More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3141 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00420  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 183 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00707641  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3141  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 183 aa  365  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000274738  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0401  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 183 aa  365  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0547967  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3147  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 183 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0333667  normal  0.241044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0546  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 183 aa  365  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00425  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00912156  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0512  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 183 aa  365  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00096873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0506  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 183 aa  365  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00345089  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  99.45 
 
 		 183 aa  362  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0949  adenine phosphoribosyltransferase  95.63 
 
 		 183 aa  351  2.9999999999999997e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.431291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0533  adenine phosphoribosyltransferase  95.08 
 
 		 183 aa  350  8.999999999999999e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0527  adenine phosphoribosyltransferase  95.08 
 
 		 183 aa  350  8.999999999999999e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11259  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0527  adenine phosphoribosyltransferase  95.08 
 
 		 183 aa  350  8.999999999999999e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0543  adenine phosphoribosyltransferase  95.08 
 
 		 183 aa  350  8.999999999999999e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0587  adenine phosphoribosyltransferase  95.08 
 
 		 183 aa  348  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  83.61 
 
 		 182 aa  306  6.999999999999999e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3040  adenine phosphoribosyltransferase  81.97 
 
 		 182 aa  302  2.0000000000000002e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1134  adenine phosphoribosyltransferase  81.42 
 
 		 198 aa  301  5.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.397131  unclonable  0.0000000192445 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1075  adenine phosphoribosyltransferase  80.98 
 
 		 185 aa  300  8.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00248791  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3236  adenine phosphoribosyltransferase  80.87 
 
 		 185 aa  296  8e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0483226  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  80.22 
 
 		 187 aa  295  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  80.22 
 
 		 187 aa  295  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  80.22 
 
 		 187 aa  295  3e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1084  adenine phosphoribosyltransferase  74.44 
 
 		 181 aa  272  2.0000000000000002e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954514  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  73.89 
 
 		 181 aa  269  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002884  adenine phosphoribosyltransferase  73.33 
 
 		 181 aa  268  4e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0439897  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2236  adenine phosphoribosyltransferase  75 
 
 		 197 aa  268  4e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000133357  hitchhiker  0.000161546 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03088  adenine phosphoribosyltransferase  72.78 
 
 		 181 aa  265  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  73.18 
 
 		 181 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1507  adenine phosphoribosyltransferase  72.13 
 
 		 183 aa  261  6e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00667399  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2382  adenine phosphoribosyltransferase  69.4 
 
 		 185 aa  256  1e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000868696  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2255  adenine phosphoribosyltransferase  69.4 
 
 		 183 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000237286  normal  0.265408 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2447  adenine phosphoribosyltransferase  69.4 
 
 		 183 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2327  adenine phosphoribosyltransferase  69.4 
 
 		 183 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000891458  hitchhiker  0.00045964 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2853  adenine phosphoribosyltransferase  69.78 
 
 		 184 aa  251  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.22702  hitchhiker  0.000000299091 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2012  adenine phosphoribosyltransferase  70.79 
 
 		 181 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2691  adenine phosphoribosyltransferase  69.78 
 
 		 184 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2616  adenine phosphoribosyltransferase  69.78 
 
 		 184 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1768  adenine phosphoribosyltransferase  69.78 
 
 		 184 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000883945  hitchhiker  0.0047086 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2575  adenine phosphoribosyltransferase  69.78 
 
 		 184 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000328192  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1792  adenine phosphoribosyltransferase  71.59 
 
 		 181 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.347967  hitchhiker  0.00000118045 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2303  adenine phosphoribosyltransferase  68.85 
 
 		 184 aa  250  9.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000264279  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2408  adenine phosphoribosyltransferase  70.62 
 
 		 182 aa  249  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607797  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01096  adenine phosphoribosyltransferase  65.71 
 
 		 178 aa  242  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0381093  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1201  adenine phosphoribosyltransferase  65.32 
 
 		 174 aa  236  1e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2898  adenine phosphoribosyltransferase  65.9 
 
 		 178 aa  234  8e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3745  adenine phosphoribosyltransferase  63.93 
 
 		 181 aa  233  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.370359  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  62.01 
 
 		 181 aa  228  3e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0575  adenine phosphoribosyltransferase  56.42 
 
 		 181 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  hitchhiker  0.00758657 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0600  adenine phosphoribosyltransferase  55.87 
 
 		 181 aa  210  7e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102638  normal  0.0226618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0611  adenine phosphoribosyltransferase  55.87 
 
 		 181 aa  210  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.112864 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3506  adenine phosphoribosyltransferase  53.63 
 
 		 181 aa  205  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.660561  normal  0.0396544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  54.49 
 
 		 181 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  53.76 
 
 		 181 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  52.51 
 
 		 181 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  56.98 
 
 		 175 aa  198  3e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  53.76 
 
 		 180 aa  198  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  53.76 
 
 		 181 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  53.18 
 
 		 179 aa  198  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  53.37 
 
 		 181 aa  197  9e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4317  adenine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 		 181 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  56.65 
 
 		 175 aa  195  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4990  adenine phosphoribosyltransferase  52.02 
 
 		 181 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4387  adenine phosphoribosyltransferase  52.02 
 
 		 199 aa  194  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0100341 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1789  adenine phosphoribosyltransferase  52.87 
 
 		 177 aa  192  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.935669  normal  0.019006 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2270  adenine phosphoribosyltransferase  50.87 
 
 		 180 aa  192  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.739798  normal  0.613668 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  51.45 
 
 		 179 aa  190  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2613  adenine phosphoribosyltransferase  50.87 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  56.02 
 
 		 170 aa  189  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2170  adenine phosphoribosyltransferase  51.14 
 
 		 188 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2784  adenine phosphoribosyltransferase  51.14 
 
 		 188 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2146  adenine phosphoribosyltransferase  52.6 
 
 		 186 aa  188  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6114  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 		 188 aa  187  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.38933  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4787  adenine phosphoribosyltransferase  50.85 
 
 		 184 aa  186  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13570  adenine phosphoribosyltransferase  53.33 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2795  adenine phosphoribosyltransferase  50.57 
 
 		 188 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.2159 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1995  adenine phosphoribosyltransferase  50.29 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.14545  normal  0.153368 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  53.76 
 
 		 171 aa  186  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0159  adenine phosphoribosyltransferase  50.87 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.577979  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  55.06 
 
 		 170 aa  186  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4134  adenine phosphoribosyltransferase  49.19 
 
 		 184 aa  186  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.488945 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3492  adenine phosphoribosyltransferase  49.19 
 
 		 184 aa  185  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  53.76 
 
 		 171 aa  185  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0363  adenine phosphoribosyltransferase  49.43 
 
 		 205 aa  185  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04860  adenine phosphoribosyltransferase  61.11 
 
 		 177 aa  184  5e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.289931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  52.33 
 
 		 179 aa  184  5e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  53.89 
 
 		 177 aa  184  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1836  adenine phosphoribosyltransferase  52.91 
 
 		 178 aa  184  7e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.820901  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0311  adenine phosphoribosyltransferase  47.13 
 
 		 190 aa  184  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0935  adenine phosphoribosyltransferase  55.49 
 
 		 175 aa  184  8e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1205  adenine phosphoribosyltransferase  52.91 
 
 		 172 aa  184  9e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0531  adenine phosphoribosyltransferase  49.43 
 
 		 188 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0784653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4239  adenine phosphoribosyltransferase  48.59 
 
 		 194 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0680  adenine phosphoribosyltransferase  51.52 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  56.71 
 
 		 172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  56.71 
 
 		 172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2844  adenine phosphoribosyltransferase  49.43 
 
 		 188 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.185899  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2702  adenine phosphoribosyltransferase  49.43 
 
 		 188 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.212838 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0588  adenine phosphoribosyltransferase  49.43 
 
 		 216 aa  182  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633676  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1719  adenine phosphoribosyltransferase  55.42 
 
 		 172 aa  182  3e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0453146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>