More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3965 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  100 
 
 		 491 aa  997    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  92.43 
 
 		 491 aa  921    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  100 
 
 		 491 aa  997    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  100 
 
 		 491 aa  997    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  100 
 
 		 491 aa  997    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  100 
 
 		 491 aa  997    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  99.8 
 
 		 491 aa  996    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  99.39 
 
 		 491 aa  992    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4538  D-xylose-proton symporter  99.62 
 
 		 264 aa  536  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  54.13 
 
 		 468 aa  481  1e-134  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  45.26 
 
 		 448 aa  389  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  41.63 
 
 		 477 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  41.33 
 
 		 475 aa  385  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  40.21 
 
 		 485 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  40.92 
 
 		 467 aa  321  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  38.97 
 
 		 442 aa  320  3e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  39.18 
 
 		 466 aa  319  7.999999999999999e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  39.11 
 
 		 474 aa  313  2.9999999999999996e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  38.61 
 
 		 450 aa  310  4e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  39.8 
 
 		 478 aa  309  9e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  38.06 
 
 		 466 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  35.93 
 
 		 499 aa  305  2.0000000000000002e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  38.45 
 
 		 468 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3209  sugar transporter  39.75 
 
 		 492 aa  303  7.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.331737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3147  sugar transporter  39.75 
 
 		 492 aa  303  7.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.060115  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3159  sugar transporter  39.75 
 
 		 492 aa  303  7.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10565  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  37.95 
 
 		 486 aa  300  3e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  38.83 
 
 		 457 aa  300  3e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3472  sugar transporter  39.16 
 
 		 490 aa  298  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  38.54 
 
 		 493 aa  298  2e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  37.98 
 
 		 487 aa  297  3e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  37.1 
 
 		 485 aa  295  1e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  37.18 
 
 		 448 aa  294  3e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  37.09 
 
 		 480 aa  293  6e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  36.16 
 
 		 480 aa  291  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  36.61 
 
 		 480 aa  291  3e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  35.05 
 
 		 464 aa  288  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  36.88 
 
 		 486 aa  286  5e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33690  sugar transporter  32.41 
 
 		 480 aa  286  8e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4701  sugar transporter  33.27 
 
 		 478 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.32702  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2634  host factor Hfq  37.47 
 
 		 470 aa  283  4.0000000000000003e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000323251  normal  0.44262 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3163  sugar transporter  37.65 
 
 		 468 aa  281  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.956524  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3055  sugar transporter  37.76 
 
 		 494 aa  281  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  34.66 
 
 		 441 aa  281  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  36.88 
 
 		 475 aa  279  9e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  33.33 
 
 		 544 aa  278  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3999  sugar transporter  34.15 
 
 		 479 aa  276  4e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4483  sugar transporter  38.43 
 
 		 474 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125142  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0802  sugar transporter  36.45 
 
 		 496 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  35.94 
 
 		 438 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  36.63 
 
 		 457 aa  273  4.0000000000000004e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2175  sugar transporter  37.14 
 
 		 482 aa  271  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.349166  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  34.68 
 
 		 477 aa  271  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3340  sugar transporter  33.33 
 
 		 504 aa  270  4e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.652825  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3778  sugar transporter  35.46 
 
 		 479 aa  270  5e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6750  major facilitator superfamily permease/glucose transporter  37.37 
 
 		 469 aa  269  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  35.71 
 
 		 444 aa  269  7e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1668  sugar transporter  35.37 
 
 		 472 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  34.66 
 
 		 497 aa  266  8.999999999999999e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2527  sugar transporter  38.89 
 
 		 491 aa  265  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2109  sugar transporter  36.71 
 
 		 475 aa  264  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.197372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3822  sugar transporter  34.32 
 
 		 443 aa  257  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103912  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  34.18 
 
 		 492 aa  256  6e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0314  sugar transporter  37.18 
 
 		 479 aa  252  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0500  sugar transporter  32.91 
 
 		 445 aa  251  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615232  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2423  sugar transporter  34.21 
 
 		 437 aa  251  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.144845 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  33.13 
 
 		 468 aa  246  6.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  36.58 
 
 		 452 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  33.13 
 
 		 474 aa  245  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  36.58 
 
 		 452 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  33.9 
 
 		 468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  34.64 
 
 		 458 aa  243  3.9999999999999997e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  34.66 
 
 		 463 aa  243  5e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0654  major facilitator superfamily sugar transporter  34.18 
 
 		 443 aa  242  9e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.866655  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  34.1 
 
 		 447 aa  242  1e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  32.55 
 
 		 507 aa  242  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1053  sugar transporter  34.54 
 
 		 430 aa  242  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  34.31 
 
 		 463 aa  241  2.9999999999999997e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  34.65 
 
 		 472 aa  239  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  34.09 
 
 		 484 aa  238  2e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  31.89 
 
 		 468 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  33.81 
 
 		 497 aa  234  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  36.16 
 
 		 516 aa  231  2e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0464  hypothetical protein  32.13 
 
 		 473 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  32.13 
 
 		 482 aa  226  6e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  32.92 
 
 		 473 aa  226  7e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  33.2 
 
 		 473 aa  226  9e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  32.44 
 
 		 471 aa  225  1e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0488  hypothetical protein  31.28 
 
 		 473 aa  225  1e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  31.03 
 
 		 472 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  30.82 
 
 		 472 aa  219  7e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  30.82 
 
 		 472 aa  219  7e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2136  sugar transporter  33.63 
 
 		 447 aa  219  7.999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  32.43 
 
 		 464 aa  219  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  32.43 
 
 		 464 aa  219  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  32.43 
 
 		 464 aa  219  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  32.43 
 
 		 464 aa  219  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  32.43 
 
 		 464 aa  219  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  30.82 
 
 		 472 aa  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  31.96 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>