29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2720 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2197  condesin subunit E  100 
 
 
234 aa  479  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00300903  normal  0.107372 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2401  condesin subunit E  100 
 
 
234 aa  479  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.041151  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1022  condesin subunit E  100 
 
 
234 aa  479  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  2.26094e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1030  condesin subunit E  100 
 
 
234 aa  479  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0304428  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2673  condesin subunit E  100 
 
 
234 aa  479  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  2.53852e-05  normal  0.163487 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1084  condesin subunit E  99.57 
 
 
243 aa  478  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.26764e-05  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2720  chromosome segregation and condensation protein MukE  100 
 
 
234 aa  479  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  6.71612e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0999  condesin subunit E  99.57 
 
 
243 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.029339  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1107  condesin subunit E  99.15 
 
 
234 aa  474  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.869463  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1058  condesin subunit E  99.15 
 
 
234 aa  474  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.422947  normal  0.0421691 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1026  condesin subunit E  99.57 
 
 
243 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.528099  normal  0.462438 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1091  condesin subunit E  99.15 
 
 
234 aa  474  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.802381  normal  0.281458 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00934  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  461  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0256751  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00927  condesin subunit E  100 
 
 
225 aa  461  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0268027  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1442  condesin subunit E  93.16 
 
 
234 aa  430  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.491442  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1724  condesin subunit E  82.08 
 
 
242 aa  407  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.375845  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2656  condesin subunit E  82.08 
 
 
242 aa  405  1e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.3975  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1970  condesin subunit E  82.08 
 
 
251 aa  404  1e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2566  condesin subunit E  82.08 
 
 
242 aa  405  1e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1778  condesin subunit E  80.83 
 
 
240 aa  394  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106258  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2050  condesin subunit E  80 
 
 
240 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.135973  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2300  condesin subunit E  83.57 
 
 
244 aa  371  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.608848  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2199  condesin subunit E  81.74 
 
 
238 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0865  condesin subunit E  68.9 
 
 
247 aa  303  1e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00171944  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003935  chromosome partition protein MukE  66.53 
 
 
241 aa  301  6e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0198734  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01588  condesin subunit E  66.11 
 
 
241 aa  300  2e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0728  condesin subunit E  68.93 
 
 
238 aa  299  2e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0231658  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1318  condesin subunit E  74.75 
 
 
231 aa  293  2e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00129388  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2096  thioredoxin-disulfide reductase  28.89 
 
 
260 aa  65.5  6e-10  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.184579  hitchhiker  0.00271395 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>