More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3853 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04009  aspartate ammonia-lyase  100 
 
 		 478 aa  984    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0506  aspartate ammonia-lyase  89.1 
 
 		 479 aa  872    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3853  aspartate ammonia-lyase  100 
 
 		 478 aa  984    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0398  aspartate ammonia-lyase  87.42 
 
 		 479 aa  859    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3825  aspartate ammonia-lyase  89.54 
 
 		 478 aa  899    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0725  aspartate ammonia-lyase  89.1 
 
 		 479 aa  872    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.883409  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3532  aspartate ammonia-lyase  88.26 
 
 		 479 aa  855    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.563164  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002214  aspartate ammonia-lyase  77.94 
 
 		 483 aa  768    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0640  aspartate ammonia-lyase  73.52 
 
 		 479 aa  736    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0725  aspartate ammonia-lyase  89.12 
 
 		 478 aa  896    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4608  aspartate ammonia-lyase  100 
 
 		 478 aa  984    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.21143  normal  0.755736 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2270  aspartate ammonia-lyase  78.16 
 
 		 483 aa  776    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.935521  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1178  aspartate ammonia-lyase  70.55 
 
 		 485 aa  717    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000150136 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2806  aspartate ammonia-lyase  77.09 
 
 		 482 aa  761    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0326  aspartate ammonia-lyase  91.84 
 
 		 478 aa  887    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000442883 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3873  aspartate ammonia-lyase  100 
 
 		 478 aa  984    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4722  aspartate ammonia-lyase  97.07 
 
 		 478 aa  943    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3407  aspartate ammonia-lyase  87.84 
 
 		 479 aa  852    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0480  aspartate ammonia-lyase  87.84 
 
 		 479 aa  862    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4744  aspartate ammonia-lyase  97.07 
 
 		 478 aa  943    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.825089  normal  0.538431 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1091  aspartate ammonia-lyase  71.82 
 
 		 485 aa  720    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.0187146 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0406  aspartate ammonia-lyase  89.75 
 
 		 478 aa  897    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00087202 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3678  aspartate ammonia-lyase  89.54 
 
 		 478 aa  899    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0593  aspartate ammonia-lyase  74.58 
 
 		 472 aa  743    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4604  aspartate ammonia-lyase  97.07 
 
 		 478 aa  943    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03971  hypothetical protein  100 
 
 		 478 aa  984    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0618  aspartate ammonia-lyase  73.73 
 
 		 479 aa  737    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5655  aspartate ammonia-lyase  100 
 
 		 478 aa  984    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0582808  normal  0.320226 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0466  aspartate ammonia-lyase  79.09 
 
 		 471 aa  748    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000107475  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4694  aspartate ammonia-lyase  99.79 
 
 		 478 aa  982    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3747  aspartate ammonia-lyase  73.31 
 
 		 479 aa  734    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0682  aspartate ammonia-lyase  72.9 
 
 		 480 aa  734    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4596  aspartate ammonia-lyase  97.07 
 
 		 478 aa  943    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00154  aspartate ammonia-lyase  77.3 
 
 		 483 aa  763    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4687  aspartate ammonia-lyase  97.07 
 
 		 478 aa  943    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4668  aspartate ammonia-lyase  100 
 
 		 478 aa  984    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4380  aspartate ammonia-lyase  100 
 
 		 478 aa  984    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.211815  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0645  aspartate ammonia-lyase  73.52 
 
 		 479 aa  736    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0082  aspartate ammonia-lyase  58.15 
 
 		 468 aa  578  1e-164  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0094  aspartate ammonia-lyase  57.94 
 
 		 468 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0122  aspartate ammonia-lyase  57.94 
 
 		 468 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2177  aspartate ammonia-lyase  58.67 
 
 		 475 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2083  aspartate ammonia-lyase  58.67 
 
 		 475 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.195347  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1643  aspartate ammonia-lyase  58.48 
 
 		 474 aa  567  1e-160  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1757  aspartate ammonia-lyase  59.74 
 
 		 482 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0193  aspartate ammonia-lyase  59.91 
 
 		 463 aa  542  1e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1791  aspartate ammonia-lyase  58.35 
 
 		 475 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0939  aspartate ammonia-lyase  60.04 
 
 		 468 aa  538  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5639  aspartate ammonia-lyase  55.96 
 
 		 479 aa  535  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.611375  normal  0.502562 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2009  aspartate ammonia-lyase  57.61 
 
 		 476 aa  535  1e-151  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0128  aspartate ammonia-lyase  57.24 
 
 		 474 aa  536  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5338  aspartate ammonia-lyase  56.8 
 
 		 478 aa  531  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486768 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0481  aspartate ammonia-lyase  57.27 
 
 		 474 aa  533  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2008  aspartate ammonia-lyase  57.51 
 
 		 468 aa  535  1e-150  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3403  aspartate ammonia-lyase  56.87 
 
 		 469 aa  529  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00437169  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5247  aspartate ammonia-lyase  56.59 
 
 		 478 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0371805  normal  0.169068 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2438  aspartate ammonia-lyase  54.39 
 
 		 466 aa  528  1e-149  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.268607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5387  aspartate ammonia-lyase  56.8 
 
 		 485 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626704 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6217  aspartate ammonia-lyase  58.13 
 
 		 474 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.946627  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5625  aspartate ammonia-lyase  57.88 
 
 		 478 aa  528  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149238  normal  0.246318 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71650  aspartate ammonia-lyase  57.92 
 
 		 474 aa  525  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0135  aspartate ammonia-lyase  56.59 
 
 		 485 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5499  aspartate ammonia-lyase  57.27 
 
 		 474 aa  521  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2072  aspartate ammonia-lyase  56.3 
 
 		 471 aa  519  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5051  aspartate ammonia-lyase  57.05 
 
 		 474 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4302  aspartate ammonia-lyase  55.08 
 
 		 468 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4064  aspartate ammonia-lyase  55.08 
 
 		 468 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0827  fumarate lyase  53.55 
 
 		 483 aa  519  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3458  aspartate ammonia-lyase  55.08 
 
 		 468 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.882524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2167  aspartate ammonia-lyase  53.8 
 
 		 480 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5752  aspartate ammonia-lyase  55.36 
 
 		 475 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.555308  normal  0.129771 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6431  aspartate ammonia-lyase  56.52 
 
 		 471 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2052  aspartate ammonia-lyase  55.43 
 
 		 485 aa  513  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0909745  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3846  aspartate ammonia-lyase  55.17 
 
 		 467 aa  512  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3457  aspartate ammonia-lyase  55.17 
 
 		 468 aa  513  1e-144  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.73518 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1152  fumarate lyase  54.05 
 
 		 481 aa  510  1e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3758  fumarate lyase  55.53 
 
 		 471 aa  509  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1746  fumarate lyase  53.83 
 
 		 469 aa  509  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3455  aspartate ammonia-lyase  55.19 
 
 		 470 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025134  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3530  fumarate lyase  53.68 
 
 		 540 aa  505  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.448364 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1984  aspartate ammonia-lyase  55.08 
 
 		 468 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3964  aspartate ammonia-lyase  55.6 
 
 		 468 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256806 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3544  fumarate lyase  56.24 
 
 		 471 aa  503  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3976  fumarate lyase  56.33 
 
 		 471 aa  502  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4326  fumarate lyase  53.63 
 
 		 568 aa  501  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.705927  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3958  fumarate lyase  53.63 
 
 		 571 aa  501  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24080  aspartate ammonia-lyase  54.35 
 
 		 505 aa  501  1e-140  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0589  aspartate ammonia-lyase  54.09 
 
 		 467 aa  499  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4435  fumarate lyase  53.63 
 
 		 560 aa  500  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.246293 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1905  fumarate lyase  53.42 
 
 		 475 aa  501  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.486033 
 
 
-
 
NC_002950  PG1741  aspartate ammonia-lyase  51.61 
 
 		 475 aa  492  9.999999999999999e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0565  aspartate ammonia-lyase  53.48 
 
 		 521 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0355315 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1417  aspartate ammonia-lyase  51.28 
 
 		 470 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.442168 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1299  fumarate lyase  56.5 
 
 		 479 aa  490  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160462  normal  0.429544 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1116  putative aspartate ammonia-lyase  53.93 
 
 		 466 aa  489  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1365  fumarate lyase  52.52 
 
 		 484 aa  491  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000000934378  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2652  aspartate ammonia-lyase  53.78 
 
 		 467 aa  488  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.531608  normal  0.0454862 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1395  fumarate lyase  52.03 
 
 		 478 aa  486  1e-136  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1545  aspartate ammonia-lyase  50.21 
 
 		 470 aa  484  1e-135  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000011141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0461  fumarate lyase  52.24 
 
 		 507 aa  479  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>