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for query gene EcDH1_4257 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A3924  multidrug efflux system protein MdtL  99.74 
 
 		 391 aa  772    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03594  multidrug efflux system protein  99.74 
 
 		 391 aa  772    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4257  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 391 aa  773    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03538  hypothetical protein  99.74 
 
 		 391 aa  772    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4219  multidrug efflux system protein MdtL  99.49 
 
 		 391 aa  771    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4284  multidrug efflux system protein MdtL  99.74 
 
 		 391 aa  772    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4212  multidrug efflux system protein MdtL  99.74 
 
 		 391 aa  772    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4077  multidrug efflux system protein MdtL  99.49 
 
 		 391 aa  770    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5141  multidrug efflux system protein MdtL  98.21 
 
 		 391 aa  760    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.280757 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4071  multidrug efflux system protein MdtL  78.37 
 
 		 395 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.706345  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4178  multidrug efflux system protein MdtL  78.37 
 
 		 395 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.576296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4128  multidrug efflux system protein MdtL  78.12 
 
 		 395 aa  609  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.505152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4235  multidrug efflux system protein MdtL  77.86 
 
 		 395 aa  608  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4056  multidrug efflux system protein MdtL  78.12 
 
 		 395 aa  610  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4147  multidrug efflux system protein MdtL  73.13 
 
 		 391 aa  563  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001150  putative multidrug resistance protein  61.48 
 
 		 396 aa  475  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00286721  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4021  multidrug efflux system protein MdtL  57.58 
 
 		 396 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3587  multidrug efflux system protein MdtL  57.07 
 
 		 396 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008700  Sama_3448  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  33.72 
 
 		 400 aa  169  8e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009901  Spea_3956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.69 
 
 		 400 aa  167  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3588  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.77 
 
 		 400 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009831  Ssed_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.75 
 
 		 400 aa  162  7e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008709  Ping_0543  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily protein  31.25 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00469398  normal  1 
 
 
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NC_011312  VSAL_I2992  MFS transporter  30.86 
 
 		 401 aa  160  4e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0254  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.23 
 
 		 400 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.662405 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00358  permease  32.05 
 
 		 423 aa  156  7e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_002080  putative multidrug resistance protein  31.34 
 
 		 397 aa  149  8e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008345  Sfri_0297  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.08 
 
 		 401 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169159  n/a   
 
 
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NC_009438  Sputcn32_0325  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.93 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_0196  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.4 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009665  Shew185_4138  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.4 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0196  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.4 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.4 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0763382 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3948  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.71 
 
 		 402 aa  144  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3494  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.07 
 
 		 402 aa  142  8e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.61895  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3750  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.43 
 
 		 402 aa  142  9e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4555  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  31.5 
 
 		 402 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008322  Shewmr7_3823  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.14 
 
 		 402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2445  putative multidrug resistance protein  31.25 
 
 		 400 aa  139  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_2254  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.51 
 
 		 399 aa  139  8.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2744  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 		 397 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000519122 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1958  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.91 
 
 		 400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.799827  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0881  drug resistance translocator protein  29.05 
 
 		 394 aa  136  6.0000000000000005e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0515514  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_1996  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.82 
 
 		 397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_2106  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.82 
 
 		 397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.758817  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  31.36 
 
 		 414 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
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NC_013457  VEA_001431  multidrug resistance protein D  27.45 
 
 		 397 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000114311  n/a   
 
 
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NC_013172  Bfae_15670  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.46 
 
 		 396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.789382  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_3797  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.61 
 
 		 405 aa  126  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.947543  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06295  hypothetical protein  26.49 
 
 		 387 aa  126  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.6 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3222  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.05 
 
 		 417 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10470  putative MFS transporter  30.47 
 
 		 402 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2187  hypothetical protein  27.3 
 
 		 407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2160  hypothetical protein  27.01 
 
 		 407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_2852  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.2 
 
 		 409 aa  120  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0571  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.72 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0910669  normal  1 
 
 
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NC_009524  PsycPRwf_0389  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.99 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000107544  unclonable  0.00000000056227 
 
 
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NC_009456  VC0395_0057  multidrug resistance protein D  27.7 
 
 		 403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0307213  n/a   
 
 
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NC_007799  ECH_0318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.05 
 
 		 402 aa  117  5e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_3251  bicyclomycin/multidrug efflux system  29.05 
 
 		 402 aa  116  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.303475 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0012  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.34 
 
 		 395 aa  116  7.999999999999999e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.502887  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1475  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.17 
 
 		 405 aa  116  7.999999999999999e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4137  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.29 
 
 		 409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0321092  normal  0.661568 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2437  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.62 
 
 		 393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3595  putative membrane transport protein  32.38 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2351  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.98 
 
 		 398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0919  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.99 
 
 		 389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.75 
 
 		 394 aa  114  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.56 
 
 		 401 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6000  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  31.22 
 
 		 399 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.923433  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3081  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.53 
 
 		 409 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.33 
 
 		 429 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175256  normal  0.467375 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  26.6 
 
 		 399 aa  113  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2172  drug transport transmembrane protein  30.89 
 
 		 407 aa  112  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1728  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.9 
 
 		 440 aa  112  9e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  28.63 
 
 		 399 aa  112  9e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1640  bicyclomycin/multidrug efflux system  27.51 
 
 		 396 aa  112  9e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0753  drug resistance transporter, Bcr/CflA family protein  29.41 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.363927  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3292  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.08 
 
 		 430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0383  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.96 
 
 		 419 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0372929 
 
 
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NC_013159  Svir_13380  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.55 
 
 		 424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.223533  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_1602  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.6 
 
 		 408 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.940845 
 
 
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NC_007005  Psyr_0657  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.42 
 
 		 398 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal  1 
 
 
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NC_007204  Psyc_0349  major facilitator superfamily multi-drug efflux pump  30.96 
 
 		 419 aa  110  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007354  Ecaj_0685  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.06 
 
 		 386 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0211006  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_3892  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.57 
 
 		 412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0543814  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.74 
 
 		 403 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
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NC_012858  Rleg_7148  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  32.79 
 
 		 399 aa  110  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.52 
 
 		 411 aa  109  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
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NC_007958  RPD_3380  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.7 
 
 		 444 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.27624  decreased coverage  0.00175601 
 
 
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NC_011662  Tmz1t_3562  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  29.51 
 
 		 392 aa  109  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
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NC_009505  BOV_0826  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.11 
 
 		 421 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_0511  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.96 
 
 		 409 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0138311 
 
 
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NC_012917  PC1_1452  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.18 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.266521  n/a   
 
 
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NC_009901  Spea_2768  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_3862  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.9 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.984629 
 
 
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NC_008061  Bcen_4704  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.9 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381793  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B5119  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  24.74 
 
 		 416 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_3659  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.9 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154078  normal  0.828723 
 
 
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