143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3615 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04259  phosphopentomutase  99.75 
 
 		 407 aa  838    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3615  phosphopentomutase  100 
 
 		 407 aa  842    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0601  phosphopentomutase  82.31 
 
 		 407 aa  711    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3331  phosphopentomutase  81.57 
 
 		 407 aa  704    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00236172  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0823  phosphopentomutase  83.05 
 
 		 407 aa  712    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.2985  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4984  phosphopentomutase  93.61 
 
 		 407 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0543  phosphopentomutase  91.15 
 
 		 407 aa  778    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.284768  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1927  phosphopentomutase  75.8 
 
 		 406 aa  643    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3496  phosphopentomutase  86 
 
 		 407 aa  733    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4618  phosphopentomutase  100 
 
 		 407 aa  842    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4982  phosphopentomutase  100 
 
 		 407 aa  842    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0662  phosphopentomutase  85.5 
 
 		 407 aa  733    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5898  phosphopentomutase  100 
 
 		 407 aa  842    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04225  hypothetical protein  99.75 
 
 		 407 aa  838    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.836281  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0829  phosphopentomutase  85.75 
 
 		 407 aa  731    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3450  phosphopentomutase  82.31 
 
 		 407 aa  709    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3625  phosphopentomutase  86 
 
 		 407 aa  733    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.871395  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3673  phosphopentomutase  100 
 
 		 407 aa  842    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.863426  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4932  phosphopentomutase  100 
 
 		 407 aa  842    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.912083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4930  phosphopentomutase  100 
 
 		 407 aa  842    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4925  phosphopentomutase  93.61 
 
 		 407 aa  794    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.141985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4977  phosphopentomutase  93.61 
 
 		 407 aa  794    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4823  phosphopentomutase  93.61 
 
 		 407 aa  794    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4891  phosphopentomutase  93.61 
 
 		 407 aa  794    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0858658  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0621  phosphopentomutase  75.49 
 
 		 406 aa  633  1e-180  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.482863  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002631  phosphopentomutase  75.56 
 
 		 406 aa  631  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03375  phosphopentomutase  74.32 
 
 		 406 aa  633  1e-180  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3376  phosphopentomutase  69.78 
 
 		 405 aa  597  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.301348  normal  0.0494326 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1142  phosphopentomutase  70.02 
 
 		 404 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000656152 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2820  phosphopentomutase  70.44 
 
 		 404 aa  592  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.776511  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3228  phosphopentomutase  70.52 
 
 		 404 aa  594  1e-168  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3225  phosphopentomutase  70.02 
 
 		 404 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3364  phosphopentomutase  70.02 
 
 		 404 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  hitchhiker  0.00673377 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3046  phosphopentomutase  71.25 
 
 		 405 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.308084  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3547  phosphopentomutase  68.3 
 
 		 405 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0922116  hitchhiker  0.000231976 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1004  phosphopentomutase  68.23 
 
 		 405 aa  580  1e-164  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.490105  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0975  phosphopentomutase  69.29 
 
 		 407 aa  580  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.515828  hitchhiker  0.00460474 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1219  phosphopentomutase  70.94 
 
 		 404 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1043  phosphopentomutase  70.94 
 
 		 404 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000600335 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1039  phosphopentomutase  70.2 
 
 		 404 aa  570  1e-161  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.536446  hitchhiker  0.0000000672539 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1104  phosphopentomutase  70.44 
 
 		 404 aa  570  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000314431 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2863  phosphopentomutase  63.07 
 
 		 415 aa  563  1.0000000000000001e-159  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2813  phosphopentomutase  69.46 
 
 		 405 aa  560  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00335296  unclonable  0.00000382336 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1027  phosphopentomutase  67.73 
 
 		 405 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0829  phosphopentomutase  62.75 
 
 		 418 aa  478  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44144  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4469  phosphopentomutase  56.59 
 
 		 406 aa  475  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614507  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3345  phosphopentomutase  57.7 
 
 		 406 aa  476  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0641  phosphopentomutase  56.27 
 
 		 413 aa  472  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0693  phosphopentomutase  58.29 
 
 		 407 aa  466  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0676  phosphopentomutase  58.29 
 
 		 407 aa  464  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0229  phosphopentomutase  56.72 
 
 		 406 aa  467  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4181  phosphopentomutase  55.85 
 
 		 406 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4099  phosphopentomutase  56.39 
 
 		 409 aa  454  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1976  phosphopentomutase  55.39 
 
 		 404 aa  449  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0351038  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0280  phosphopentomutase  54.88 
 
 		 397 aa  445  1.0000000000000001e-124  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.240489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1934  phosphopentomutase  54.63 
 
 		 406 aa  435  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2210  phosphopentomutase  54.66 
 
 		 405 aa  436  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1825  phosphopentomutase  53.17 
 
 		 406 aa  423  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0453691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5134  phosphopentomutase  54.25 
 
 		 407 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426443  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0816  phosphopentomutase  52.37 
 
 		 406 aa  402  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.212684 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4521  phosphopentomutase  53.5 
 
 		 405 aa  401  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2985  phosphopentomutase  51.33 
 
 		 402 aa  376  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0277  phosphopentomutase  50.25 
 
 		 398 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0249  phosphopentomutase  48.77 
 
 		 398 aa  364  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1596  phosphopentomutase  48.77 
 
 		 398 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1570  phosphopentomutase  46.6 
 
 		 404 aa  355  5.999999999999999e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3449  phosphopentomutase  48.77 
 
 		 388 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0829  phosphopentomutase  47.91 
 
 		 399 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.654335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2786  phosphopentomutase  47.47 
 
 		 395 aa  345  7e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000455105  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1100  phosphopentomutase  46.87 
 
 		 397 aa  344  2e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4197  phosphopentomutase  46.36 
 
 		 394 aa  341  1e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00100464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1040  phosphopentomutase  46.36 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000119876  hitchhiker  0.000224801 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3844  phosphopentomutase  46.36 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.512526  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4220  phosphopentomutase  46.36 
 
 		 394 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000013434  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4156  phosphopentomutase  46.36 
 
 		 394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0317626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3828  phosphopentomutase  46.36 
 
 		 394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0706266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4111  phosphopentomutase  46.36 
 
 		 394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.25334e-34 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0408  phosphopentomutase  47.43 
 
 		 389 aa  340  4e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3997  phosphopentomutase  46.12 
 
 		 394 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4309  phosphopentomutase  46.12 
 
 		 394 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0282781  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1773  phosphopentomutase  47.04 
 
 		 390 aa  338  9e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2256  phosphopentomutase  46.47 
 
 		 393 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2053  phosphopentomutase  48.38 
 
 		 397 aa  335  9e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1500  phosphopentomutase  47.62 
 
 		 389 aa  334  2e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3918  phosphopentomutase  45.63 
 
 		 394 aa  334  2e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000783591  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0368  phosphopentomutase  45.74 
 
 		 393 aa  333  3e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3205  phosphopentomutase  45.72 
 
 		 392 aa  333  3e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6094  phosphopentomutase  46.94 
 
 		 420 aa  332  6e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1791  phosphopentomutase  47.74 
 
 		 392 aa  330  2e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0677  phosphopentomutase  45.48 
 
 		 388 aa  327  3e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0376  phosphopentomutase  47.1 
 
 		 396 aa  325  6e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0371  phosphopentomutase  47.1 
 
 		 396 aa  325  7e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2221  phosphopentomutase  45.76 
 
 		 394 aa  320  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0781  phosphopentomutase  45.93 
 
 		 390 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0758  phosphopentomutase  45.19 
 
 		 390 aa  310  2e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1319  phosphopentomutase  46.84 
 
 		 396 aa  309  5e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0954  phosphopentomutase  45.71 
 
 		 388 aa  309  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0905  phosphopentomutase  45.96 
 
 		 391 aa  308  9e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2847  phosphopentomutase  42.65 
 
 		 391 aa  307  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1667  phosphopentomutase  44.04 
 
 		 392 aa  307  2.0000000000000002e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.104924  normal  0.0318533 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>