35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3787 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3787  Opacity-associated protein A  100 
 
 		 212 aa  429  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000889523  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04041  hypothetical protein  99.53 
 
 		 212 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000849189  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4746  opacity-associated family protein  99.53 
 
 		 212 aa  427  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000152643  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3800  opacity-associated protein A  99.53 
 
 		 212 aa  429  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000303652  normal  0.850161 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4456  opacity-associated family protein  100 
 
 		 212 aa  429  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.92011e-19  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04078  predicted cell envelope opacity-associated protein  99.53 
 
 		 212 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000081403  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5723  opacity-associated family protein  99.06 
 
 		 212 aa  425  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000313576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4674  opacity-associated protein A  86.32 
 
 		 211 aa  348  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152862  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4664  opacity-associated protein A  86.32 
 
 		 211 aa  348  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000808092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4814  opacity-associated protein A  85.85 
 
 		 211 aa  346  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000309624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4756  opacity-associated protein A  85.85 
 
 		 211 aa  346  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000275862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4792  opacity-associated protein A  85.85 
 
 		 211 aa  346  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000154437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4683  opacity-associated family protein  84.43 
 
 		 209 aa  334  5.999999999999999e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000121219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0376  opacity-associated protein A  74.3 
 
 		 210 aa  306  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000862329  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3779  opacity-associated protein A  43.6 
 
 		 246 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3634  opacity-associated protein A  43.6 
 
 		 246 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3587  Opacity-associated protein A  38.1 
 
 		 237 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000352842  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0451  opacity-associated protein A  37.74 
 
 		 224 aa  136  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.543433  hitchhiker  0.00503504 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0779  Opacity-associated protein A  40.48 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000149639  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0799  Opacity-associated protein A  42.23 
 
 		 239 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000409608  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3430  Opacity-associated protein A  39.71 
 
 		 237 aa  119  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000719849  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3953  opacity-associated protein  39.39 
 
 		 216 aa  90.5  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0407  opacity-associated protein A  31.03 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000035664  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00758  hypothetical protein  37.21 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001713  hypothetical protein  34.12 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000523038  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1295  opacity-associated protein A  59.57 
 
 		 59 aa  55.8  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1287  opacity associated protein A  34.15 
 
 		 402 aa  54.3  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000183549  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  24.44 
 
 		 439 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  25.25 
 
 		 470 aa  48.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  24.87 
 
 		 441 aa  46.6  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  25.28 
 
 		 475 aa  46.2  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  24.59 
 
 		 473 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  24.59 
 
 		 475 aa  42.4  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  24.59 
 
 		 473 aa  42  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  32.53 
 
 		 512 aa  41.2  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>