More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3378 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3378  type III secretion FHIPEP protein  100 
 
 		 579 aa  1176    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0259  FHIPEP family type III secretion protein  98.1 
 
 		 579 aa  1149    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4426  flagellar biosynthesis protein FlhA  60.63 
 
 		 698 aa  709    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.47767 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00228  hypothetical protein  99.12 
 
 		 570 aa  1151    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0702  flagellar biosynthesis protein FlhA  63.87 
 
 		 697 aa  775    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.628209  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0163  flagellar biosynthesis protein FlhA  53.93 
 
 		 696 aa  652    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0622  flagellar biosynthesis protein FlhA  64.05 
 
 		 698 aa  775    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0211  flagellar biosynthesis protein FlhA  54.45 
 
 		 696 aa  652    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0263  protein FhiA  98.44 
 
 		 579 aa  1155    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0274  type III secretion protein, FHIPEP family  98.96 
 
 		 579 aa  1159    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.807219 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3391  type III secretion FHIPEP protein  97.56 
 
 		 697 aa  1140    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0243  flagellar biosynthesis protein FlhA  63.7 
 
 		 698 aa  772    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0111317 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0241  lateral flagellar export/assembly protein LfhA  97.56 
 
 		 697 aa  1139    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6779  type III secretion FHIPEP protein  55.03 
 
 		 696 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.702443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0087  flagellar biosynthesis protein FlhA  54.8 
 
 		 693 aa  620  1e-176  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0364653 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04963  flagellar biosynthesis pathway, component FlhA  56.35 
 
 		 696 aa  621  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4644  type III secretion FHIPEP protein  54.86 
 
 		 696 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207433  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0093  flagellar biosynthesis protein FlhA  54.78 
 
 		 693 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3485  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.72 
 
 		 693 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001176  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.64 
 
 		 696 aa  600  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3988  flagellar biosynthesis protein FlhA  55.29 
 
 		 697 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3597  type III secretion FHIPEP protein  49.13 
 
 		 695 aa  582  1.0000000000000001e-165  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.69729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3668  flagellar biosynthesis protein FlhA  54.97 
 
 		 693 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1560  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.85 
 
 		 709 aa  490  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3670  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.68 
 
 		 709 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3430  flagellar biosynthesis protein FlhA  44 
 
 		 705 aa  488  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3875  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.23 
 
 		 707 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.547904  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1523  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.62 
 
 		 748 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.403932  normal  0.346987 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4344  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.44 
 
 		 709 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.265021 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2808  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.23 
 
 		 715 aa  479  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18652  normal  0.0746951 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45680  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.06 
 
 		 707 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.589215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3913  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.63 
 
 		 709 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11934  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1976  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.63 
 
 		 709 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0869734  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3033  flagellar biosynthesis protein FlhA  44 
 
 		 700 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1296  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.36 
 
 		 699 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1363  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.36 
 
 		 699 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.960302 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1393  flagellar biosynthesis FlhA transmembrane protein  41.68 
 
 		 696 aa  462  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.203699  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3213  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.51 
 
 		 699 aa  464  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3440  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.28 
 
 		 709 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2158  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.38 
 
 		 690 aa  464  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.06 
 
 		 697 aa  462  1e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1356  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.36 
 
 		 699 aa  465  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.212501 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2283  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.81 
 
 		 699 aa  465  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1375  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.31 
 
 		 699 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.361202  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.55 
 
 		 700 aa  457  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2562  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.61 
 
 		 699 aa  456  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1749  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.01 
 
 		 692 aa  458  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1749  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.84 
 
 		 692 aa  456  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02873  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.78 
 
 		 699 aa  456  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.656306  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1340  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.28 
 
 		 699 aa  458  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.45 
 
 		 699 aa  456  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2167  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.51 
 
 		 755 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.66 
 
 		 702 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1978  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.25 
 
 		 724 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1380  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.91 
 
 		 699 aa  451  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.329367 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1516  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.56 
 
 		 700 aa  451  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.33 
 
 		 697 aa  450  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2922  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.91 
 
 		 699 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.268541  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2912  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.91 
 
 		 699 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.96 
 
 		 706 aa  451  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1196  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.23 
 
 		 699 aa  450  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3054  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.96 
 
 		 699 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.921062  normal  0.080885 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1451  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.91 
 
 		 699 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1657  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.48 
 
 		 697 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0357682  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.43 
 
 		 699 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.68 
 
 		 693 aa  445  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.26 
 
 		 710 aa  439  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00961  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.07 
 
 		 684 aa  436  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.21205  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06205  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.07 
 
 		 684 aa  436  1e-121  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.127059  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.54 
 
 		 703 aa  438  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.167459 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1335  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.73 
 
 		 697 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.7 
 
 		 690 aa  434  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3699  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.86 
 
 		 695 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0172867 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4067  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.17 
 
 		 708 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4179  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.17 
 
 		 708 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.37 
 
 		 692 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.54 
 
 		 692 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.33 
 
 		 694 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1246  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.39 
 
 		 692 aa  424  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.932165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1310  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.42 
 
 		 692 aa  422  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.933985  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3803  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.28 
 
 		 700 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1520  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.7 
 
 		 698 aa  421  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  38.3 
 
 		 695 aa  419  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1548  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.26 
 
 		 698 aa  420  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.72 
 
 		 696 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3843  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.46 
 
 		 700 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3129  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.46 
 
 		 700 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2846  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.46 
 
 		 700 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0740  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.21 
 
 		 694 aa  416  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0062  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.46 
 
 		 700 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1696  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.46 
 
 		 700 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.05 
 
 		 693 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.2 
 
 		 694 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3169  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.46 
 
 		 700 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3093  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.14 
 
 		 694 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.753258  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0131  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.58 
 
 		 700 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3422  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.46 
 
 		 700 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.545221  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3924  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.46 
 
 		 700 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932271  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3820  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.96 
 
 		 694 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.136206 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0599  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.32 
 
 		 699 aa  414  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>