More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2214 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  100 
 
 		 402 aa  798    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  100 
 
 		 382 aa  798    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 		 382 aa  798    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  98.69 
 
 		 402 aa  787    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  97.28 
 
 		 387 aa  745    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  99.48 
 
 		 402 aa  792    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  97.12 
 
 		 402 aa  774    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  97.38 
 
 		 402 aa  774    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  97.91 
 
 		 402 aa  784    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  97.12 
 
 		 402 aa  773    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  96.6 
 
 		 402 aa  769    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  100 
 
 		 402 aa  798    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  97.38 
 
 		 402 aa  780    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  97.64 
 
 		 402 aa  778    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  79.79 
 
 		 402 aa  652    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  62.5 
 
 		 400 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  58.21 
 
 		 411 aa  485  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  60.38 
 
 		 403 aa  479  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  59.18 
 
 		 411 aa  476  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  60.5 
 
 		 406 aa  474  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  60.22 
 
 		 403 aa  474  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  60.5 
 
 		 403 aa  474  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  58.49 
 
 		 411 aa  468  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  57.18 
 
 		 411 aa  465  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  57.88 
 
 		 413 aa  465  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  57.69 
 
 		 411 aa  463  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  65.66 
 
 		 399 aa  462  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  56.28 
 
 		 431 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  57.88 
 
 		 348 aa  424  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  57.88 
 
 		 348 aa  424  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  56.66 
 
 		 422 aa  422  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  57.31 
 
 		 348 aa  421  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0649  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  47.42 
 
 		 435 aa  351  1e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  47.35 
 
 		 381 aa  339  5e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  47.08 
 
 		 381 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  43.07 
 
 		 422 aa  335  5.999999999999999e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1058  ISAfe8, transposase  47.42 
 
 		 408 aa  335  5.999999999999999e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19621  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1215  ISAfe8, transposase  46.91 
 
 		 408 aa  333  4e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0668  transposase  57.52 
 
 		 231 aa  278  1e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000294639  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0717  transposase  58.26 
 
 		 219 aa  269  7e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0318714  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1133  transposase, IS605 OrfB  39.01 
 
 		 397 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1324  transposase  39.01 
 
 		 397 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0532148  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5477  IS605 family transposase OrfB  39.02 
 
 		 416 aa  243  5e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.461601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1584  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  39.58 
 
 		 417 aa  241  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.758267 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  38.69 
 
 		 391 aa  233  6e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3319  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  38.64 
 
 		 415 aa  232  8.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  34.4 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5691  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.65 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3509  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.37 
 
 		 398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  34.32 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  38.07 
 
 		 361 aa  210  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1550  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.83 
 
 		 401 aa  210  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.734191  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  37.33 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  37.33 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6840  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.29 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.643066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  36.04 
 
 		 399 aa  207  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2514  transposase, IS605 OrfB family  34.68 
 
 		 383 aa  206  4e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.969916  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6349  transposase  36.66 
 
 		 429 aa  206  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  35.71 
 
 		 424 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0201  IS605 family transposase OrfB  34.17 
 
 		 385 aa  202  7e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000194492  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1159  transposase, IS605 OrfB family  33.6 
 
 		 416 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1563  transposase OrfB  36.36 
 
 		 398 aa  200  3e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.522288  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0659  transposase OrfB  36.36 
 
 		 398 aa  200  3e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4920  transposase, IS607 family  37.5 
 
 		 393 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.287144 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1800  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  37.81 
 
 		 386 aa  199  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31256  normal  0.500943 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3537  transposase, IS605 OrfB family  37.5 
 
 		 393 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0103085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  35.41 
 
 		 410 aa  199  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  35.69 
 
 		 373 aa  199  6e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  34.96 
 
 		 368 aa  199  7e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2259  IS605 family transposase OrfB  36.36 
 
 		 398 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.495382  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3797  IS605 family transposase OrfB  34.57 
 
 		 429 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  35.14 
 
 		 381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  35.71 
 
 		 377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3396  IS605 family transposase OrfB  34.35 
 
 		 385 aa  197  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000848869  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  35.13 
 
 		 373 aa  196  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  35.13 
 
 		 373 aa  196  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  34.95 
 
 		 383 aa  196  7e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  34.65 
 
 		 372 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  34.65 
 
 		 373 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0394  transposase, IS605 OrfB family  32.98 
 
 		 402 aa  195  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2446  IS605 family transposase OrfB  34.41 
 
 		 383 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.327325  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  35.26 
 
 		 410 aa  193  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  32.82 
 
 		 391 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0182  IS605 family transposase OrfB  34.41 
 
 		 383 aa  192  8e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  34.84 
 
 		 372 aa  192  9e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  32.97 
 
 		 370 aa  192  9e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  34.84 
 
 		 372 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  32.82 
 
 		 391 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  34.37 
 
 		 373 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  34.84 
 
 		 372 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4737  IS605 family transposase OrfB  33.52 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  34.37 
 
 		 373 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  34.37 
 
 		 373 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  34.1 
 
 		 383 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2003  IS605 family transposase OrfB  35.28 
 
 		 409 aa  190  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  32.42 
 
 		 370 aa  189  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  32.47 
 
 		 391 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  33.33 
 
 		 405 aa  189  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  36.8 
 
 		 377 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  35.17 
 
 		 375 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>