28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2295 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2295  RecT protein  100 
 
 		 269 aa  558  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000133363  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01326  recombination and repair protein  100 
 
 		 269 aa  558  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01336  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  558  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1382  recombination and repair protein RecT  92.16 
 
 		 276 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000254024 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0604  recombination and repair protein RecT  53.25 
 
 		 281 aa  241  7e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1472  recombination and repair protein RecT  48.51 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.515262  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1851  RecT protein  46.19 
 
 		 349 aa  215  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0204847  decreased coverage  0.000000000311645 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2617  recombination and repair protein RecT  48.08 
 
 		 268 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000206281  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7123  RecT protein  38.43 
 
 		 351 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0610415  hitchhiker  0.000150871 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2699  rect protein  38.12 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.497074  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2507  RecT protein  38.58 
 
 		 318 aa  122  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5094  RecT protein  38.54 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.713826  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4075  RecT protein  37.56 
 
 		 312 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4008  RecT protein  30.17 
 
 		 299 aa  102  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3047  RecT protein  29.55 
 
 		 313 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00571481  normal  0.0332137 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1916  RecT protein  31.84 
 
 		 307 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.427469  hitchhiker  0.0000000000811142 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0939  RecT family protein  26.46 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1419  phage recombinase  31.19 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000444725  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0283  RecT family protein  29.91 
 
 		 300 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0811  RecT protein  27.23 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.481078  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4070  RecT protein  31.21 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0866384  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1674  recombinational DNA repair protein (RecE pathway)  25.37 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1003  RecT protein  29.45 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  hitchhiker  0.0000388428 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1139  RecT protein  25.25 
 
 		 329 aa  57  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2078  RecT protein  29.07 
 
 		 306 aa  49.7  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0329  RecT protein  29.07 
 
 		 306 aa  49.7  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0320  RecT protein  29.07 
 
 		 306 aa  49.7  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2041  RecT protein  29.07 
 
 		 306 aa  49.7  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>