60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3263 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3263  oligosaccharide/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  100 
 
 		 417 aa  830    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0568399  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1767  galactoside permease  79.13 
 
 		 418 aa  637    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0531388  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0416  galactoside permease  99.76 
 
 		 417 aa  830    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.64566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0374  galactoside permease  100 
 
 		 417 aa  830    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3282  galactoside permease  100 
 
 		 417 aa  830    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00177774  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00297  galactoside permease  100 
 
 		 417 aa  830    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0372048  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0367  galactoside permease  100 
 
 		 417 aa  830    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00932691  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0407  galactoside permease  99.76 
 
 		 417 aa  830    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00583816  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1361  galactoside permease  80.05 
 
 		 420 aa  633  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.32292  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1680  galactoside permease  68.77 
 
 		 435 aa  576  1.0000000000000001e-163  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000567267  normal  0.141313 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2492  galactoside permease  68.77 
 
 		 435 aa  576  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2394  galactoside permease  68.52 
 
 		 435 aa  574  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000789855  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3102  major facilitator superfamily oligosaccharide/H+ symporter  63.52 
 
 		 418 aa  496  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.186561 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0632  galactoside permease  58.64 
 
 		 420 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0846  galactoside permease  58.64 
 
 		 420 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1330  galactoside permease  61.46 
 
 		 426 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.800996  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2657  galactoside permease  60.5 
 
 		 426 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3115  galactoside permease  57.68 
 
 		 425 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0255021 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3381  galactoside permease  57.93 
 
 		 430 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4076  galactoside permease  59.4 
 
 		 421 aa  442  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.427809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51430  Proton/sugar symporter  46.06 
 
 		 437 aa  346  5e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2636  oligosaccharide/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.58 
 
 		 410 aa  333  4e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0232716  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2083  galactoside permease  43.94 
 
 		 419 aa  304  2.0000000000000002e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3434  major facilitator superfamily oligosaccharide/H+ symporter  36.07 
 
 		 422 aa  257  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51800  galactoside permease  38.6 
 
 		 427 aa  254  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28670  galactoside permease  35.03 
 
 		 448 aa  234  3e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2646  galactoside permease  30.93 
 
 		 415 aa  211  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0124  galactoside permease  29.65 
 
 		 445 aa  177  2e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000688669  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  25.43 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  21.61 
 
 		 386 aa  57.4  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1202  major facilitator transporter  21.84 
 
 		 391 aa  53.9  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.207324  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2503  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 397 aa  53.1  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00527244 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  27 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  27 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 		 388 aa  50.4  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3262  major facilitator transporter  23.9 
 
 		 385 aa  49.7  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.344996 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1243  major facilitator superfamily MFS_1  20.96 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3073  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 		 389 aa  48.9  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3034  putative 3-phenylpropionic acid transporter  21.83 
 
 		 379 aa  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.308801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6539  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 420 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.516365  normal  0.497614 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1556  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 407 aa  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.897116  normal  0.129024 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1657  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 395 aa  47.4  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0618282  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 395 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0588  major facilitator transporter  44.26 
 
 		 464 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  27.13 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1139  major facilitator transporter  20.72 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000165449  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2005  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 390 aa  45.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4111  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1639  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 		 387 aa  44.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000052995 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  34.04 
 
 		 917 aa  44.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1971  transporter, putative  27.21 
 
 		 387 aa  44.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  24.31 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0678  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 394 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 397 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 397 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0184  major facilitator transporter  32.18 
 
 		 470 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012641 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3690  major facilitator transporter  36.99 
 
 		 424 aa  43.5  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.762235 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2910  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.38 
 
 		 379 aa  43.1  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0356658  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  28.57 
 
 		 397 aa  43.1  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>