174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2597 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_1661  glucan biosynthesis protein G  75.35 
 
 
528 aa  831  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0373  glucan biosynthesis protein G  68.87 
 
 
604 aa  734  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.999536  normal  0.439463 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2223  glucan biosynthesis protein G  93.42 
 
 
517 aa  1017  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.966209 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2039  glucan biosynthesis protein G  93.62 
 
 
517 aa  1019  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  3.31819e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1217  glucan biosynthesis protein G  93.62 
 
 
517 aa  1019  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.534696  normal  0.211172 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1261  glucan biosynthesis protein G  93.62 
 
 
517 aa  1019  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.726393  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1246  glucan biosynthesis protein G  93.62 
 
 
517 aa  1019  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.628758  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1170  glucan biosynthesis protein G  99.8 
 
 
511 aa  1058  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0753618  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67090  glucan biosynthesis protein G  69.17 
 
 
525 aa  749  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.755776  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1169  glucan biosynthesis protein G  99.8 
 
 
511 aa  1058  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.163218  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4900  glucan biosynthesis protein G  62.23 
 
 
579 aa  733  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.766057 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2282  glucan biosynthesis protein G  99.8 
 
 
511 aa  1058  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.29021  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1870  glucan biosynthesis protein G  76.98 
 
 
522 aa  852  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.698965 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5076  glucan biosynthesis protein G  62.48 
 
 
559 aa  730  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0439  glucan biosynthesis protein G  61.59 
 
 
579 aa  729  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.529505  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2081  glucan biosynthesis protein G  99.81 
 
 
517 aa  1071  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.242328  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2551  glucan biosynthesis protein G  99.8 
 
 
511 aa  1058  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  normal  0.55547 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1428  glucan biosynthesis protein G  99.81 
 
 
517 aa  1071  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0037891  normal  0.223049 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01045  glucan biosynthesis protein, periplasmic  100 
 
 
511 aa  1059  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0678082  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5026  glucan biosynthesis protein G  63.02 
 
 
559 aa  737  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2597  periplasmic glucan biosynthesis protein MdoG  100 
 
 
517 aa  1073  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  4.03052e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1604  glucan biosynthesis protein G  75.68 
 
 
522 aa  840  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5162  periplasmic glucan biosynthesis protein  65.33 
 
 
641 aa  702  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1564  glucan biosynthesis protein G  90.93 
 
 
533 aa  975  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  8.05878e-05  normal  0.762961 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01052  hypothetical protein  100 
 
 
511 aa  1059  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0739536  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1570  glucan biosynthesis protein G  74.51 
 
 
522 aa  828  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2523  glucan biosynthesis protein G  76.65 
 
 
522 aa  855  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.586165  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1552  glucan biosynthesis protein G  74.95 
 
 
511 aa  830  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2828  glucan biosynthesis protein G  76.46 
 
 
522 aa  855  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0377  glucan biosynthesis protein G  65.53 
 
 
642 aa  712  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.713899  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5817  glucan biosynthesis protein D  68.97 
 
 
525 aa  748  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470464  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3236  glucan biosynthesis protein G  62.57 
 
 
511 aa  687  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45510  glucan biosynthesis protein D  60.2 
 
 
517 aa  662  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104074  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45530  glucan biosynthesis protein G  66.34 
 
 
505 aa  727  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.536607  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3996  glucan biosynthesis protein G  56.42 
 
 
536 aa  630  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00021174  normal  0.469553 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3154  glucan biosynthesis protein G  55.14 
 
 
520 aa  552  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0128218 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2805  glucan biosynthesis protein G  55.14 
 
 
530 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2908  glucan biosynthesis protein G  54.32 
 
 
504 aa  547  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1285  glucan biosynthesis protein G  49.13 
 
 
519 aa  536  1e-151  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4755  glucan biosynthesis protein G  49.8 
 
 
588 aa  532  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708858  normal  0.22294 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4033  glucan biosynthesis protein G  49.4 
 
 
533 aa  533  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450444  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1311  glucan biosynthesis protein G  46.75 
 
 
514 aa  476  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2785  glucan biosynthesis protein G  46.82 
 
 
522 aa  456  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1116  glucan biosynthesis protein G  42.89 
 
 
541 aa  433  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0593  glucan biosynthesis protein D  43.06 
 
 
522 aa  430  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  1.24621e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3095  glucan biosynthesis protein G  44.67 
 
 
498 aa  426  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.3866  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3377  glucan biosynthesis protein G  44.38 
 
 
527 aa  423  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.26598  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3863  glucan biosynthesis protein D  40.79 
 
 
519 aa  403  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0232574 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1794  glucan biosynthesis protein G  41.09 
 
 
514 aa  401  1e-110  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.051512  normal  0.535359 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2580  glucan biosynthesis protein D  39.13 
 
 
529 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2793  glucan biosynthesis protein G  43.89 
 
 
546 aa  391  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2780  glucan biosynthesis protein G  40.94 
 
 
503 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.309239  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2251  glucan biosynthesis protein G  41.32 
 
 
495 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0668203  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3220  glucan biosynthesis protein D  40.49 
 
 
503 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.321251  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3487  glucan biosynthesis protein D  40.93 
 
 
608 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  2.42416e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3412  glucan biosynthesis protein D  40.93 
 
 
562 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  2.8825e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3021  glucan biosynthesis protein D  40.93 
 
 
594 aa  383  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3610  glucan biosynthesis protein D  40.93 
 
 
562 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  3.23201e-05  normal  0.858477 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0877  glucan biosynthesis protein D  40.93 
 
 
562 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  4.43395e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1650  glucan biosynthesis protein G  40.66 
 
 
532 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1051  glucan biosynthesis protein D  40.94 
 
 
597 aa  384  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0926  glucan biosynthesis protein D  40.38 
 
 
604 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  3.74583e-05  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4296  glucan biosynthesis protein D  42.74 
 
 
568 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000183317 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0445  glucan biosynthesis protein G  40.04 
 
 
542 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3046  glucan biosynthesis protein D  40.73 
 
 
604 aa  379  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  7.32267e-06  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0889  glucan biosynthesis protein D  40.38 
 
 
558 aa  378  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  6.29377e-06  normal  0.387819 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1670  glucan biosynthesis protein G  40.16 
 
 
498 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0233  glucan biosynthesis protein D  42.13 
 
 
530 aa  374  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1712  glucan biosynthesis protein G  41.98 
 
 
540 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15106  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1791  glucan biosynthesis protein D  40.57 
 
 
525 aa  371  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.315041 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2135  glucan biosynthesis protein G  40.04 
 
 
528 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3043  glucan biosynthesis protein D  39.84 
 
 
534 aa  365  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0500489  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1081  glucan biosynthesis protein G  39.96 
 
 
533 aa  364  2e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.418062  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1887  glucan biosynthesis protein G  39.3 
 
 
545 aa  362  1e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1829  glucan biosynthesis protein G  39.09 
 
 
545 aa  362  1e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2148  glucan biosynthesis protein G  39.09 
 
 
545 aa  360  5e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0089817  normal  0.333418 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2081  glucan biosynthesis protein G  39.22 
 
 
544 aa  358  9e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2107  glucan biosynthesis protein G  38.64 
 
 
498 aa  358  1e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2007  glucan biosynthesis protein G  39.38 
 
 
545 aa  358  1e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0907  glucan biosynthesis protein D  38.52 
 
 
545 aa  357  2e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  2.01606e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1691  glucan biosynthesis protein G  39.92 
 
 
540 aa  357  4e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.0773488 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2321  glucan biosynthesis protein G  39.71 
 
 
539 aa  357  4e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.405289  normal  0.314726 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0141  glucan biosynthesis protein D  38.78 
 
 
534 aa  355  1e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0359657 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1929  glucan biosynthesis protein G  38.81 
 
 
542 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.178013  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2397  glucan biosynthesis protein G  38.81 
 
 
542 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000106178  normal  0.024996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2046  glucan biosynthesis protein G  39.51 
 
 
539 aa  354  2e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.324147  normal  0.558823 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1896  glucan biosynthesis protein G  39.22 
 
 
542 aa  353  3e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.465098  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1922  glucan biosynthesis protein G  39.22 
 
 
542 aa  353  3e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.09795e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3848  glucan biosynthesis protein G  38.84 
 
 
559 aa  353  6e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0125  glucan biosynthesis protein G  40.45 
 
 
540 aa  352  1e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1762  glucan biosynthesis protein G  40.45 
 
 
540 aa  352  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.746379 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1075  glucan biosynthesis protein D  35.65 
 
 
514 aa  351  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0960  glucan biosynthesis protein D  35.65 
 
 
514 aa  351  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1302  glucan biosynthesis protein G  39.52 
 
 
530 aa  347  3e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1158  glucan biosynthesis protein G  40.17 
 
 
527 aa  347  4e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.025306 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2990  glucan biosynthesis protein D  38.66 
 
 
560 aa  346  6e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3337  glucan biosynthesis protein D  38.97 
 
 
560 aa  340  5e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1130  glucan biosynthesis protein G  37.68 
 
 
519 aa  338  2e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.700993 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3126  glucan biosynthesis protein G  39.27 
 
 
525 aa  337  4e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.213498  normal  0.0516686 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3057  glucan biosynthesis protein D  38.92 
 
 
507 aa  336  5e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445662  normal  0.366151 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>