291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2103 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  98.35 
 
 
486 aa  989    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  100 
 
 
486 aa  1008    Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  98.15 
 
 
486 aa  991    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  81.48 
 
 
488 aa  827    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  70.3 
 
 
490 aa  686    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  97.94 
 
 
486 aa  988    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  98.35 
 
 
486 aa  989    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  81.07 
 
 
488 aa  820    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  80.66 
 
 
488 aa  817    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  64.84 
 
 
488 aa  649    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  98.35 
 
 
486 aa  991    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  98.35 
 
 
486 aa  993    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  64.84 
 
 
488 aa  643    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  71.58 
 
 
490 aa  687    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  81.28 
 
 
488 aa  825    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  98.15 
 
 
486 aa  990    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  78.31 
 
 
487 aa  803    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  98.56 
 
 
486 aa  994    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  81.28 
 
 
488 aa  825    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  63.41 
 
 
490 aa  624  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  58.06 
 
 
493 aa  580  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  56.55 
 
 
497 aa  575  1.0000000000000001e-163  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  57.64 
 
 
490 aa  571  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  57.64 
 
 
490 aa  571  1e-161  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  55.93 
 
 
498 aa  559  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  58.26 
 
 
486 aa  552  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  58.26 
 
 
486 aa  551  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  58.26 
 
 
486 aa  553  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  57.84 
 
 
486 aa  549  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  58.05 
 
 
486 aa  548  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  58.05 
 
 
486 aa  550  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  57.84 
 
 
486 aa  549  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  54.15 
 
 
487 aa  548  1e-155  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  58.26 
 
 
486 aa  551  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  54.74 
 
 
488 aa  547  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  54.96 
 
 
488 aa  546  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  55.17 
 
 
488 aa  547  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  54.53 
 
 
488 aa  545  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  54.53 
 
 
488 aa  545  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  54.53 
 
 
488 aa  544  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  54.53 
 
 
488 aa  545  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  54.53 
 
 
488 aa  544  1e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  57.11 
 
 
490 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  56.91 
 
 
490 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  56.91 
 
 
490 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  57.11 
 
 
490 aa  541  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  56.7 
 
 
490 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  54.16 
 
 
488 aa  536  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  54.2 
 
 
495 aa  533  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  53.99 
 
 
495 aa  531  1e-149  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1507  D-mannonate oxidoreductase  59.29 
 
 
452 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  50.42 
 
 
493 aa  451  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3426  D-mannonate oxidoreductase  47.26 
 
 
490 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00156108 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3245  D-mannonate oxidoreductase  47.47 
 
 
490 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3329  D-mannonate oxidoreductase  47.47 
 
 
490 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.824696  normal  0.499886 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3321  D-mannonate oxidoreductase  47.47 
 
 
490 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3302  mannitol dehydrogenase  49.36 
 
 
490 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.059304 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  43.74 
 
 
492 aa  423  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  47.71 
 
 
486 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0789  mannitol dehydrogenase family protein  55.22 
 
 
358 aa  402  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000484963  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  46.87 
 
 
489 aa  405  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  44.79 
 
 
497 aa  392  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4352  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  45.57 
 
 
484 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000397508 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  43.59 
 
 
485 aa  382  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  44.8 
 
 
493 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  49.42 
 
 
455 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  49.42 
 
 
464 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  43.69 
 
 
492 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4022  Mannitol dehydrogenase domain  45.14 
 
 
485 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.5 
 
 
497 aa  368  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.903405  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  46.87 
 
 
459 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  45.77 
 
 
478 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  44.44 
 
 
510 aa  355  1e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  42.86 
 
 
496 aa  355  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0300  Mannitol dehydrogenase domain  41.75 
 
 
497 aa  354  2e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.781691  normal  0.116256 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.33 
 
 
494 aa  350  4e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.01 
 
 
505 aa  346  5e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  40 
 
 
491 aa  345  7e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  42.24 
 
 
490 aa  344  2e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.32 
 
 
493 aa  342  7e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3866  fructuronate reductase  40.33 
 
 
471 aa  341  2e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.154848 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4205  Mannitol dehydrogenase domain  42.2 
 
 
520 aa  341  2e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  42.24 
 
 
499 aa  340  5e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  39.96 
 
 
497 aa  338  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  40.71 
 
 
497 aa  338  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2636  mannitol dehydrogenase  39.13 
 
 
490 aa  333  4e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  41.68 
 
 
505 aa  333  5e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  39.14 
 
 
493 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1282  Mannitol dehydrogenase domain protein  42.83 
 
 
528 aa  330  3e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.91311  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  39.38 
 
 
491 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  38.2 
 
 
491 aa  330  4e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3741  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  61.45 
 
 
263 aa  330  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  38.73 
 
 
493 aa  329  6e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  39.34 
 
 
491 aa  329  8e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  44.5 
 
 
489 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  44.5 
 
 
489 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  44.5 
 
 
489 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  40.98 
 
 
491 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  44.5 
 
 
489 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  44.5 
 
 
489 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>