More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2169 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012892  B21_01448  hypothetical protein  100 
 
 		 336 aa  683    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.153415  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01436  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 336 aa  683    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.146408  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2169  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 		 336 aa  683    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.351204  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1660  alcohol dehydrogenase  99.11 
 
 		 336 aa  674    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2179  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 336 aa  683    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2090  alcohol dehydrogenase  99.11 
 
 		 336 aa  674    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1696  alcohol dehydrogenase  99.11 
 
 		 336 aa  674    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1563  alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 336 aa  683    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1776  alcohol dehydrogenase  92.56 
 
 		 336 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1598  alcohol dehydrogenase  92.56 
 
 		 336 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1681  alcohol dehydrogenase  92.26 
 
 		 336 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.313383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1744  alcohol dehydrogenase  92.56 
 
 		 336 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0707345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1683  alcohol dehydrogenase  92.56 
 
 		 336 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.74438 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1288  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  84.73 
 
 		 336 aa  565  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2984  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  85.93 
 
 		 336 aa  547  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.215293  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3554  alcohol dehydrogenase  85.63 
 
 		 336 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33361 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3839  alcohol dehydrogenase  85.03 
 
 		 336 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1932  alcohol dehydrogenase  85.03 
 
 		 336 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2066  alcohol dehydrogenase  84.73 
 
 		 336 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2403  alcohol dehydrogenase  82.04 
 
 		 337 aa  517  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0643  alcohol dehydrogenase  69.05 
 
 		 336 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0628  alcohol dehydrogenase  69.05 
 
 		 336 aa  469  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2296  alcohol dehydrogenase  68.44 
 
 		 347 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.52857  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2050  alcohol dehydrogenase  67.85 
 
 		 345 aa  464  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0843649  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2293  alcohol dehydrogenase  67.85 
 
 		 345 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000403222 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3075  alcohol dehydrogenase  68.05 
 
 		 345 aa  463  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582004 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2111  alcohol dehydrogenase  67.85 
 
 		 345 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.161911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2048  alcohol dehydrogenase  67.85 
 
 		 345 aa  464  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.892087  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2089  alcohol dehydrogenase  68.14 
 
 		 345 aa  463  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.431747  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2267  alcohol dehydrogenase  67.85 
 
 		 345 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2378  alcohol dehydrogenase  68.14 
 
 		 345 aa  463  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0768  alcohol dehydrogenase  67.55 
 
 		 341 aa  461  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2248  alcohol dehydrogenase  68.05 
 
 		 345 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0562  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  66.77 
 
 		 347 aa  455  1e-127  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0257  alcohol dehydrogenase  69.73 
 
 		 340 aa  453  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1990  alcohol dehydrogenase  63.91 
 
 		 340 aa  432  1e-120  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275067  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0054  alcohol dehydrogenase  66.07 
 
 		 338 aa  430  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000063384  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1496  alcohol dehydrogenase  60.65 
 
 		 342 aa  414  1e-114  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000183073  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0527  alcohol dehydrogenase  55.68 
 
 		 380 aa  368  1e-100  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1919  alcohol dehydrogenase  53.6 
 
 		 350 aa  358  7e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00012122  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  49.25 
 
 		 336 aa  318  7.999999999999999e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21430  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  48.07 
 
 		 343 aa  313  2.9999999999999996e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  49.2 
 
 		 337 aa  309  4e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  49.52 
 
 		 336 aa  309  4e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  47.93 
 
 		 337 aa  305  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2996  alcohol dehydrogenase  47.35 
 
 		 344 aa  302  6.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  46.88 
 
 		 342 aa  298  8e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  45.99 
 
 		 342 aa  297  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  50.16 
 
 		 341 aa  296  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3087  alcohol dehydrogenase  45.1 
 
 		 340 aa  296  4e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2787  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.4 
 
 		 340 aa  295  6e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0147345 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  46.61 
 
 		 342 aa  295  9e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  48.4 
 
 		 340 aa  295  1e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4330  alcohol dehydrogenase  47.13 
 
 		 342 aa  292  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0511391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5867  alcohol dehydrogenase  46.82 
 
 		 342 aa  291  8e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.74196  normal  0.798449 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3928  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  46.82 
 
 		 342 aa  291  9e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4438  alcohol dehydrogenase  46.82 
 
 		 342 aa  291  9e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  48.08 
 
 		 342 aa  290  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  48.22 
 
 		 342 aa  289  4e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0720  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.99 
 
 		 342 aa  288  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.597384 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  44.81 
 
 		 341 aa  287  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5870  alcohol dehydrogenase  44.81 
 
 		 341 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.801122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  45.1 
 
 		 344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  46.79 
 
 		 342 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.51 
 
 		 342 aa  286  5e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  46.45 
 
 		 341 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1872  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  43.92 
 
 		 341 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  45.56 
 
 		 347 aa  285  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  45.83 
 
 		 342 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  46.47 
 
 		 342 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0132  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  46.13 
 
 		 341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1300  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  46.13 
 
 		 341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2642  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  46.13 
 
 		 357 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0311111  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0157  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  46.13 
 
 		 341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0028  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.29 
 
 		 342 aa  283  3.0000000000000004e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0233433  decreased coverage  0.000000000133046 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  46.13 
 
 		 341 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  46.13 
 
 		 341 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  45.1 
 
 		 341 aa  281  9e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  44.73 
 
 		 344 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  42.31 
 
 		 342 aa  280  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  43.92 
 
 		 344 aa  278  8e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  43.62 
 
 		 343 aa  278  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  44.71 
 
 		 344 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.305861 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf738  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  43.77 
 
 		 350 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  43.32 
 
 		 343 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0581  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.37 
 
 		 368 aa  272  6e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3870  alcohol dehydrogenase  47.45 
 
 		 338 aa  272  6e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  42.81 
 
 		 344 aa  272  7e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  43.32 
 
 		 348 aa  271  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  44.27 
 
 		 344 aa  271  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  42.23 
 
 		 344 aa  268  8.999999999999999e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  42.23 
 
 		 344 aa  268  8.999999999999999e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2945  zinc-binding alcohol dehydrogenase  42.9 
 
 		 336 aa  267  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4434  alcohol dehydrogenase  44.81 
 
 		 341 aa  266  4e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.660571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.25 
 
 		 336 aa  263  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0752  alcohol dehydrogenase  45.1 
 
 		 341 aa  259  7e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027127  normal  0.0151897 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0931  alcohol dehydrogenase GroES domain protein  46.88 
 
 		 339 aa  250  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00710  mannitol-1-phosphate dehydrogenase, putative  40.62 
 
 		 361 aa  212  7e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.797192  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00600  mannitol-1-phosphate dehydrogenase, putative  38.81 
 
 		 422 aa  206  5e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.01 
 
 		 335 aa  202  6e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>