More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3886 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_3886  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
262 aa  539  1e-152  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4659  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  98.85 
 
 
262 aa  535  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4346  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  98.85 
 
 
262 aa  535  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03977  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  98.47 
 
 
262 aa  531  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4571  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  98.85 
 
 
262 aa  532  1e-150  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03938  hypothetical protein  98.47 
 
 
262 aa  531  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3921  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  98.09 
 
 
262 aa  529  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5619  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  96.95 
 
 
262 aa  522  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0309  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  87.02 
 
 
262 aa  472  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.053951 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1745  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  64.26 
 
 
278 aa  323  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.35608  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2890  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  64.26 
 
 
274 aa  320  2e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0336941  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20300  ATP-binding component of ABC phosphonate transporter  63.45 
 
 
278 aa  318  7e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.540657  normal  0.410183 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2247  ABC transporter  61.85 
 
 
277 aa  307  1e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2555  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  62.25 
 
 
277 aa  306  2e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.205375  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2916  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  58.94 
 
 
284 aa  293  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178582  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0829  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  56.05 
 
 
280 aa  290  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0393  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  55.1 
 
 
264 aa  275  4e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6091  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  55.6 
 
 
288 aa  275  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0775  phosphonate ABC transporter ATP-binding  57.14 
 
 
309 aa  275  8e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal  0.944742 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0185  phosphonate ABC transporter ATP-binding  55.6 
 
 
293 aa  274  1e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2593  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  54.47 
 
 
307 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0323  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  54.47 
 
 
307 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.558714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1184  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  54.47 
 
 
307 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2407  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  54.47 
 
 
307 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2964  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  56 
 
 
296 aa  271  6e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245669  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3908  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  55.51 
 
 
267 aa  271  7e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.480865 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3859  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  55.51 
 
 
267 aa  271  7e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3304  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  54.07 
 
 
307 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296205  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3350  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  54.07 
 
 
307 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3338  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  54.07 
 
 
307 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4623  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  53.66 
 
 
269 aa  264  9e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.263735 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0839  ABC phophonates transporter, ATPase subunit PhnC  53.66 
 
 
301 aa  264  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0851593 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4524  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  52.57 
 
 
307 aa  264  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4177  ATPase  55.2 
 
 
281 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0259  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  51.39 
 
 
270 aa  259  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0745614 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1594  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  46.99 
 
 
261 aa  213  2e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6355  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  44.31 
 
 
264 aa  211  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.424299  normal  0.5531 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29130  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  49.16 
 
 
267 aa  209  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6364  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  43.7 
 
 
275 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0620834  normal  0.857375 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4668  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  45.1 
 
 
300 aa  206  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.621423  decreased coverage  0.000827837 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0894  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  45.6 
 
 
275 aa  205  7e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.658454  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4994  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.63 
 
 
260 aa  205  7e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463894  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0130  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  43.68 
 
 
261 aa  204  1e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.63104e-05  hitchhiker  2.8065e-07 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3516  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.69 
 
 
261 aa  204  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4117  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  46.34 
 
 
282 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.914371  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2203  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  46 
 
 
252 aa  203  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0928  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.66 
 
 
256 aa  203  3e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00101449  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1322  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  46.75 
 
 
269 aa  201  1e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233307  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4431  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  45.12 
 
 
284 aa  200  2e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319208  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2285  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  44.14 
 
 
257 aa  199  3e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  7.78372e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0278  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  46.69 
 
 
279 aa  199  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1321  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  46.03 
 
 
271 aa  199  4e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0133  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.75 
 
 
257 aa  199  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0128  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.75 
 
 
257 aa  199  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0335  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  40.73 
 
 
246 aa  199  6e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2409  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  45.42 
 
 
292 aa  197  2e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0181  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.52 
 
 
252 aa  197  2e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3324  ATPase  44.8 
 
 
275 aa  197  2e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3709  phosphonate ABC transporter ATP-binding  44.73 
 
 
272 aa  196  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.144608 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1420  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  45.06 
 
 
273 aa  195  7e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4084  phosphonate ABC transporter ATP-binding  43.09 
 
 
274 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.620388  normal  0.0392209 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0768  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.28 
 
 
270 aa  195  8e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2299  ABC phosphate/phosphonate transport system ATPase  44.94 
 
 
259 aa  193  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4035  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.11 
 
 
273 aa  192  6e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.542235  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0215  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.11 
 
 
273 aa  192  6e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1097  ATPase  42.13 
 
 
254 aa  191  1e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3862  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.74 
 
 
282 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3820  phosphonate ABC transporter ATP-binding  42.28 
 
 
270 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.693168  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2339  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.37 
 
 
257 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  3.37848e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3372  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.7 
 
 
257 aa  190  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3745  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  41.3 
 
 
257 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1278  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.05 
 
 
281 aa  190  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3993  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.05 
 
 
279 aa  191  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.642623  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4201  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.08 
 
 
273 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.171703  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3242  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.05 
 
 
279 aa  191  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980912  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3391  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  41.3 
 
 
257 aa  190  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.193005  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3440  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  40.39 
 
 
257 aa  189  3e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3722  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  40.39 
 
 
257 aa  189  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156195  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1410  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.15 
 
 
277 aa  189  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3474  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  40.89 
 
 
257 aa  188  6e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3749  phosphonate ABC transporter ATP-binding  40.89 
 
 
257 aa  188  6e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1449  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.02 
 
 
254 aa  188  6e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00372903  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3703  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  40.89 
 
 
257 aa  188  6e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5251e-14 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1521  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  41.15 
 
 
248 aa  188  6e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  normal  0.0212059 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4432  phosphonate ABC transporter ATP-binding  42.68 
 
 
271 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2080  ABC transporter related  44.44 
 
 
272 aa  188  9e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2187  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.09 
 
 
275 aa  188  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2156  phosphonate ABC transporter ATP-binding  45.6 
 
 
253 aa  187  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2920  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.86 
 
 
272 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2878  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.76 
 
 
278 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1345  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  39.76 
 
 
278 aa  186  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0502345 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2799  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  39.76 
 
 
278 aa  186  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5858  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  42.28 
 
 
269 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289421  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2676  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.29 
 
 
279 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2995  phosphonate ABC transporter ATP-binding  43.29 
 
 
279 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1927  phosphonate ABC transporter ATP-binding  41.13 
 
 
287 aa  185  6e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.75646  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3264  hypothetical protein  40.89 
 
 
273 aa  185  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.634787 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2677  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.83 
 
 
260 aa  184  9e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0553597 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4960  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  45.38 
 
 
269 aa  184  9e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3381  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  46.46 
 
 
232 aa  184  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>