287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2398 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01224  voltage-gated potassium channel  99.76 
 
 
417 aa  839  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1419  voltage-gated potassium channel  99.52 
 
 
417 aa  837  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0226544  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1359  voltage-gated potassium channel  99.76 
 
 
417 aa  839  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.9785e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1398  voltage-gated potassium channel  99.52 
 
 
417 aa  838  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.488594  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2377  voltage-gated potassium channel  99.76 
 
 
417 aa  839  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408742  hitchhiker  2.1243e-06 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1890  voltage-gated potassium channel  99.25 
 
 
402 aa  802  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0139159 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01234  hypothetical protein  99.76 
 
 
417 aa  839  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.302174  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2398  TrkA-N domain protein  100 
 
 
417 aa  842  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00329227  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1737  voltage-gated potassium channel  99.5 
 
 
402 aa  804  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000607493  normal  0.0325074 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3093  voltage-gated potassium channel  40.96 
 
 
420 aa  266  3e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2691  voltage-gated potassium channel  40.96 
 
 
420 aa  266  3e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0127487 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0391  voltage-gated potassium channel  39.35 
 
 
416 aa  260  3e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131379  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1087  voltage-gated potassium channel  38.54 
 
 
391 aa  244  1e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1141  voltage-gated potassium channel  38.54 
 
 
391 aa  244  1e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.378703  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3564  voltage-gated potassium channel  40.3 
 
 
391 aa  243  4e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3716  voltage-gated potassium channel  39.09 
 
 
391 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.947773 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3219  voltage-gated potassium channel  39.64 
 
 
391 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.630222 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4068  voltage-gated potassium channel  39.64 
 
 
391 aa  239  7e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4298  voltage-gated potassium channel  39.64 
 
 
391 aa  239  7e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1715  voltage-gated potassium channel  38.92 
 
 
391 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2922  voltage-gated potassium channel  38.62 
 
 
408 aa  229  6e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2537  voltage-gated potassium channel  39.17 
 
 
438 aa  229  9e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.863959  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  30.56 
 
 
393 aa  137  3e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  30.5 
 
 
388 aa  135  1e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  30.4 
 
 
395 aa  133  5e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  30.4 
 
 
395 aa  124  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  27.62 
 
 
399 aa  124  4e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1058  TrkA-N domain protein  30.94 
 
 
396 aa  114  2e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  28.99 
 
 
325 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  31.28 
 
 
350 aa  98.6  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  28.02 
 
 
355 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3583e-11 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  29.21 
 
 
335 aa  97.8  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  30.23 
 
 
345 aa  97.1  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  28.69 
 
 
332 aa  96.3  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  29.91 
 
 
332 aa  95.1  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  27.72 
 
 
335 aa  94.4  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  29.51 
 
 
531 aa  94  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  28.09 
 
 
347 aa  93.2  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  31.78 
 
 
335 aa  93.2  8e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  4.39413e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  27.72 
 
 
335 aa  93.2  8e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  25 
 
 
330 aa  92.8  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  30 
 
 
331 aa  92  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  26.61 
 
 
362 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  25.1 
 
 
341 aa  90.5  5e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  24.78 
 
 
330 aa  90.1  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  27.56 
 
 
509 aa  88.2  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  27.43 
 
 
336 aa  88.2  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  24.67 
 
 
330 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  24.67 
 
 
330 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  24.67 
 
 
334 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  24.67 
 
 
334 aa  87.8  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.93674e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  25.11 
 
 
330 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  25.13 
 
 
351 aa  87  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  25.13 
 
 
351 aa  87  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  25.55 
 
 
337 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  25.62 
 
 
338 aa  86.7  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  1.59336e-12  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  26.03 
 
 
352 aa  85.1  2e-15  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  24.62 
 
 
351 aa  85.5  2e-15  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  26.32 
 
 
346 aa  84.7  3e-15  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  25.12 
 
 
354 aa  84.3  4e-15  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  26.1 
 
 
341 aa  83.2  8e-15  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  25.32 
 
 
352 aa  83.2  9e-15  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  25.71 
 
 
355 aa  82.4  1e-14  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  29.44 
 
 
359 aa  82.4  1e-14  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  24.1 
 
 
351 aa  82.4  1e-14  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  25.24 
 
 
371 aa  82  2e-14  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  28.3 
 
 
335 aa  80.5  5e-14  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  22.97 
 
 
351 aa  80.1  7e-14  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  27.66 
 
 
517 aa  80.1  7e-14  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  26.27 
 
 
333 aa  79.7  8e-14  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  25.1 
 
 
356 aa  79  1e-13  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0972  hypothetical protein  26.38 
 
 
376 aa  78.2  2e-13  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.625398  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  22.12 
 
 
332 aa  78.6  2e-13  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  25.13 
 
 
352 aa  79  2e-13  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  23.24 
 
 
351 aa  77.8  3e-13  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  26.5 
 
 
341 aa  77.8  4e-13  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  28.34 
 
 
339 aa  77  6e-13  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  25.5 
 
 
351 aa  77  6e-13  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  29.63 
 
 
324 aa  76.6  7e-13  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  24.7 
 
 
356 aa  76.3  9e-13  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3113  potassium channel protein  26.32 
 
 
347 aa  75.9  1e-12  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.144823  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  24.8 
 
 
376 aa  76.3  1e-12  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  23.92 
 
 
350 aa  74.3  3e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  22.51 
 
 
350 aa  74.3  4e-12  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  26.34 
 
 
346 aa  73.9  5e-12  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4403  TrkA domain-containing protein  25.79 
 
 
341 aa  73.9  5e-12  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602366  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0989  Ion transport 2 domain-containing protein  24 
 
 
344 aa  73.6  6e-12  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.369667 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  25.35 
 
 
357 aa  71.6  2e-11  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  22.08 
 
 
350 aa  72  2e-11  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  23.39 
 
 
346 aa  72  2e-11  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  22.77 
 
 
350 aa  70.5  6e-11  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  23.71 
 
 
366 aa  70.1  7e-11  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  23.98 
 
 
350 aa  70.1  8e-11  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  24.45 
 
 
346 aa  69.7  9e-11  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  24.45 
 
 
346 aa  69.3  1e-10  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  24 
 
 
350 aa  69.3  1e-10  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  5.96347e-06  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0721  hypothetical protein  23.56 
 
 
335 aa  68.6  2e-10  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0396  TrkA domain-containing protein  26.16 
 
 
457 aa  67.8  3e-10  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1810  Ion transport 2 domain protein  24.05 
 
 
345 aa  68.2  3e-10  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.236415  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0697  TrkA domain-containing protein  26.2 
 
 
345 aa  68.2  3e-10  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.793307 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>