16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3355 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3355  transcriptional regulator protein-like protein  100 
 
 		 285 aa  592  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1039  conserved hypothetical protein  90.48 
 
 		 147 aa  276  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3436  hypothetical protein  55.88 
 
 		 150 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1041  putative transcriptional regulator  97.01 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1387  regulatory protein DeoR  73.26 
 
 		 232 aa  115  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2884  regulatory protein DeoR  72.09 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0758  transcriptional regulator  87.5 
 
 		 233 aa  112  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3434  transcriptional regulator  82.81 
 
 		 237 aa  106  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3405  hypothetical protein  66.13 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3204  hypothetical protein  66.13 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4799  hypothetical protein  66.13 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.326133 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0924  transcriptional regulator-like  53.23 
 
 		 300 aa  60.5  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156607 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0674  transcriptional regulator, putative  40.35 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2746  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  48.28 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0446014 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0031  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  40.74 
 
 		 288 aa  49.7  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.718657  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0219  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  44.83 
 
 		 301 aa  49.3  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>