  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.5 
 
 
165 aa  80.1  1e-14  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.67274e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2893  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.5 
 
 
168 aa  80.1  1e-14  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000148222  normal  0.601214 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1459  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.5 
 
 
165 aa  80.1  1e-14  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.99693e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1279  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.79 
 
 
165 aa  80.1  1e-14  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  4.29908e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1638  outer membrane protein OmpH  30.71 
 
 
168 aa  79.3  2e-14  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1357  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.5 
 
 
165 aa  78.6  3e-14  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  5.91306e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1148  outer membrane protein OmpH  30.67 
 
 
168 aa  78.6  3e-14  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  6.04382e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3272  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.28 
 
 
166 aa  79  3e-14  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  3.77724e-05  hitchhiker  0.00131424 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1258  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  34.51 
 
 
171 aa  76.6  1e-13  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.631663  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2626  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.71 
 
 
164 aa  76.6  1e-13  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00178513  normal  0.905788 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2876  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.73 
 
 
165 aa  75.1  4e-13  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.95839e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1562  OmpH family outer membrane protein  31.85 
 
 
172 aa  72  3e-12  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.341865  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0570  hypothetical protein  28.93 
 
 
166 aa  71.2  6e-12  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0546  hypothetical protein  28.93 
 
 
166 aa  71.2  6e-12  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1563  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.37 
 
 
165 aa  70.9  7e-12  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  4.25102e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2967  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.93 
 
 
170 aa  70.9  8e-12  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.939427  normal  0.289934 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1445  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  35 
 
 
172 aa  70.1  1e-11  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1521  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  34.34 
 
 
167 aa  67  1e-10  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.854687 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0817  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  32.5 
 
 
178 aa  64.3  6e-10  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.242751  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1488  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  32.43 
 
 
178 aa  63.9  9e-10  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1767  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.85 
 
 
168 aa  62.8  2e-09  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal  0.0229206 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0794  putative outer membrane protein  29.03 
 
 
167 aa  60.8  8e-09  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.31836 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2446  outer membrane protein OmpH, putative  33.12 
 
 
168 aa  58.9  3e-08  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0885473  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1442  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.85 
 
 
175 aa  56.2  2e-07  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.219895  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2686  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.95 
 
 
168 aa  55.5  3e-07  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327298  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2169  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.19 
 
 
166 aa  55.5  3e-07  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.641637  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1912  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.14 
 
 
175 aa  55.5  3e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.753095  normal  0.41157 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2043  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.14 
 
 
175 aa  55.5  3e-07  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1266  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.67 
 
 
175 aa  53.5  1e-06  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112797  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1168  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  27.1 
 
 
174 aa  53.5  1e-06  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0685935  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1413  hypothetical protein  32.41 
 
 
184 aa  53.1  1e-06  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1751  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30 
 
 
156 aa  53.5  1e-06  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00167678  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1287  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.29 
 
 
183 aa  53.1  2e-06  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.850959  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1351  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.29 
 
 
183 aa  52  3e-06  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0946301  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1444  outer membrane chaperone Skp  30.94 
 
 
177 aa  52.4  3e-06  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0659855  normal  0.0459599 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1997  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.67 
 
 
174 aa  52.4  3e-06  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0999432  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2030  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.74 
 
 
175 aa  52  3e-06  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306412  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6067  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.81 
 
 
165 aa  52  3e-06  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443166  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2010  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.81 
 
 
165 aa  52  3e-06  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5320  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.81 
 
 
165 aa  52  4e-06  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1872  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.94 
 
 
175 aa  51.6  5e-06  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0481618  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1854  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.47 
 
 
176 aa  51.2  6e-06  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1832  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  31.51 
 
 
175 aa  50.8  8e-06  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0624  outer membrane protein  26.67 
 
 
165 aa  50.4  1e-05  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  2.91301e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0725  putative outer membrane chaperone protein Skp  26.67 
 
 
165 aa  50.4  1e-05  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.10627e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1691  Outer membrane protein (OmpH-like)  31.21 
 
 
175 aa  50.4  1e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.84956  normal  0.195364 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1970  putative transmembrane protein  25.76 
 
 
169 aa  49.7  2e-05  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.206116  normal  0.145392 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2446  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  30.13 
 
 
175 aa  49.7  2e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197703  hitchhiker  0.00284352 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1277  Outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.45 
 
 
177 aa  48.1  5e-05  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2573  OmpH/HlpA family outer membrane protein  28.78 
 
 
167 aa  47.8  6e-05  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0450107  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1318  OmpH/HlpA family outer membrane protein  28.78 
 
 
168 aa  47.8  6e-05  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.533964  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3265  OmpH/HlpA family outer membrane protein  28.78 
 
 
177 aa  47.8  6e-05  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197181  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2046  OmpH/HlpA family outer membrane protein  28.78 
 
 
177 aa  47.8  6e-05  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.281485  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1546  OmpH/HlpA family outer membrane protein  28.78 
 
 
177 aa  47.8  6e-05  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4107  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2036  OmpH/HlpA family outer membrane protein  28.78 
 
 
177 aa  47.8  6e-05  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0642632  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2427  outer membrane protein  28.78 
 
 
168 aa  47.8  6e-05  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136881  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2483  outer membrane protein  28.78 
 
 
168 aa  47.8  6e-05  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.453843  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0516  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  24.85 
 
 
175 aa  47.8  7e-05  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.547662 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1329  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.5 
 
 
178 aa  47.4  9e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.918072  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4939  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  28.4 
 
 
169 aa  47.4  9e-05  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0764013  normal  0.0629718 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1232  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.88 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2576  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  29.19 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0793638 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  25.75 
 
 
187 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.705598  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1767  outer membrane protein OmpH  28.57 
 
 
196 aa  45.4  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.264909 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0381  outer membrane chaperone Skp (OmpH)  26.54 
 
 
184 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0979  outer membrane protein  28.11 
 
 
194 aa  43.5  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.536897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>