More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_0181 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_0187  outer membrane protein assembly factor YaeT  100 
 
 
810 aa  1664  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00010789  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0949  outer membrane protein assembly factor YaeT  78.95 
 
 
809 aa  1328  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00135315  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0250  outer membrane protein assembly factor YaeT  95.31 
 
 
810 aa  1606  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.609554  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3153  surface antigen (D15)  50.55 
 
 
827 aa  840  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  3.52533e-05  normal  0.0112151 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3782  outer membrane protein assembly factor YaeT  83.15 
 
 
801 aa  1388  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  9.07033e-05  hitchhiker  0.00340919 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2877  surface antigen (D15)  50.42 
 
 
827 aa  850  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  9.48e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0262  outer membrane protein assembly factor YaeT  92.73 
 
 
803 aa  1522  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0715  outer membrane protein assembly factor YaeT  88.81 
 
 
805 aa  1486  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  7.33739e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  92.97 
 
 
804 aa  1533  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25845  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1489  surface antigen (D15)  50.9 
 
 
826 aa  846  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390259  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  95.31 
 
 
810 aa  1606  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal  0.197895 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3427  outer membrane protein assembly factor YaeT  78.72 
 
 
795 aa  1317  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  9.02719e-06  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3157  outer membrane protein assembly factor YaeT  77.11 
 
 
805 aa  1315  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0017892  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0181  outer membrane protein assembly factor YaeT  100 
 
 
810 aa  1664  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  1.94171e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1843  outer membrane protein assembly factor YaeT  56.33 
 
 
803 aa  954  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.94278e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2419  outer membrane protein assembly factor YaeT  55.46 
 
 
806 aa  947  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0333898  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0265  outer membrane protein assembly factor YaeT  92.6 
 
 
803 aa  1521  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000300024  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1453  surface antigen (D15)  50.9 
 
 
826 aa  846  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.44779e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1021  outer membrane protein assembly factor YaeT  78.72 
 
 
795 aa  1317  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  9.98639e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01381  outer membrane protein, OMP85 family  47.41 
 
 
825 aa  781  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0183753  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03229  outer membrane protein assembly factor YaeT  57.37 
 
 
804 aa  962  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2972  outer membrane protein assembly factor YaeT  76.83 
 
 
807 aa  1303  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0353111  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00174  hypothetical protein  100 
 
 
810 aa  1664  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00018653  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1356  surface antigen (D15)  50.66 
 
 
826 aa  851  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000205975  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2700  surface antigen (D15)  50.78 
 
 
826 aa  852  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000360043  hitchhiker  0.00504138 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2627  surface antigen (D15)  50.3 
 
 
827 aa  838  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0218715  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1562  surface antigen (D15)  49.16 
 
 
827 aa  811  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  3.80588e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0170  outer membrane protein assembly factor YaeT  100 
 
 
810 aa  1664  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  5.13305e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3273  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  50.66 
 
 
827 aa  843  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  2.81786e-05  hitchhiker  0.00225371 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1561  OMP85 family outer membrane protein  47.96 
 
 
817 aa  783  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.347163  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0179  outer membrane protein assembly factor YaeT  100 
 
 
810 aa  1664  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.66992e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1257  surface antigen (D15)  45.78 
 
 
824 aa  756  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00322017  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002754  outer membrane protein assembly factor YaeT precursor  56.27 
 
 
804 aa  951  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0604223  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1278  surface antigen (D15)  50.3 
 
 
827 aa  835  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00357264  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0980  surface antigen  44.54 
 
 
802 aa  706  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00787602  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2633  surface antigen (D15)  50.78 
 
 
826 aa  852  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  4.45373e-05  normal  0.203506 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3426  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  100 
 
 
810 aa  1664  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  4.80767e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1637  surface antigen  50.42 
 
 
826 aa  843  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2807  surface antigen (D15)  50.54 
 
 
826 aa  848  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  2.85002e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1458  surface antigen (D15)  50.24 
 
 
827 aa  834  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000234879  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2894  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  50.9 
 
 
826 aa  846  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172199  normal  0.36533 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0535  OMP85 family outer membrane protein  45.32 
 
 
793 aa  760  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3352  outer membrane protein assembly factor YaeT  77.78 
 
 
815 aa  1316  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346772  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2968  surface antigen (D15)  47.15 
 
 
802 aa  763  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.270101  normal  0.279532 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00175  hypothetical protein  100 
 
 
810 aa  1664  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  9.80871e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1074  outer membrane protein assembly factor YaeT  78.72 
 
 
795 aa  1317  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  9.79052e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3483  outer membrane protein assembly factor YaeT  100 
 
 
810 aa  1664  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  8.02072e-05  normal  0.102232 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0188  outer membrane protein assembly factor YaeT  98.89 
 
 
810 aa  1645  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  4.18762e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1147  surface antigen  50.24 
 
 
844 aa  835  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.003885  normal  0.883859 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  40 
 
 
784 aa  578  1e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  39.56 
 
 
797 aa  578  1e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  39.35 
 
 
794 aa  576  1e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38910  surface antigen  39.53 
 
 
792 aa  574  1e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  39.17 
 
 
786 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  39.1 
 
 
786 aa  569  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  39.24 
 
 
787 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  39.17 
 
 
786 aa  568  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1542  outer membrane protein  38.98 
 
 
795 aa  565  1e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1351  surface antigen (D15):surface antigen variable number  38.79 
 
 
791 aa  564  1e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3794  surface antigen (D15):surface antigen variable number  39.48 
 
 
790 aa  565  1e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173749 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2540  surface antigen (D15)  38.68 
 
 
772 aa  560  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  39.15 
 
 
787 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  39.15 
 
 
787 aa  555  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  38.03 
 
 
790 aa  554  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  39.4 
 
 
799 aa  555  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  39.22 
 
 
790 aa  555  1e-156  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1109  surface antigen (D15)  37.66 
 
 
796 aa  547  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242384  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  38.19 
 
 
758 aa  539  1e-152  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  37.91 
 
 
770 aa  542  1e-152  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1489  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.34 
 
 
780 aa  525  1e-147  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0816  Outer membrane protein  38.04 
 
 
766 aa  524  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.468447  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1446  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  37.21 
 
 
800 aa  520  1e-146  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2447  OMP85 family outer membrane protein  36.56 
 
 
796 aa  517  1e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.019137  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  38.01 
 
 
784 aa  511  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  36.27 
 
 
763 aa  509  1e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0357  outer membrane antigen  35.85 
 
 
784 aa  506  1e-142  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.433119  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0322  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.85 
 
 
784 aa  506  1e-142  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01121  outer membrane antigen  36.17 
 
 
788 aa  505  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.385807  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2589  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  34.92 
 
 
896 aa  501  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0085313  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1257  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.41 
 
 
787 aa  500  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901212  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1750  surface antigen (D15):surface antigen variable number  35.14 
 
 
761 aa  496  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.330816  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  36.52 
 
 
784 aa  494  1e-138  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.86 
 
 
769 aa  491  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1458  surface antigen (D15)  36.88 
 
 
780 aa  492  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.12 
 
 
770 aa  487  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  36.76 
 
 
769 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.4 
 
 
768 aa  488  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  36.76 
 
 
769 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  36.76 
 
 
769 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.64 
 
 
769 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  36.51 
 
 
768 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  36.83 
 
 
768 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  36.31 
 
 
791 aa  484  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  36.83 
 
 
769 aa  485  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  36.83 
 
 
768 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.8 
 
 
769 aa  486  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  36.83 
 
 
768 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  36.83 
 
 
769 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  36.83 
 
 
769 aa  485  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  36.7 
 
 
768 aa  484  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>