More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3257 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 288 aa  595  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  99.31 
 
 		 293 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  99.31 
 
 		 288 aa  592  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  99.31 
 
 		 293 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  99.31 
 
 		 293 aa  593  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  99.31 
 
 		 293 aa  593  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  99.31 
 
 		 288 aa  592  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  99.3 
 
 		 288 aa  590  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  72.03 
 
 		 288 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  71.83 
 
 		 288 aa  440  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  70.88 
 
 		 287 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  69.82 
 
 		 289 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  67.61 
 
 		 289 aa  424  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  69.64 
 
 		 289 aa  424  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  68.44 
 
 		 288 aa  424  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  66.9 
 
 		 298 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  52.14 
 
 		 286 aa  293  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  51.79 
 
 		 286 aa  292  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  40.42 
 
 		 291 aa  202  7e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  39.46 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  39.46 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  39.46 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  39.16 
 
 		 294 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 295 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  38.26 
 
 		 279 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  36.86 
 
 		 289 aa  189  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  40.67 
 
 		 287 aa  188  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  38.3 
 
 		 277 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  41.44 
 
 		 277 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  38.58 
 
 		 302 aa  177  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  36.26 
 
 		 283 aa  168  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  36.27 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  32.88 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  35.05 
 
 		 285 aa  152  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 		 285 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 		 285 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  36.47 
 
 		 275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  31.99 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  33.58 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  32.33 
 
 		 278 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  36.59 
 
 		 286 aa  149  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 290 aa  146  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  33.71 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 		 291 aa  146  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  34.48 
 
 		 279 aa  145  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  35.19 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  35.21 
 
 		 282 aa  143  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  35.56 
 
 		 276 aa  142  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  32.75 
 
 		 283 aa  142  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  32.75 
 
 		 283 aa  142  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  34.71 
 
 		 289 aa  141  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  34.81 
 
 		 276 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  33.92 
 
 		 271 aa  139  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 		 274 aa  138  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  34.89 
 
 		 273 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  33.69 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  32.99 
 
 		 285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 		 283 aa  132  7.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 		 283 aa  132  9e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  34.66 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 		 278 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0888  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0210  alpha/beta hydrolase fold  32.75 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  33.45 
 
 		 291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  32.33 
 
 		 304 aa  126  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 		 271 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5690  Alpha/beta hydrolase fold  34.34 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  31.11 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3690  alpha/beta hydrolase fold  32.68 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3228  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  31.74 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 		 282 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 		 277 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  29.86 
 
 		 286 aa  98.6  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 		 316 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 315 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3884  alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 		 286 aa  97.4  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.330831  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 271 aa  96.7  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0538  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.282885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  27.92 
 
 		 276 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.72 
 
 		 370 aa  92.4  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0656  alpha/beta hydrolase fold protein  29.54 
 
 		 258 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  27.56 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0068  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4895  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 		 282 aa  90.5  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0335992  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.6 
 
 		 370 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>