More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3364 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00240  gamma-glutamyl phosphate reductase  99.28 
 
 
417 aa  842    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3364  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 
417 aa  847    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0372  gamma-glutamyl phosphate reductase  85.85 
 
 
416 aa  725    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.559785  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0363  gamma-glutamyl phosphate reductase  85.37 
 
 
416 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0240  gamma-glutamyl phosphate reductase  99.76 
 
 
417 aa  843    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00243  hypothetical protein  99.28 
 
 
417 aa  842    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0901  gamma-glutamyl phosphate reductase  73.62 
 
 
417 aa  637    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0769  gamma-glutamyl phosphate reductase  87.05 
 
 
417 aa  738    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0826655 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3338  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 
417 aa  847    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.787396 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0968  gamma-glutamyl phosphate reductase  76.02 
 
 
417 aa  651    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0354  gamma-glutamyl phosphate reductase  85.61 
 
 
415 aa  722    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.156512  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0270  gamma-glutamyl phosphate reductase  99.52 
 
 
417 aa  842    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0297  gamma-glutamyl phosphate reductase  99.52 
 
 
417 aa  842    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000952781 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0364  gamma-glutamyl phosphate reductase  86.09 
 
 
416 aa  725    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000332423 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0936  gamma-glutamyl phosphate reductase  75 
 
 
417 aa  640    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0357  gamma-glutamyl phosphate reductase  85.37 
 
 
416 aa  719    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0275  gamma-glutamyl phosphate reductase  99.52 
 
 
417 aa  842    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0870327  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0288  gamma-glutamyl phosphate reductase  98.8 
 
 
417 aa  837    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619087  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3430  gamma-glutamyl phosphate reductase  76.02 
 
 
417 aa  629  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000815894  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3283  gamma-glutamyl phosphate reductase  75.54 
 
 
417 aa  628  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3300  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.42 
 
 
419 aa  618  1e-176  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00136137  normal  0.0296518 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3287  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.42 
 
 
419 aa  618  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3149  gamma-glutamyl phosphate reductase  72.42 
 
 
419 aa  618  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.485003  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0408  gamma-glutamyl phosphate reductase  64.58 
 
 
418 aa  549  1e-155  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3415  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.57 
 
 
424 aa  498  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0715531 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1863  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.65 
 
 
417 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000148264  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3084  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.04 
 
 
421 aa  491  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0967  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.59 
 
 
424 aa  490  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2847  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.93 
 
 
429 aa  485  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.948477  normal  0.581146 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01163  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.38 
 
 
411 aa  486  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004267  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.63 
 
 
411 aa  487  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000573407  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0978  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.55 
 
 
413 aa  485  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.925276  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.63 
 
 
424 aa  485  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2975  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.52 
 
 
422 aa  482  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2952  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.8 
 
 
415 aa  479  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.434526  normal  0.142114 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.65 
 
 
425 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0955  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.89 
 
 
425 aa  476  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1122  gamma-glutamyl phosphate reductase  59.13 
 
 
425 aa  473  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3323  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.8 
 
 
425 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0991  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.41 
 
 
425 aa  471  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.145269  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3415  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.55 
 
 
425 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.739308  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1038  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.55 
 
 
425 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.901559  hitchhiker  0.0000854394 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3541  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.31 
 
 
425 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0763  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.06 
 
 
423 aa  463  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.208576 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3350  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.48 
 
 
422 aa  462  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000409724 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2515  gamma-glutamyl phosphate reductase  58.55 
 
 
420 aa  462  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0306758  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4447  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.14 
 
 
423 aa  453  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0509531 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3208  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.94 
 
 
420 aa  447  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.751856  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.04 
 
 
425 aa  421  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.28 
 
 
424 aa  421  1e-116  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2804  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.18 
 
 
420 aa  417  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0761  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.21 
 
 
445 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0336329  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.04 
 
 
424 aa  414  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2175  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.76 
 
 
418 aa  410  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.202609  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.24 
 
 
419 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.39 
 
 
415 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2254  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.25 
 
 
430 aa  402  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0644  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.44 
 
 
415 aa  402  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0619  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.68 
 
 
415 aa  403  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00446157  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.39 
 
 
415 aa  405  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2141  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.22 
 
 
459 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000141215 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
418 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1716  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.24 
 
 
413 aa  399  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2456  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.89 
 
 
418 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal  0.130366 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2279  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.33 
 
 
434 aa  395  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0615198  hitchhiker  0.00168342 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.92 
 
 
418 aa  397  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.08 
 
 
411 aa  392  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.68 
 
 
419 aa  393  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1227  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.67 
 
 
419 aa  392  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.683793  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.67 
 
 
420 aa  392  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1675  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.12 
 
 
416 aa  393  1e-108  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1552  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.77 
 
 
418 aa  392  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554956  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7267  Glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  50.64 
 
 
429 aa  391  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0694677  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.95 
 
 
418 aa  389  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.95 
 
 
421 aa  389  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.02 
 
 
418 aa  389  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3364  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.4 
 
 
424 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  47.71 
 
 
419 aa  391  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11440  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  49.75 
 
 
446 aa  385  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180187 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.84 
 
 
434 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.12 
 
 
415 aa  384  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1194  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.37 
 
 
420 aa  382  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0385  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.49 
 
 
413 aa  382  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.427307  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.92 
 
 
418 aa  385  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.38 
 
 
418 aa  381  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2873  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.3 
 
 
413 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.69 
 
 
423 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2017  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.08 
 
 
413 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.969749  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0784  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.09 
 
 
423 aa  378  1e-104  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1018  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  45.74 
 
 
425 aa  381  1e-104  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0284  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.06 
 
 
417 aa  377  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.8 
 
 
419 aa  378  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.78 
 
 
418 aa  376  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0456  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.75 
 
 
413 aa  376  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.87 
 
 
435 aa  378  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18230  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  49.26 
 
 
426 aa  378  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374677  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.87 
 
 
421 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2387  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 
450 aa  375  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0346385  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.84 
 
 
427 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.6 
 
 
421 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0826689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>