40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2603 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_2603  cryptic curlin major subunit  100 
 
 
151 aa  295  1e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.761097  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01046  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  295  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2557  cryptic curlin major subunit  100 
 
 
151 aa  295  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.363061 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1162  cryptic curlin major subunit  100 
 
 
151 aa  295  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.596928  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1161  cryptic curlin major subunit  100 
 
 
151 aa  295  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.401607  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01039  cryptic curlin major subunit  100 
 
 
151 aa  295  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2089  cryptic curlin major subunit  98.01 
 
 
151 aa  289  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.226612 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1422  cryptic curlin major subunit  96.71 
 
 
152 aa  248  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1558  cryptic curlin major subunit  80.79 
 
 
149 aa  218  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0820633  normal  0.586693 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2229  cryptic curlin major subunit  74.83 
 
 
151 aa  196  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2046  cryptic curlin major subunit  74.83 
 
 
151 aa  196  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00217142  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1210  cryptic curlin major subunit  74.83 
 
 
151 aa  196  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.519836  normal  0.270462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1255  cryptic curlin major subunit  74.83 
 
 
151 aa  196  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.662472 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1240  cryptic curlin major subunit  74.83 
 
 
151 aa  196  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1515  curlin-associated protein  33.04 
 
 
178 aa  46.2  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0646  curlin-associated protein  33.72 
 
 
143 aa  46.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000139477 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2946  minor curlin subunit CsgB, putative  36.63 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0924  curlin associated  32.89 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.370381  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  28.99 
 
 
552 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2550  curlin-associated protein  26.62 
 
 
481 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.895792  normal  0.0129391 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0842  curlin-associated protein  32.67 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0877  curlin-associated protein  32.67 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3094  curlin associated  32 
 
 
142 aa  43.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.884996  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2955  curlin-associated protein  31.37 
 
 
481 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0863246  normal  0.318983 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0864  Curlin associated repeat protein  29.11 
 
 
496 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0841  curlin-associated protein  29.11 
 
 
496 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2364  curlin-associated protein  25.97 
 
 
498 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0876  curlin-associated protein  29.11 
 
 
496 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3136  curlin-associated protein  28.95 
 
 
496 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3235  curlin-associated protein  33.33 
 
 
627 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0865  hypothetical protein  27.34 
 
 
502 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2551  curlin-associated protein  34.29 
 
 
157 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0240208 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0721  curlin-associated protein  28.91 
 
 
502 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000376706  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2416  hypothetical protein  33.71 
 
 
235 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3413  curlin-associated protein  28.91 
 
 
502 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.602514  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3499  curlin-associated protein  29.32 
 
 
496 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.95975  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0865  Curlin associated repeat protein  31.68 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3498  curlin-associated protein  31.68 
 
 
139 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.477257  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2172  curlin-associated protein  33.04 
 
 
170 aa  40.8  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.650786  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2954  curlin-associated protein  34.29 
 
 
156 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.218501  normal  0.263199 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>