163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2611 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2611  PHP domain protein  100 
 
 
245 aa  508  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  5.86023e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01031  hypothetical protein  99.59 
 
 
245 aa  505  1e-142  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1153  putative hydrolase  99.18 
 
 
245 aa  503  1e-142  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01038  hypothetical protein  99.59 
 
 
245 aa  505  1e-142  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2565  putative hydrolase  99.59 
 
 
245 aa  505  1e-142  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.155213 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2099  putative hydrolase  99.59 
 
 
245 aa  505  1e-142  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.95835 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1152  putative hydrolase  99.59 
 
 
245 aa  505  1e-142  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0656771  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2295  putative hydrolase  99.59 
 
 
245 aa  505  1e-142  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.31426  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1412  putative hydrolase  99.59 
 
 
245 aa  505  1e-142  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0615585 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1232  putative hydrolase  89.39 
 
 
245 aa  444  1e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2054  putative hydrolase  89.39 
 
 
245 aa  444  1e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0675001  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2237  putative hydrolase  89.39 
 
 
245 aa  444  1e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.616812 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1247  putative hydrolase  88.98 
 
 
245 aa  440  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.428207 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1202  putative hydrolase  88.98 
 
 
245 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.499056  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2446  putative hydrolase  76.33 
 
 
245 aa  405  1e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1550  putative hydrolase  82.86 
 
 
245 aa  406  1e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.115806  normal  0.103219 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2165  putative hydrolase  76.33 
 
 
245 aa  405  1e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.213486  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2053  putative hydrolase  76.33 
 
 
245 aa  405  1e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1934  putative hydrolase  76.73 
 
 
245 aa  394  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000352911  hitchhiker  0.00478063 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1798  putative hydrolase  73.47 
 
 
245 aa  395  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489097  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2075  putative hydrolase  72.65 
 
 
245 aa  391  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674909  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2185  putative hydrolase  72.24 
 
 
245 aa  389  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2280  putative hydrolase  72.65 
 
 
245 aa  387  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0316  putative hydrolase  65.71 
 
 
244 aa  353  2e-96  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1706  putative hydrolase  64.75 
 
 
249 aa  338  6e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.946189 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1420  putative hydrolase  63.52 
 
 
247 aa  335  4e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0157701 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3709  putative hydrolase  63.93 
 
 
248 aa  328  4e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  2.75833e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1652  putative hydrolase  63.49 
 
 
252 aa  326  2e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2939  putative hydrolase  65.98 
 
 
246 aa  325  3e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2686  putative hydrolase  62.7 
 
 
252 aa  324  7e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.796861  unclonable  4.4786e-05 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1467  putative hydrolase  62.7 
 
 
254 aa  318  3e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1369  putative hydrolase  62.7 
 
 
251 aa  318  4e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.979942  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1472  putative hydrolase  62.7 
 
 
254 aa  318  5e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.855662  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1436  putative hydrolase  63.52 
 
 
260 aa  317  9e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2880  putative hydrolase  62.3 
 
 
254 aa  316  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014614 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1503  putative hydrolase  62.3 
 
 
254 aa  316  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2619  putative hydrolase  63.11 
 
 
252 aa  309  3e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000339322 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2794  putative hydrolase  62.7 
 
 
252 aa  308  5e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.165673 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2233  putative hydrolase  61.54 
 
 
251 aa  299  2e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0887  putative hydrolase  46.5 
 
 
247 aa  228  8e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0344  putative hydrolase  46.67 
 
 
250 aa  226  4e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00676194  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3868  putative hydrolase  47.72 
 
 
250 aa  223  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0341145  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001417  histidinol phosphatase  45.68 
 
 
248 aa  216  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04983  putative hydrolase  41.98 
 
 
251 aa  207  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001195  histidinol phosphatase  40.41 
 
 
251 aa  205  7e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1060  putative hydrolase  40.95 
 
 
245 aa  201  8e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.464705  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0111  putative hydrolase  41.59 
 
 
241 aa  198  5e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2586  putative hydrolase  42.36 
 
 
240 aa  190  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0073149  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2491  putative hydrolase  39.42 
 
 
248 aa  183  2e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.130978 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0620  putative hydrolase  38.79 
 
 
240 aa  183  2e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  6.19827e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4253  putative hydrolase  41.48 
 
 
237 aa  181  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2292  putative hydrolase  36.8 
 
 
239 aa  179  5e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0657  PHP domain protein  37.89 
 
 
235 aa  178  8e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2028  PHP domain protein  38.96 
 
 
238 aa  174  1e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.731698 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1950  putative hydrolase  37.83 
 
 
244 aa  173  3e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3933  putative hydrolase  40.87 
 
 
238 aa  170  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00241921  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4017  putative hydrolase  40.61 
 
 
238 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.59903e-24 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19230  biotin (acetyl-CoA carboxylase) synthetase  38.03 
 
 
239 aa  163  2e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0261596  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0627  phosphotransferase domain-containing protein  33.05 
 
 
242 aa  147  2e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  1.35059e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3779  PHP domain protein  34.48 
 
 
243 aa  142  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.262487  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0063  phosphotransferase domain-containing protein  29.69 
 
 
236 aa  127  2e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1177  phosphotransferase domain-containing protein  28.69 
 
 
243 aa  99.4  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.133886  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0109  PHP domain protein  25.19 
 
 
270 aa  93.2  3e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.165533 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3942  PHP domain protein  27.82 
 
 
245 aa  89.7  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.08896e-05  normal  0.54969 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2389  DNA polymerase X family protein  31.55 
 
 
584 aa  78.6  8e-14  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766089  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15900  PHP domain protein  26.07 
 
 
246 aa  73.6  3e-12  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00203207  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1600  PHP domain protein  28.76 
 
 
580 aa  70.1  3e-11  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6605  DNA-directed DNA polymerase  28.69 
 
 
586 aa  70.1  3e-11  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.403533  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2447  PHP domain protein  31.37 
 
 
580 aa  69.3  5e-11  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.335837  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0486  PHP-like protein  26.57 
 
 
574 aa  68.2  1e-10  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1792  DNA-directed DNA polymerase  29.1 
 
 
576 aa  67.8  1e-10  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0112  PHP domain protein  28.02 
 
 
562 aa  65.9  5e-10  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3374  PHP domain protein  28.57 
 
 
349 aa  64.7  1e-09  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13892  hypothetical protein  28.15 
 
 
335 aa  64.7  1e-09  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3241  hypothetical protein  26.64 
 
 
572 aa  64.7  1e-09  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287288  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0614  hypothetical protein  26.86 
 
 
344 aa  64.7  1e-09  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00333574 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0395  hypothetical protein  28.17 
 
 
339 aa  64.3  2e-09  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6300  DNA-directed DNA polymerase  27.92 
 
 
560 aa  63.9  2e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984431  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1901  PHP domain protein  29.13 
 
 
347 aa  63.9  2e-09  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05670  DNA polymerase X family protein  29.24 
 
 
573 aa  64.3  2e-09  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4679  hypothetical protein  28.04 
 
 
572 aa  63.2  3e-09  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0956211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4286  hypothetical protein  28.04 
 
 
572 aa  63.2  4e-09  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000879454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4297  hypothetical protein  28.04 
 
 
572 aa  63.2  4e-09  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.558706  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2025  PHP domain protein  22.59 
 
 
275 aa  63.2  4e-09  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4666  hypothetical protein  28.04 
 
 
573 aa  63.2  4e-09  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.0928e-12 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1634  phosphotransferase domain-containing protein  25.75 
 
 
569 aa  63.2  4e-09  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4036  hypothetical protein  26.25 
 
 
381 aa  62.4  6e-09  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0575  hypothetical protein  27.1 
 
 
573 aa  62.4  7e-09  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  4.26901e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0958  PHP domain protein  27.32 
 
 
574 aa  62  9e-09  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0038338  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1064  hypothetical protein  26.14 
 
 
339 aa  62  9e-09  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4679  hypothetical protein  28.04 
 
 
573 aa  61.6  1e-08  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.48289e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4663  hypothetical protein  27.57 
 
 
573 aa  61.6  1e-08  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00758489  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1154  phosphotransferase domain-containing protein  27.51 
 
 
578 aa  61.6  1e-08  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  2.51601e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1105  DNA-dependent DNA polymerase family X protein  28.16 
 
 
557 aa  61.2  1e-08  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0282445  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4448  hypothetical protein  28.04 
 
 
572 aa  60.8  2e-08  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4795  hypothetical protein  28.04 
 
 
572 aa  60.8  2e-08  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.114766  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4381  hypothetical protein  27.1 
 
 
572 aa  60.5  3e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150026  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1963  phosphotransferase domain-containing protein  28.44 
 
 
614 aa  60.1  3e-08  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4254  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4395  hypothetical protein  26.64 
 
 
337 aa  59.7  4e-08  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4412  PHP domain protein  30.54 
 
 
579 aa  59.3  5e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103593  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>