275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3353 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3353  GTP-binding protein HSR1-related protein  100 
 
 		 287 aa  592  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1043  GTP-binding protein HSR1-related protein  82.58 
 
 		 287 aa  503  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.557877  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0930  GTP-binding protein HSR1-related  68.75 
 
 		 288 aa  417  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.518572  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1388  GTP-binding protein HSR1-related protein  51.55 
 
 		 291 aa  315  4e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3433  GTP-binding protein HSR1-related  52.92 
 
 		 291 aa  311  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2882  GTP-binding protein HSR1-related  51.71 
 
 		 291 aa  310  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0759  putative GTPase  52.23 
 
 		 291 aa  310  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2138  putative GTPase  49.48 
 
 		 290 aa  277  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4891  putative GTPase  49.48 
 
 		 290 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1393  putative GTPase  48.8 
 
 		 290 aa  271  7e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3346  putative GTPase  48.8 
 
 		 290 aa  271  1e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2251  putative GTPase  48.8 
 
 		 290 aa  271  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1071  putative GTPase  49.14 
 
 		 290 aa  270  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0467468 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3137  GTP-binding protein HSR1-related  44.41 
 
 		 295 aa  239  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4685  putative GTPase  35.29 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3402  putative GTPase  34.95 
 
 		 294 aa  185  8e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4797  putative GTPase  34.6 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.276697 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3202  putative GTPase  34.26 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1658  GTPase-like protein  47.28 
 
 		 236 aa  158  9e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.374478  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  36.75 
 
 		 448 aa  62.4  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2082  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 313 aa  57  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.592415  normal  0.853182 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0825  tRNA modification GTPase TrmE  30.58 
 
 		 442 aa  55.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2380  GTP-binding protein, HSR1-related  34.38 
 
 		 635 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf303  GTP-binding protein EngA  24.62 
 
 		 434 aa  54.7  0.000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.778638  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1042  GTP-binding protein Era  33.68 
 
 		 297 aa  54.3  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0979  tRNA modification GTPase TrmE  28.67 
 
 		 442 aa  54.3  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.523955  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0435  GTP-binding protein EngA  28.57 
 
 		 460 aa  53.9  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1036  tRNA modification GTPase TrmE  28.67 
 
 		 442 aa  53.9  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.788526  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2089  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.41 
 
 		 637 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000643797  unclonable  0.000000212393 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0536  GTP-binding protein EngA  29.94 
 
 		 461 aa  53.9  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0569  tRNA modification GTPase TrmE  31.97 
 
 		 458 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1862  small GTP-binding protein  26 
 
 		 398 aa  53.9  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.803475  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  28.42 
 
 		 464 aa  53.9  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0526  tRNA modification GTPase TrmE  30.65 
 
 		 446 aa  53.5  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0819  tRNA modification GTPase TrmE  27.84 
 
 		 452 aa  53.1  0.000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0053  GTP-binding protein EngA  27.56 
 
 		 460 aa  52.8  0.000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1572  GTP-binding protein EngA  27.92 
 
 		 460 aa  52.8  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1339  GTP-binding protein EngA  31.97 
 
 		 463 aa  52.4  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1077  Miro domain protein  24.21 
 
 		 444 aa  52.4  0.000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2710  GTP-binding protein Era  24.16 
 
 		 304 aa  52.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.521075  normal  0.585399 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1629  GTPases  26.92 
 
 		 416 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000232915  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0392  GTP-binding protein EngA  36.73 
 
 		 494 aa  52  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1412  GTP-binding protein Era  30.58 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000752923  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0409  GTP-binding protein EngA  28.57 
 
 		 460 aa  52  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1361  small GTP-binding protein  27.59 
 
 		 396 aa  52  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.311924  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4307  GTP-binding protein HSR1-related  35.16 
 
 		 650 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1753  ribosome-associated GTPase EngA  23.11 
 
 		 477 aa  52  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2152  GTP-binding protein, HSR1-related  24.47 
 
 		 523 aa  51.6  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  33.88 
 
 		 460 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  33.88 
 
 		 460 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0548  tRNA modification GTPase TrmE  27.73 
 
 		 442 aa  50.8  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0562  GTP-binding protein Era  26.77 
 
 		 300 aa  50.4  0.00004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.204296  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03489  tRNA modification GTPase TrmE  37.93 
 
 		 446 aa  50.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18431  GTPase SAR1 and related small G proteins  29.41 
 
 		 440 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.491382 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3828  GTP-binding protein Era  23.6 
 
 		 305 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1326  small GTP-binding protein  30.15 
 
 		 529 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0975  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.68 
 
 		 440 aa  49.3  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3610  tRNA modification GTPase TrmE  34.09 
 
 		 475 aa  49.3  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1987  GTP-binding protein Era  23.77 
 
 		 296 aa  49.3  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2272  GTP-binding protein Era  23.77 
 
 		 296 aa  48.9  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0246  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  30.82 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0886847  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0018  tRNA modification GTPase TrmE  24.86 
 
 		 438 aa  48.5  0.0001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  27.86 
 
 		 301 aa  48.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2246  small GTP-binding protein  26.85 
 
 		 496 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1153  hypothetical protein  24.3 
 
 		 614 aa  48.5  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.9167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1833  tRNA modification GTPase TrmE  26.45 
 
 		 444 aa  48.5  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2519  tRNA modification GTPase TrmE  28.29 
 
 		 462 aa  48.5  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190608 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1904  tRNA modification GTPase TrmE  31.01 
 
 		 472 aa  48.5  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1029  tRNA modification GTPase TrmE  30.16 
 
 		 434 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.111023  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  28.41 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0121  GTP-binding protein EngA  28.46 
 
 		 452 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0118  GTP-binding protein EngA  28.46 
 
 		 452 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.132129 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1409  tRNA modification GTPase TrmE  28.68 
 
 		 452 aa  48.1  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  29.01 
 
 		 434 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1940  tRNA modification GTPase TrmE  31.86 
 
 		 435 aa  47.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.704243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4767  GTP-binding protein HSR1-related  25.91 
 
 		 629 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.049365  hitchhiker  0.000697216 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1193  GTPase  33.33 
 
 		 428 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.346231  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1989  tRNA modification GTPase TrmE  30.43 
 
 		 463 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.858955 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2045  GTP-binding protein Era  29.03 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  31.13 
 
 		 449 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2180  tRNA modification GTPase TrmE  24.71 
 
 		 472 aa  47.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1322  small GTP-binding protein  26.14 
 
 		 531 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  29.31 
 
 		 440 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  31.13 
 
 		 494 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1537  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.73 
 
 		 413 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.273802  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09700  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  30.43 
 
 		 438 aa  47.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.253075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5156  small GTP-binding protein  33.08 
 
 		 566 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.61556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4774  tRNA modification GTPase TrmE  31.9 
 
 		 467 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.149576 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  27.86 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02181  tRNA modification GTPase TrmE  27.87 
 
 		 461 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0134  GTP-binding protein Era  32.63 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1351  small GTP-binding protein  26.14 
 
 		 531 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  27.71 
 
 		 438 aa  47  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0777  GTP-binding protein EngA  30.08 
 
 		 462 aa  47  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2081  small GTP-binding protein  25.39 
 
 		 416 aa  47  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000627073  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3931  tRNA modification GTPase TrmE  32.5 
 
 		 437 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0003  tRNA modification GTPase TrmE  28.67 
 
 		 459 aa  46.2  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000387737  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0272  small GTP-binding protein  25 
 
 		 382 aa  46.2  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.934792  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0764  GTP-binding protein EngA  30.3 
 
 		 437 aa  46.6  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000517804  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0654  tRNA modification GTPase TrmE  38.98 
 
 		 466 aa  46.6  0.0005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>