More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2906 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 240 aa  493  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  99.17 
 
 		 240 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  98.75 
 
 		 240 aa  488  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  99.17 
 
 		 240 aa  489  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  99.17 
 
 		 240 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  99.17 
 
 		 240 aa  489  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  99.17 
 
 		 240 aa  487  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  39.91 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  34.47 
 
 		 243 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  34.19 
 
 		 247 aa  142  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0016  GntR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 248 aa  142  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3895  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 238 aa  132  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4192  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0020  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4235  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5116  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4049  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.855147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0019  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3118  transcriptional regulator, GntR family  32.48 
 
 		 237 aa  130  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.180499  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  33.62 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  31 
 
 		 252 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  34.04 
 
 		 260 aa  122  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  33.19 
 
 		 241 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1621  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00823964  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  31.62 
 
 		 242 aa  118  9e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1740  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.40989  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 233 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  32.89 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 246 aa  116  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  34.93 
 
 		 244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 238 aa  115  6e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000013898  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1632  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.367647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  30.64 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  30.53 
 
 		 245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1727  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 236 aa  112  5e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2666  transcriptional regulator, GntR family  31.12 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  29.96 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0525  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0077  transcriptional regulator, GntR family  31.06 
 
 		 239 aa  108  7.000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 243 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 241 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3424  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.014089  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  29.71 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1099  histidine utilization repressor  31.16 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  30.97 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1710  GntR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 245 aa  105  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 248 aa  105  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  31.03 
 
 		 232 aa  105  5e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3593  transcriptional regulator, GntR family  28.17 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2077  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.340396  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5481  histidine utilization repressor  30.3 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.571458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2176  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2284  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3183  GntR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.529781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3530  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.814628  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  32.9 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  32.3 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4030  putative transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000148337  normal  0.107748 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3424  transcriptional regulator, GntR family  26.5 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  29.56 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  30.15 
 
 		 242 aa  102  4e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1833  transcriptional regulator, GntR family  26.07 
 
 		 245 aa  102  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0220411  normal  0.173691 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 258 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000263261 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5864  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3412  transcriptional regulator, GntR family  26.07 
 
 		 245 aa  102  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 258 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  32.18 
 
 		 238 aa  102  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 248 aa  102  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2288  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  28.12 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718754  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2365  histidine utilization repressor  30.35 
 
 		 231 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366137  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0646  histidine utilization repressor  30.35 
 
 		 231 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1680  histidine utilization repressor  30.35 
 
 		 231 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2666  histidine utilization repressor  30.35 
 
 		 231 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154672  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4060  transcriptional regulator, GntR family  30.53 
 
 		 245 aa  102  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.533333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>