126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2330 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1961  glycosyl hydrolase, family 65  98.15 
 
 
755 aa  1550  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.756125  normal  0.752383 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1527  glycosy hydrolase family protein  97.35 
 
 
755 aa  1533  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01304  hypothetical protein  99.34 
 
 
755 aa  1563  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.95805  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2158  Kojibiose phosphorylase  60.58 
 
 
757 aa  947  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.848315 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1431  glycosy hydrolase family protein  99.87 
 
 
755 aa  1569  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01293  predicted hydrolase  99.34 
 
 
755 aa  1563  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.940342  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2309  Kojibiose phosphorylase  99.87 
 
 
755 aa  1569  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1806  glycosy hydrolase family protein  93.91 
 
 
755 aa  1493  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.769957  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2330  Kojibiose phosphorylase  100 
 
 
755 aa  1572  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.21539  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1530  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  40.99 
 
 
759 aa  612  1e-174  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00420  Kojibiose phosphorylase  39.81 
 
 
780 aa  557  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0398  Kojibiose phosphorylase  32.1 
 
 
755 aa  391  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00143976  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3917  Kojibiose phosphorylase  32.98 
 
 
748 aa  369  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.057945 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2202  Kojibiose phosphorylase  30.88 
 
 
775 aa  365  1e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.387396  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0140  Kojibiose phosphorylase  29.89 
 
 
763 aa  357  5e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2264  Kojibiose phosphorylase  32.78 
 
 
720 aa  348  1e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.170179  hitchhiker  1.28676e-06 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14560  Kojibiose phosphorylase  29.35 
 
 
778 aa  349  1e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  5.28962e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1194  Kojibiose phosphorylase  30.37 
 
 
787 aa  347  6e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1550  Kojibiose phosphorylase  30.46 
 
 
789 aa  344  4e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0811  Kojibiose phosphorylase  31.51 
 
 
787 aa  343  6e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.427192  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  32.51 
 
 
978 aa  342  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  32.05 
 
 
965 aa  339  9e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1264  glycosy hydrolase family protein  29.53 
 
 
781 aa  335  1e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.353218  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0919  Kojibiose phosphorylase  29.99 
 
 
794 aa  335  2e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.570777 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20830  Kojibiose phosphorylase  29.49 
 
 
769 aa  332  2e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2279  glycoside hydrolase family protein  31 
 
 
759 aa  330  5e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.7939 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0403  Kojibiose phosphorylase  29.81 
 
 
781 aa  328  2e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.10881  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1203  Kojibiose phosphorylase  30.75 
 
 
807 aa  327  4e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.204393  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2193  Kojibiose phosphorylase  27.43 
 
 
780 aa  325  2e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1281  Kojibiose phosphorylase  32.5 
 
 
761 aa  318  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0038  Kojibiose phosphorylase  32.92 
 
 
761 aa  316  9e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3421  Kojibiose phosphorylase  28.91 
 
 
858 aa  316  1e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3243  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  28.42 
 
 
749 aa  315  2e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20570  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  29.31 
 
 
843 aa  313  5e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.414924 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02160  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  29.37 
 
 
825 aa  312  2e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09380  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  29.28 
 
 
848 aa  311  3e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2869  Kojibiose phosphorylase  40.79 
 
 
760 aa  310  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.173251  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1874  Kojibiose phosphorylase  27.7 
 
 
753 aa  310  6e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0562  Kojibiose phosphorylase  30.61 
 
 
795 aa  310  6e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8722  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  37.78 
 
 
762 aa  310  7e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909698  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0497  Kojibiose phosphorylase  30.75 
 
 
795 aa  310  7e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3313  Kojibiose phosphorylase  30.07 
 
 
748 aa  307  4e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0533  Kojibiose phosphorylase  30.56 
 
 
795 aa  305  3e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.704179 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2116  Kojibiose phosphorylase  30.33 
 
 
834 aa  303  6e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1117  glycosy hydrolase family protein  27.21 
 
 
780 aa  298  3e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.158926  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6156  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  40.79 
 
 
777 aa  297  6e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0036  Kojibiose phosphorylase  27.63 
 
 
790 aa  295  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0720168  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1279  Kojibiose phosphorylase  27.63 
 
 
790 aa  293  9e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.192796  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1016  Kojibiose phosphorylase  28.72 
 
 
776 aa  279  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.313972 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4269  Kojibiose phosphorylase  29.19 
 
 
767 aa  276  1e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1809  Kojibiose phosphorylase  30.55 
 
 
784 aa  275  2e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3033  Kojibiose phosphorylase  29.37 
 
 
780 aa  275  2e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.10218  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0054  maltose phosphorylase  27.4 
 
 
750 aa  273  1e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  2.86879e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2513  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  29.05 
 
 
786 aa  272  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1493  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  28.34 
 
 
786 aa  270  6e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.310066  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0980  glycosy hydrolase family protein  27.55 
 
 
789 aa  269  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.966041  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2962  Kojibiose phosphorylase  28.41 
 
 
778 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000307404  normal  0.340362 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0216  maltose phosphorylase  26.53 
 
 
758 aa  263  9e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000286832  hitchhiker  3.74663e-06 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  27.38 
 
 
1053 aa  263  1e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0308  Kojibiose phosphorylase  28.91 
 
 
786 aa  262  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2716  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  29.9 
 
 
787 aa  263  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4347  glycoside hydrolase family protein  28.93 
 
 
804 aa  259  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.138652  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27210  trehalose/maltose hydrolase or phosphorylase  28.12 
 
 
807 aa  257  5e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0585996  normal  0.801027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0241  Kojibiose phosphorylase  28.06 
 
 
800 aa  257  5e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.02 
 
 
1051 aa  256  1e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0995  maltose phosphorylase  27.43 
 
 
752 aa  256  1e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0531  Kojibiose phosphorylase  28.27 
 
 
781 aa  253  7e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1437  Kojibiose phosphorylase  26.5 
 
 
788 aa  253  9e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217423  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1747  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  26.82 
 
 
778 aa  253  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0525  Kojibiose phosphorylase  28.95 
 
 
791 aa  252  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.659551  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1401  maltose phosphorylase  27.24 
 
 
767 aa  252  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.900484  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0190  maltose phosphorylase  26.68 
 
 
765 aa  252  2e-65  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  27.64 
 
 
1050 aa  251  3e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  25.56 
 
 
1051 aa  251  4e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.29 
 
 
1053 aa  250  6e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0839  maltose phosphorylase  27.29 
 
 
710 aa  249  1e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0771265  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0894  maltose phosphorylase  26.99 
 
 
752 aa  248  4e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05085  Trehalose/maltose hydrolase (phosphorylase)  25.36 
 
 
768 aa  247  5e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3531  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  30.33 
 
 
794 aa  247  5e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.607347  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2756  maltose phosphorylase  27.18 
 
 
771 aa  246  1e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.264043 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5087  maltose phosphorylase  27.37 
 
 
774 aa  246  1e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.076109  normal  0.646973 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0768  Trehalose 6-phosphate phosphorylase  27.6 
 
 
904 aa  246  1e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261171  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2817  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  27.18 
 
 
810 aa  246  1e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0216244  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0438  Kojibiose phosphorylase  28.38 
 
 
791 aa  245  2e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0346  trehalose 6-phosphate phosphorylase  27.72 
 
 
807 aa  244  4e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0553991  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  26.02 
 
 
1052 aa  242  2e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1847  maltose phosphorylase  26.94 
 
 
751 aa  242  2e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  25.92 
 
 
1055 aa  242  2e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1472  Kojibiose phosphorylase  27.99 
 
 
790 aa  241  5e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.299549 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1188  Kojibiose phosphorylase  28.99 
 
 
787 aa  238  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.399982  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1171  glycoside hydrolase family protein  28.99 
 
 
787 aa  238  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1198  Kojibiose phosphorylase  28.99 
 
 
787 aa  238  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.51521  normal  0.0335974 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1109  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  29.02 
 
 
788 aa  238  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.824966  normal  0.328257 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5750  Kojibiose phosphorylase  29.01 
 
 
794 aa  236  8e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.06218  normal  0.0760433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6405  Kojibiose phosphorylase  27.63 
 
 
784 aa  236  2e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.338097  normal  0.788674 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0089  glycoside hydrolase family 65 central catalytic  27.07 
 
 
777 aa  234  6e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472584  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  26.5 
 
 
1088 aa  233  9e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3407  HAD family hydrolase  26.82 
 
 
1215 aa  230  8e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.377185  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3418  HAD family hydrolase  26.82 
 
 
1215 aa  230  8e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.059768  normal  0.266902 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3470  HAD family hydrolase  26.82 
 
 
1215 aa  230  8e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0400404 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>