20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2777 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00870  predicted lipoprotein  100 
 
 
171 aa  355  2e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.284686  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2731  putative lipoprotein  100 
 
 
171 aa  355  2e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.658274  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0969  putative lipoprotein  100 
 
 
171 aa  355  2e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00876  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  355  2e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272804  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2777  putative lipoprotein  100 
 
 
171 aa  355  2e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0075332  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0938  putative lipoprotein  98.25 
 
 
171 aa  349  1e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.200868  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2466  putative lipoprotein  97.66 
 
 
171 aa  346  7e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.835253  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1025  putative lipoprotein  91.81 
 
 
171 aa  329  1e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0893  putative lipoprotein  91.23 
 
 
171 aa  328  2e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1027  putative lipoprotein  84.21 
 
 
171 aa  300  7e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0964  putative lipoprotein  84.21 
 
 
171 aa  300  7e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0929  putative lipoprotein  84.21 
 
 
171 aa  300  7e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.621879  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1046  putative lipoprotein  84.21 
 
 
171 aa  299  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0996  putative lipoprotein  83.63 
 
 
171 aa  296  9e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.629941  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1381  putative lipoprotein  82.56 
 
 
172 aa  291  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.135623  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1657  putative lipoprotein  54.1 
 
 
182 aa  181  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.541556 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2708  putative lipoprotein  46.47 
 
 
191 aa  120  1e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1585  putative lipoprotein  46.47 
 
 
191 aa  120  1e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2623  putative lipoprotein  46.47 
 
 
191 aa  120  1e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2239  hypothetical protein  23.66 
 
 
181 aa  43.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60087  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>