28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2721 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00926  condesin subunit F  100 
 
 
440 aa  898  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00351613  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1025  condesin subunit F  98.18 
 
 
440 aa  886  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.252995  normal  0.616117 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1090  condesin subunit F  98.18 
 
 
440 aa  886  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.199303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1106  condesin subunit F  98.18 
 
 
440 aa  886  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.562569  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0998  condesin subunit F  98.18 
 
 
440 aa  886  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0762943  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1057  condesin subunit F  98.18 
 
 
440 aa  886  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.886679  normal  0.0551551 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1083  condesin subunit F  99.55 
 
 
440 aa  894  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  7.24748e-06  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2200  condesin subunit F  83.64 
 
 
440 aa  764  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00933  hypothetical protein  100 
 
 
440 aa  898  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00336906  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2301  condesin subunit F  85 
 
 
440 aa  775  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.370488  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1777  condesin subunit F  84.58 
 
 
441 aa  759  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.041681  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2049  condesin subunit F  83.45 
 
 
441 aa  748  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0678198  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2402  condesin subunit F  99.77 
 
 
440 aa  895  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  5.36027e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2198  condesin subunit F  100 
 
 
440 aa  898  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000709701  normal  0.0963487 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2674  condesin subunit F  99.77 
 
 
440 aa  897  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  3.12627e-05  normal  0.306812 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2657  condesin subunit F  84.77 
 
 
440 aa  780  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.533281  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1969  condesin subunit F  84.77 
 
 
440 aa  780  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1723  condesin subunit F  86.82 
 
 
440 aa  797  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.721184  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1021  condesin subunit F  100 
 
 
440 aa  898  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.78423e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1029  condesin subunit F  99.77 
 
 
440 aa  896  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000114842  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1441  condesin subunit F  95.23 
 
 
440 aa  864  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.308801  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2721  chromosome segregation and condensation protein MukF  100 
 
 
440 aa  898  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  8.2112e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2567  condesin subunit F  84.77 
 
 
440 aa  780  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0864  condesin subunit F  65.68 
 
 
440 aa  602  1e-171  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00596599  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0729  condesin subunit F  60.9 
 
 
445 aa  571  1e-161  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00740317  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1319  condesin subunit F  60.45 
 
 
445 aa  565  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.93264e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01587  condesin subunit F  59.55 
 
 
445 aa  558  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003936  chromosome partition protein MukF  59.1 
 
 
445 aa  556  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  7.0452e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>