284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3097 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00466  N-carbamoyl-L-amino acid amidohydrolase  99.51 
 
 		 411 aa  858    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3097  allantoate amidohydrolase  100 
 
 		 411 aa  862    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0617  allantoate amidohydrolase  97.08 
 
 		 411 aa  839    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0580  allantoate amidohydrolase  88.56 
 
 		 411 aa  775    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.980604  normal  0.280695 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00471  hypothetical protein  99.51 
 
 		 411 aa  858    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0561  allantoate amidohydrolase  98.3 
 
 		 411 aa  852    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0554  allantoate amidohydrolase  99.51 
 
 		 411 aa  860    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0573  allantoate amidohydrolase  88.56 
 
 		 411 aa  775    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0634  allantoate amidohydrolase  88.81 
 
 		 411 aa  777    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0575  allantoate amidohydrolase  88.56 
 
 		 411 aa  775    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0590  allantoate amidohydrolase  98.05 
 
 		 411 aa  850    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0773  allantoate amidohydrolase  46.31 
 
 		 413 aa  392  1e-108  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  36.12 
 
 		 409 aa  244  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1154  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  36.14 
 
 		 399 aa  235  8e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.729668  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  36.34 
 
 		 429 aa  232  7.000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  34.67 
 
 		 425 aa  229  6e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  36.3 
 
 		 429 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4780  allantoate amidohydrolase  35.93 
 
 		 415 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0629  allantoate amidohydrolase  34.94 
 
 		 414 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  33.92 
 
 		 409 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  34.5 
 
 		 417 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.99 
 
 		 412 aa  217  2e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  36.16 
 
 		 409 aa  216  7e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  34.8 
 
 		 428 aa  216  7e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  35.18 
 
 		 412 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.23 
 
 		 407 aa  213  4.9999999999999996e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.41 
 
 		 447 aa  211  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2909  allantoate amidohydrolase  35.11 
 
 		 407 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.38 
 
 		 416 aa  210  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0027  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.68 
 
 		 413 aa  209  5e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.58 
 
 		 415 aa  209  7e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1546  allantoate amidohydrolase  35.47 
 
 		 414 aa  209  9e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  35.24 
 
 		 415 aa  208  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  33.5 
 
 		 425 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  33.5 
 
 		 425 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  33.42 
 
 		 416 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  35.08 
 
 		 408 aa  207  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4269  allantoate amidohydrolase  34.13 
 
 		 418 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4097  allantoate amidohydrolase  34.13 
 
 		 418 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal  0.717406 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1948  allantoate amidohydrolase  32.75 
 
 		 421 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.361736  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  32.99 
 
 		 411 aa  206  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3426  allantoate amidohydrolase  34.13 
 
 		 418 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0158  allantoate amidohydrolase  35.82 
 
 		 423 aa  206  8e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5235  allantoate amidohydrolase  33.17 
 
 		 407 aa  206  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.911931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  35.52 
 
 		 431 aa  206  9e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6028  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase  32.92 
 
 		 424 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  33.5 
 
 		 427 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.74 
 
 		 407 aa  204  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1498  allantoate amidohydrolase  34.92 
 
 		 414 aa  203  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  33.08 
 
 		 423 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4821  allantoate amidohydrolase  34.31 
 
 		 407 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  33.25 
 
 		 415 aa  202  7e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3345  allantoate amidohydrolase  34.31 
 
 		 407 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3964  allantoate amidohydrolase  34.7 
 
 		 414 aa  202  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.790477  normal  0.0143809 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  34.75 
 
 		 415 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3623  allantoate amidohydrolase  33.75 
 
 		 415 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4490  allantoate amidohydrolase  33.87 
 
 		 423 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.702219 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4170  allantoate amidohydrolase  34.07 
 
 		 407 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1622  allantoate amidohydrolase  33.67 
 
 		 418 aa  200  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.66 
 
 		 428 aa  199  7e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  34.26 
 
 		 410 aa  199  7.999999999999999e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3330  amidase, hydantoinase/carbamoylase  35.66 
 
 		 436 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2278  allantoate amidohydrolase  34.34 
 
 		 421 aa  198  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3508  allantoate amidohydrolase  33.07 
 
 		 418 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3991  allantoate amidohydrolase  33.07 
 
 		 418 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  34.34 
 
 		 433 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3896  allantoate amidohydrolase  32.39 
 
 		 412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  35.5 
 
 		 429 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  32.31 
 
 		 423 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  32.31 
 
 		 423 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2063  allantoate amidohydrolase  32.56 
 
 		 423 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  33.75 
 
 		 424 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1668  allantoate amidohydrolase  32.66 
 
 		 431 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  35.06 
 
 		 416 aa  196  8.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6086  amidase  35.61 
 
 		 421 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.315706 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3535  allantoate amidohydrolase  32.75 
 
 		 437 aa  195  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.51 
 
 		 418 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  30.24 
 
 		 411 aa  195  1e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0419  allantoate amidohydrolase  33 
 
 		 418 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1844  allantoate amidohydrolase  32.92 
 
 		 415 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  31.51 
 
 		 421 aa  195  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0218  allantoate amidohydrolase  33.25 
 
 		 429 aa  193  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0387479 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  32.2 
 
 		 430 aa  193  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  33.75 
 
 		 426 aa  193  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  34.66 
 
 		 415 aa  193  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  34.6 
 
 		 419 aa  193  5e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6087  amidase  34.77 
 
 		 429 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  33.42 
 
 		 416 aa  192  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  34.54 
 
 		 418 aa  192  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3071  allantoate amidohydrolase  34.18 
 
 		 421 aa  192  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4068  allantoate amidohydrolase  33.83 
 
 		 414 aa  192  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.99 
 
 		 426 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5723  amidase, hydantoinase/carbamoylase  34.77 
 
 		 523 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.5 
 
 		 420 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  34.62 
 
 		 422 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  34.64 
 
 		 426 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.5 
 
 		 420 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  33.83 
 
 		 411 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0228  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  32.55 
 
 		 422 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.185353  normal  0.235064 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0031  amidase, hydantoinase/carbamoylase  33.76 
 
 		 416 aa  190  5e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>