28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2295 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01326  recombination and repair protein  100 
 
 
269 aa  558  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2295  RecT protein  100 
 
 
269 aa  558  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  1.33363e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01336  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  558  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1382  recombination and repair protein RecT  92.16 
 
 
276 aa  515  1e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  2.54024e-15 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0604  recombination and repair protein RecT  53.25 
 
 
281 aa  241  7e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1472  recombination and repair protein RecT  48.51 
 
 
300 aa  224  1e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.515262  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1851  RecT protein  46.19 
 
 
349 aa  215  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0204847  decreased coverage  3.11645e-10 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2617  recombination and repair protein RecT  48.08 
 
 
268 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000206281  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7123  RecT protein  38.43 
 
 
351 aa  181  8e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0610415  hitchhiker  0.000150871 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2699  rect protein  38.12 
 
 
294 aa  138  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.497074  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2507  RecT protein  38.58 
 
 
318 aa  122  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5094  RecT protein  38.54 
 
 
320 aa  118  1e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.713826  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4075  RecT protein  37.56 
 
 
312 aa  115  7e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4008  RecT protein  30.17 
 
 
299 aa  102  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275216  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3047  RecT protein  29.55 
 
 
313 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00571481  normal  0.0332137 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1916  RecT protein  31.84 
 
 
307 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.427469  hitchhiker  8.11142e-11 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0939  RecT family protein  26.46 
 
 
289 aa  81.3  2e-14  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1419  phage recombinase  31.19 
 
 
311 aa  80.9  2e-14  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  4.44725e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0283  RecT family protein  29.91 
 
 
300 aa  78.6  9e-14  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0811  RecT protein  27.23 
 
 
309 aa  73.9  3e-12  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.481078  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4070  RecT protein  31.21 
 
 
319 aa  72.8  5e-12  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0866384  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1674  recombinational DNA repair protein (RecE pathway)  25.37 
 
 
310 aa  69.7  5e-11  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1003  RecT protein  29.45 
 
 
303 aa  64.7  1e-09  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  hitchhiker  3.88428e-05 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1139  RecT protein  25.25 
 
 
329 aa  57  3e-07  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2078  RecT protein  29.07 
 
 
306 aa  49.7  5e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2041  RecT protein  29.07 
 
 
306 aa  49.7  5e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0320  RecT protein  29.07 
 
 
306 aa  49.7  5e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0329  RecT protein  29.07 
 
 
306 aa  49.7  5e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>