More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3396 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00205  predicted hydroxyacylglutathione hydrolase  99.6 
 
 
251 aa  525  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.374196  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3396  hydroxyacylglutathione hydrolase  100 
 
 
251 aa  526  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0216  hydroxyacylglutathione hydrolase  99.6 
 
 
251 aa  525  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00257158  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0208  hydroxyacylglutathione hydrolase  99.6 
 
 
251 aa  524  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0226  hydroxyacylglutathione hydrolase  99.6 
 
 
251 aa  525  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107285  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0224  hydroxyacylglutathione hydrolase  100 
 
 
251 aa  526  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3453  hydroxyacylglutathione hydrolase  99.6 
 
 
251 aa  525  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.837088  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0217  hydroxyacylglutathione hydrolase  99.6 
 
 
251 aa  524  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.950184  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00210  hypothetical protein  99.6 
 
 
251 aa  525  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.354314  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0299  hydroxyacylglutathione hydrolase  78.49 
 
 
251 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0291  hydroxyacylglutathione hydrolase  78.49 
 
 
251 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.633002 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0286  hydroxyacylglutathione hydrolase  78.49 
 
 
251 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.715099  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0305  hydroxyacylglutathione hydrolase  78.49 
 
 
251 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.435128  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0284  hydroxyacylglutathione hydrolase  78.09 
 
 
251 aa  408  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0746  hydroxyacylglutathione hydrolase  73.71 
 
 
251 aa  399  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.965541  normal  0.966571 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2685  metallo-beta-lactamase family protein  57.37 
 
 
280 aa  309  2.9999999999999997e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0199524 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1052  metallo-beta-lactamase family protein  57.37 
 
 
251 aa  308  6.999999999999999e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.199482  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1106  hydroxyacylglutathione hydrolase  57.37 
 
 
251 aa  308  6.999999999999999e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3138  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.18 
 
 
251 aa  296  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1007  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.18 
 
 
251 aa  294  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1141  hydroxyacylglutathione hydrolase  54.58 
 
 
251 aa  293  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0909  hydroxyacylglutathione hydrolase  56.57 
 
 
251 aa  291  8e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.830211  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2841  hydroxyacylglutathione hydrolase  55.38 
 
 
250 aa  291  9e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0475  hydroxyacylglutathione hydrolase  51.39 
 
 
257 aa  262  4.999999999999999e-69  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.178792  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002770  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.61 
 
 
252 aa  246  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18088  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2401  putative metallo-beta-lactamase  47.39 
 
 
252 aa  244  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1828  putative hydroxyacylglutathione hydrolase GloB  46.22 
 
 
252 aa  241  7.999999999999999e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4897  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.65 
 
 
257 aa  239  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03213  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.42 
 
 
252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1536  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.87 
 
 
263 aa  233  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0733967  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.1 
 
 
258 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1975  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.84 
 
 
259 aa  227  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2529  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.78 
 
 
259 aa  226  3e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2338  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.69 
 
 
259 aa  225  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1678  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.3 
 
 
256 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2184  Beta-lactamase-like  50.2 
 
 
255 aa  222  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1743  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.67 
 
 
259 aa  222  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0994564 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3714  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  45.17 
 
 
259 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.610808  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01981  Hydroxyacylglutathione hydrolase  44.31 
 
 
263 aa  222  4.9999999999999996e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0160657  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2064  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.53 
 
 
257 aa  221  7e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455867  normal  0.0515167 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1299  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.28 
 
 
258 aa  221  8e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.744991  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3716  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.35 
 
 
259 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420034  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1721  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.35 
 
 
259 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1364  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.28 
 
 
258 aa  220  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1761  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.4 
 
 
259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427726  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2651  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.85 
 
 
258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0421465 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1895  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.09 
 
 
257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00137094  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4144  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.35 
 
 
259 aa  218  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29620  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.02 
 
 
258 aa  215  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1884  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.79 
 
 
258 aa  215  7e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000396006  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1595  Beta-lactamase-like  45.81 
 
 
265 aa  214  8e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3469  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.61 
 
 
259 aa  214  9e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1403  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.37 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0310666  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2871  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.14 
 
 
263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00247676  normal  0.571794 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2011  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.99 
 
 
263 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000146784  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1996  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.57 
 
 
263 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0422138  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0870  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.86 
 
 
267 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139904  normal  0.346308 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3483  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.74 
 
 
258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2327  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.15 
 
 
263 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000811011  hitchhiker  0.0000970016 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1022  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.47 
 
 
269 aa  209  5e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1944  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.49 
 
 
255 aa  208  6e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2059  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.57 
 
 
263 aa  208  7e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000134001  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2207  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.41 
 
 
259 aa  208  7e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.181464  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2369  beta-lactamase domain-containing protein  42.86 
 
 
267 aa  208  8e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000987439  normal  0.0208559 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0842  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.03 
 
 
254 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2116  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.23 
 
 
257 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1258  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.82 
 
 
273 aa  206  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000343  normal  0.124604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2611  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.41 
 
 
263 aa  206  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00328129  normal  0.860285 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2187  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.35 
 
 
266 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1776  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.64 
 
 
267 aa  206  4e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000249519  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1515  putative hydroxyacylglutathione hydrolase protein  41.85 
 
 
284 aa  205  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1999  metallo-beta-lactamase family protein  42.25 
 
 
265 aa  205  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0934  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.36 
 
 
259 aa  205  6e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.421322  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1972  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.73 
 
 
245 aa  205  7e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293472 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2530  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.27 
 
 
257 aa  204  8e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.785477  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0328  Beta-lactamase-like  42.53 
 
 
257 aa  204  8e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.309918  normal  0.439224 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2406  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.13 
 
 
263 aa  204  8e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000139632  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2033  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.8 
 
 
268 aa  202  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000269745  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2788  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.8 
 
 
268 aa  202  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000589518  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1253  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.53 
 
 
263 aa  202  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100506  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4429  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.04 
 
 
268 aa  202  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156624  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3786  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.61 
 
 
257 aa  202  6e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.554974 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06151  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  40.32 
 
 
303 aa  201  8e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.117028  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2291  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.46 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.276958  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2898  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.22 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00113363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1468  metallo-beta-lactamase family protein  45.8 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176854  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0561  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.06 
 
 
250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0558  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.8 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0594  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.8 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0765  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.8 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0397  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  45.06 
 
 
250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1275  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.8 
 
 
268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.987461  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0498  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.62 
 
 
256 aa  199  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0378559  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2445  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.15 
 
 
257 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4875  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.61 
 
 
257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1164  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.3 
 
 
260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000229771  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2161  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.98 
 
 
295 aa  198  6e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000853605  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2238  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.35 
 
 
295 aa  198  6e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000229962  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2563  metallo-beta-lactamase family protein  40.98 
 
 
267 aa  198  7e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1176  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.86 
 
 
273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000239023  normal  0.0635677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>